Effets de la consommation de probiotiques chez les enfants atteints de troubles du spectre autistique (TSA)

Les troubles du spectre autistique (TSA) sont un groupe d'anomalies neurodéveloppementales qui débutent dès la petite enfance et sont fréquemment caractérisées par des problèmes de communication et de comportement social. Les métabolites produits par le microbiome intestinal peuvent affecter les fonctions du tractus gastro-intestinal (Gl) et du système nerveux central (SNC) soutenant la présence de l’axe intestin-cerveau. Des études antérieures ont démontré des changements dans le microbiome intestinal chez les enfants atteints de TSA par rapport aux témoins neurotypiques. Il est possible que des modifications alimentaires, y compris l'utilisation de probiotiques, chez les enfants atteints de TSA modifient positivement les fonctions de la Gl et du SNC. Peu d’études cliniques ont été réalisées pour évaluer les effets de la consommation de probiotiques par les enfants atteints de TSA sur leur composition microbiote, leur fonction intestinale et leur comportement dans les pays en développement. Par conséquent, l'objectif général de l'étude est de déterminer les effets de la supplémentation en probiotiques sur la composition du microbiote intestinal, l'état nutritionnel et l'état immunitaire chez les enfants atteints de TSA.

Une étude croisée randomisée sera menée auprès d'enfants diagnostiqués avec TSA, vivant dans le district métropolitain de Quito. Après avoir vérifié les critères d'inclusion et d'exclusion, 66 participants seront sélectionnés. Dans un premier temps, les enfants diagnostiqués avec TSA seront organisés au hasard en 2 groupes. Le groupe A (n = 33) recevra des suppléments de Sb à la dose de 250 mg 3 fois par jour pendant une période de 4 mois. Alors que le groupe B (n = 33) ne recevra pas de supplémentation pendant 4 mois. Cela sera suivi d'une période de « sevrage » de 30 jours, pendant laquelle aucun des deux groupes ne consomme de probiotiques. Passé ce délai, les groupes d'enfants changeront de traitement pendant encore quatre mois. Les enquêteurs analyseront le comportement, le microbiome intestinal, le métabolome, l'état nutritionnel et les symptômes gastro-intestinaux pour déterminer les changements provoqués par la consommation de Sb. Les participants seront suivis aux mois 1, 4, 5, 9 et 10 de l'étude. A chaque suivi, des échantillons de selles, de sang et d'urine seront prélevés pour les différentes analyses.

Une enquête sociodémographique sera appliquée pour déterminer les paramètres épidémiologiques des participants. Les paramètres comportementaux de chaque enfant seront évalués au moyen d'évaluations psychologiques. Les tests qui seront appliqués sont : le calendrier d'observation du diagnostic de l'autisme, deuxième édition (ADOS-2) ; Entretien de diagnostic de l'autisme révisé (ADI-R); Échelle d'intelligence Wechsler pour les enfants (WISC); Système d'évaluation adaptative du comportement (ABAS); Échelle d'intelligence préscolaire et primaire Wechsler (WPPSI); Inventaire de développement de Battelle (BATELLE). Pour l'évaluation de l'état nutritionnel, des mesures anthropométriques (poids, taille, IMC) seront prises et les percentiles et les scores Z seront calculés. De plus, un questionnaire de rappel de 24 heures sera appliqué. Le test Roma IV sera appliqué pour évaluer les symptômes gastro-intestinaux. Pour déterminer l'état immunologique, les enquêteurs mesureront les interleukines et les facteurs de croissance dans le sang.

Concernant l'analyse du microbiote intestinal, les enquêteurs commenceront par l'extraction d'ADN à partir d'échantillons de selles. Toutes les séquences brutes obtenues à partir du séquenceur Illumina seront analysées pour déterminer : la composition taxonomique, la diversité alpha et bêta, l'annotation fonctionnelle et l'abondance relative microbienne différentielle entre les deux groupes. L'annotation fonctionnelle sera effectuée à l'aide du logiciel Unified Metabolic Analysis Network (HumanN) du Human Microbiome Project. L'attribution taxonomique sera effectuée à l'aide du logiciel d'analyse phylogénétique métagénomique (Metaphlan). Les mesures de diversité seront calculées à l’aide du package Vegan Diversity R. Pour comparer l'analyse de la diversité alpha, l'indice de Chao 1, Shannon et Simpson sera calculé. Pour la comparaison de la diversité bêta, la fonction Analyse des données écologiques (ade4) du package R sera utilisée pour générer une analyse des composantes principales à l'aide des mesures de distance Bray-Curtis, Jaccard, Unifrac non pondérée et Unifrac pondérée. L'analyse discriminante linéaire sera utilisée en conjonction avec le test de mesure de l'effet sur la taille de l'échantillon (LEfSe) pour effectuer une analyse différentielle de l'abondance relative microbienne entre les deux groupes.

Les enquêteurs effectueront une analyse du métabolome sur du sang, des échantillons fécaux et de l'urine. L'attribution du métabolome se fera par des expériences 2D basées sur le signal en résonance magnétique nucléaire du proton (RMN-H), en utilisant la base de données du métabolome humain et la base de données du métabolome de résonance magnétique biologique.