Caractérisation des biomarqueurs protéiques du syndrome du côlon irritable post-infectieux

Les enquêteurs caractériseront et compareront les signatures protéiques entre les groupes avec et sans syndrome du côlon irritable post-infection (PI-IBS). Parmi les précédents participants au projet Healthy Nevada (HNP), au moins 60 patients atteints de PI-IBS et 60 témoins sains subiront des tests protéomiques supplémentaires, en fonction de l'âge, du sexe et de la race/origine ethnique. Les enquêteurs utiliseront des tests protéomiques pour détecter, quantifier et caractériser les biomarqueurs des protéines sériques et les signatures protéiques, et comparer les biomarqueurs et les signatures entre les groupes de patients d'intérêt. Les échantillons de sérum seront analysés par le Nevada Proteomics Center. Les échantillons subiront d'abord une digestion des protéines, puis les peptides seront séparés par chromatographie liquide (LC), l'analyse spectrale de masse est effectuée à l'aide d'un spectromètre de masse Orbitrap Eclipse (Thermo Scientific, San Jose, CA) en utilisant une acquisition indépendante des données (DIA). La génération de bibliothèques et l'analyse des données seront effectuées à l'aide du logiciel Spectronaut (Biognosys, Schlieren, Suisse). Le Nevada Proteomics Center et le Bioinformatics Center seront impliqués lors des analyses de données comparant les biomarqueurs et les signatures entre les groupes de patients d'intérêt. Cet objectif de recherche a le potentiel d’améliorer notre compréhension des mécanismes sous-jacents du PI-IBS et de créer des biomarqueurs protéiques de différenciation fiables pour mieux diagnostiquer le PI-IBS.