mNGS zur Therapie von Harnwegsinfektionskrankheiten (PGS-U-UTI&UC)

Harnwegsinfektionen sind eine häufige Infektionskrankheit in der Klinik. Harnwegsinfektionen werden leicht durch abnormale Struktur und Funktion des Harnsystems, schwache Immunität, Schwangerschaft, Geschlecht und sexuelle Aktivität sowie iatrogene Faktoren verursacht. Harnwegsinfektionen weisen ein breites Spektrum pathogener Mikroorganismen auf, darunter gramnegative Bazillen, grampositive Kokken, Pilze, Mykoplasmen, Chlamydien, Viren und so weiter. Obwohl eine Harnwegsinfektion anfänglich durch klinische Anzeichen und Symptome, Anzeichen und Urinroutine diagnostiziert werden kann, hängt die Anwendung einer geeigneten Antibiotikatherapie von der weiteren Identifizierung von Krankheitserregern ab. Gegenwärtig wird es häufig verwendet, um Mittelstrahlurin für die Kultivierung von Krankheitserregern in der Klinik zu sammeln, es hat jedoch den Nachteil, dass es zeitaufwändig und eine geringe Nachweisrate hat und die Verwendung von Antibiotika die Ergebnisse der Kultivierung beeinträchtigen kann.

Die metagenomische Sequenzierung ist in der klinischen Erregerdiagnostik, insbesondere bei schwierigen Infektionskrankheiten, weit verbreitet. Sein Prinzip besteht darin, Proben zu sammeln, mNGS zu verwenden, um die Proben vor der Sequenzierung zu verarbeiten, die Nukleinsäure freizulegen, die Nukleinsäuresequenz von Krankheitserregern mit der ausgewiesenen riesigen biologischen Datenbank zu vergleichen und den umfassenden Nachweis von Viren, Bakterien, Pilzen, Parasiten und Atypischen zu realisieren Mikroorganismen. Im Vergleich zu Gewebeproben, Liquor, bronchoalveolärer Lavageflüssigkeit, Vollblut und anderen Proben ist die Anwendung von mNGS in Urinproben relativ eingeschränkt, da falsche Probenahmemethoden vor und nach der Entnahme von Urinproben leicht zu einer Kontamination der Proben und der distalen Besiedelung führen Harnröhre, periurethrale Haut und Vagina beeinträchtigen die Interpretation der Berichte. Allerdings hat mNGS offensichtliche Vorteile in der klinischen Diagnose, mit hoher Spezifität und Genauigkeit und kürzerer Nachweiszeit als herkömmliche Kultur. In Bezug auf Mischinfektionen ist die Nachweisrate mehrerer Pathogene aufgrund ihrer Unvoreingenommenheit höher als die von herkömmlichen Kultur-, Abstrich-, PCR- und anderen Tests, die andere Pathogene und sogar seltene Pathogene nachweisen können, die konventionell nicht nachgewiesen werden können .

Frühere Studien mit kleinen Stichproben haben gezeigt, dass die Sensitivität von mNGS bei Harnwegsinfektionen hoch, aber die Spezifität relativ gering ist, und es gibt viele Probleme, wie z. B. eine schwierige Interpretation von Berichten und eine geringe klinische Konformität. Beispielsweise gibt es viele Krankheitserreger mit hohem Messwert, und die Testergebnisse werden zu einer Liste von Krankheitserregern sortiert, aber es ist unmöglich festzustellen, welche oder welche Krankheitserreger pathogen sind. Dies hängt eng mit dem Algorithmus der mNGS-Technologie zusammen, wie z. B. die Unfähigkeit, den Einfluss von Hintergrundbakterien im Harnsystem zu eliminieren, und die Mehrdeutigkeit des kurzen Sequenzabgleichs, was die Unterscheidung homologer Pathogene erschwert.

In dieser Studie, basierend auf dem Standard-mNGS-Sequenzierungsprozess, wurde die verbesserte Z-Wert-Analysemethode verwendet, um strikt aufgenommene klinische Proben auszuwählen und sie mit der Pathogenkultur zu vergleichen, um den klinischen Wert von mNGS mit der Z-Wert-Analysemethode bei der Behandlung von Harnwegen zu beobachten Infektion.