Microbiome intestinal et dépression

Notre hypothèse générale est qu'un microbiome intestinal spécifique ou des métabolites dérivés de l'intestin sont associés à la dépression dans le pwMS. Mécaniquement, les chercheurs émettent en outre l'hypothèse que la dépression dans le pwMS est liée à une diminution de l'abondance des bactéries intestinales ayant des activités productrices de GABA et/ou des propriétés anti-inflammatoires.

BUT 1. Déterminer si la présence de dépression dans la SEPp est associée à un microbiome intestinal spécifique, à des métabolites dérivés de l'intestin ou à des profils immunitaires du sang périphérique.

Les enquêteurs réaliseront une étude transversale chez des patients atteints de SEP cliniquement stable recrutés au John L. Trotter MS Center. Les chercheurs évalueront la présence de dépression à l'aide de l'échelle de dépression de la qualité de vie dans les troubles neurologiques (Neuro-Qol), l'une des 13 échelles du Neuro-Qol récemment développée par le NIH à l'aide de techniques psychométriques modernes et validée dans la SEP. Un total de 120 pwMS seront recrutés : 60 avec et 60 sans dépression selon l'échelle de dépression Neuro-Qol. Lors de la visite d'étude, chaque participant sera invité à fournir un échantillon de selles pour les analyses du microbiome et un échantillon de sang pour l'immunophénotypage du sang périphérique. Les facteurs de confusion potentiels seront recueillis et traités comme des covariables dans les analyses. Ceux-ci incluent : 1) le degré d'invalidité (EDSS) ; 2) un traitement avec des antidépresseurs et des DMT ; 3) un journal alimentaire de 4 jours pour évaluer la composition du régime alimentaire ; 4) la vue et la taille de l'investigateur pour calculer l'IMC ; 5) fatigue ; 6) niveau d'activité physique ; 7) qualité du sommeil.

BUT 1A. Déterminer si la dépression sera corrélée avec des profils spécifiques de microbiome intestinal ou de métabolites dérivés de l'intestin dans le pwMS.

Des échantillons de selles seront traités pour le séquençage du microbiome et la caractérisation du métabolome.

BUT 1B. Déterminer si la dépression sera corrélée à un profil immuno-inflammatoire spécifique du sang périphérique dans le pwMS.

Un échantillon de sang périphérique sera obtenu de chaque participant pour effectuer : 1) le phénotypage des cellules immunitaires du sang périphérique afin de caractériser les principaux sous-ensembles de cellules immunitaires et leur activation ; 2) production intracellulaire de cytokines pour étudier les profils de production de cytokines des lymphocytes et des monocytes sanguins.

OBJECTIF 2. Quantifier la production de GABA dans le pwMS avec ou sans dépression et déterminer l'interaction microbiome intestinal-système immunitaire in vitro.

Dans cet objectif, les chercheurs réaliseront des études fonctionnelles pour évaluer le potentiel du microbiote intestinal de la SEP avec ou sans dépression à produire du GABA et à moduler les réponses immuno-inflammatoires.

BUT 2A. Pour quantifier les niveaux de GABA dans les selles entières, les isolats bactériens spécifiques des selles et le sang des pwMS avec ou sans dépression.

Les enquêteurs évalueront les niveaux de GABA dans les selles et le sang des pwMS. De plus, les chercheurs mesureront la production de GABA par Bacteroides ssp isolé du microbiote intestinal de pwMS.

Objectif 2B. Évaluer les effets des selles entières et des espèces bactériennes spécifiques de la SPEP sur le phénotype des cellules immunitaires sanguines et la production de cytokines.

Les chercheurs testeront comment le microbiome intestinal entier ou des bactéries spécifiques (identifiées dans l'objectif 1 comme étant associées à la dépression dans le pwMS) peuvent moduler la fonction des cellules immunitaires. Les cellules mononucléaires du sang périphérique (PBMC) provenant de donneurs sains seront cultivées dans des milieux de conditionnement à partir de selles entières ou de bactéries d'intérêt isolées de pwMS. Le phénotype des PBMC et la production de cytokines après exposition in vitro seront caractérisés par cytométrie en flux.