mNGS 用于治疗泌尿系统感染性疾病 (PGS-U-UTI&UC)

尿路感染是临床常见的感染性疾病。 泌尿系感染易由泌尿系统结构和功能异常、免疫力低下、妊娠、性别和性活动以及医源性因素引起。 尿路感染的病原微生物范围很广，包括革兰氏阴性杆菌、革兰氏阳性球菌、真菌、支原体、衣原体、病毒等。 尿路感染虽然可根据临床体征、体征和尿常规初步诊断，但是否应用适当的抗生素治疗还需对病原体进行进一步鉴定。 目前临床常用收集中流尿液进行病原体培养，但存在耗时长、检出率低、使用抗生素会影响培养结果等缺点。

宏基因组测序已广泛应用于临床病原体诊断，尤其是疑难传染病。 其原理是采集样本，利用mNGS对样本进行测序前处理，暴露核酸，将病原体核酸序列与指定的庞大生物数据库进行比对，实现病毒、细菌、真菌、寄生虫和非典型的综合检测。微生物。 与组织样本、脑脊液、支气管肺泡灌洗液、全血等样本相比，mNGS在尿液样本中的应用相对有限，因为尿液样本采集前后的采样方法不正确，容易污染样本，远端定植。尿道、尿道周围皮肤和阴道会干扰报告的解读。 然而，mNGS在临床诊断中具有明显的优势，特异性和准确性高，检测时间比传统培养短。 在混合感染方面，由于其无偏倚性，对多种病原体的检出率高于常规培养、涂片、PCR等检测，可以检测出其他病原体，甚至是常规检测不到的罕见病原体.

以往的小样本研究表明，mNGS在尿路感染中的敏感性高，但特异性相对较低，存在报告解读困难、临床依从性低等诸多问题。 比如读数高的病原体很多，将检测结果排序形成病原体列表，但无法确定哪些或哪些病原体是致病的。 这与mNGS技术算法密切相关，如无法排除泌尿系统背景细菌的影响，短序列比对的模糊性，导致难以区分同源病原体。

本研究在标准mNGS测序流程的基础上，采用改进的Z值分析方法，选取严格入组的临床样本，并与病原体培养物进行比较，观察采用Z值分析方法的mNGS治疗泌尿系疾病的临床价值。感染。