비뇨기 감염 질환 치료를 위한 mNGS (PGS-U-UTI&UC)

요로 감염은 병원에서 흔히 볼 수 있는 전염병입니다. 요로감염은 비뇨기계의 비정상적인 구조와 기능, 낮은 면역력, 임신, 성별 및 성행위, 의원성 요인에 의해 쉽게 발생합니다. 요로 감염에는 그람 음성 간균, 그람 양성 구균, 곰팡이, 마이코플라스마, 클라미디아, 바이러스 등 광범위한 병원성 미생물이 있습니다. 요로 감염은 초기에 임상 징후 및 증상, 징후 및 소변 습관으로 진단할 수 있지만 적절한 항생제 치료의 적용은 병원체의 추가 식별에 달려 있습니다. 현재 임상에서 병원체 배양을 위한 중류뇨 채취에 흔히 사용되고 있으나 시간이 오래 걸리고 검출률이 낮다는 단점과 항생제 사용이 배양 결과에 영향을 줄 수 있다는 단점이 있다.

Metagenomic 시퀀싱은 임상 병원체 진단, 특히 어려운 전염병에서 널리 사용되었습니다. 그 원리는 샘플을 수집하고, mNGS를 사용하여 시퀀싱 전에 샘플을 처리하고, 핵산을 노출하고, 지정된 거대한 생물학적 데이터베이스와 병원체의 핵산 시퀀스를 비교하고, 바이러스, 박테리아, 곰팡이, 기생충 및 비정형의 포괄적인 탐지를 실현하는 것입니다. 미생물. 조직 샘플, 뇌척수액, 기관지 폐포 세척액, 전혈 및 기타 샘플과 비교할 때, 소변 샘플 수집 전후에 잘못된 샘플링 방법이 샘플을 오염시키고 원위부 콜로니 화되기 쉽기 때문에 소변 샘플에서 mNGS의 적용은 상대적으로 제한적입니다. 요도, 요도주위 피부 및 질은 보고서 해석을 방해합니다. 그러나 mNGS는 임상 진단에서 특이성과 정확도가 높고 기존 배양보다 검출 시간이 짧다는 분명한 이점이 있습니다. 혼합 감염의 측면에서는 편향성이 없기 때문에 기존의 배양, 도말, PCR 및 기타 검사에 비해 다중 병원체의 검출률이 높아 다른 병원체와 기존에 검출할 수 없었던 희귀 병원체까지 검출할 수 있습니다. .

이전의 소규모 표본 연구에서는 요로 감염에서 mNGS의 민감도는 높으나 특이도가 상대적으로 낮고 보고 해석이 어렵고 임상적 적합도가 낮은 등 문제점이 많다. 예를 들어, 판독값이 높은 병원체가 많고 검사 결과를 분류하여 병원체 목록을 형성하지만 어떤 병원체가 병원성인지 판단하는 것은 불가능합니다. 이는 요로계 배경세균의 영향을 제거하지 못하는 점, 짧은 염기서열 정렬의 모호성 등 mNGS 기술 알고리즘과 밀접한 관련이 있어 상동 병원체를 구분하기 어렵다.

본 연구에서는 표준 mNGS 시퀀싱 프로세스를 기반으로 개선된 Z 값 분석 방법을 사용하여 엄격하게 등록된 임상 샘플을 선택하고 병원균 배양과 비교하여 요로 치료에서 Z 값 분석 방법으로 mNGS의 임상적 가치를 관찰했습니다. 전염병.