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Epigenetic Determinants of Peritoneal Fibrosis

3 marzo 2020 aggiornato da: Peter Margetts, McMaster University
Peritoneal dialysis (PD) is a type of kidney replacement therapy for patients with chronic kidney disease where the peritoneal membrane is used to filter the blood. Exposure to PD fluid results in scarring of the peritoneal membrane and increased blood vessel growth. This condition can progress even when peritoneal dialysis is stopped. Therefore, the investigators hypothesize glucose in the dialysis fluid may result in DNA modifications called epigenetic changes. These changes modify how genes are expressed and how cells function. The investigators want to study these epigenetic changes and the effect on peritoneal membrane scarring, blood vessel growth and peritoneal membrane function.

Panoramica dello studio

Stato

Completato

Condizioni

Descrizione dettagliata

There is considerable evidence that epigenetic changes in effector cells underlie the progressive nature of fibrogenic diseases. The investigators have developed an ex-vivo mesothelial cell culture system based on work by Aroeira and colleagues. Ex vivo cell cultures were treated with the DNA methyltransferase inhibitor 5-AZA for 72 hours. Overall, the investigators found that 11 of 14 patients' cells showed an increase in the E-Cad/alpha-SMA ratio with treatment to 5-AZA, indicating a return to a more epithelial-like phenotype and supporting an epigenetic mechanism of progressive fibrosis. The investigators hope to identify DNA methylation patterns associated with glucose exposure and peritoneal membrane solute transport in PD patients.

The investigators will take the peritoneal effluent from an overnight dwell from patients within one month of initiation of dialysis. The overnight effluent is centrifuged and the pellet is washed and cells are grown in DMEM medium. At confluence, cells are passaged into 2 flasks then taken for DNA and RNA. At 12 months, a second overnight peritoneal effluent sample will be obtained. The investigators will also gather demographic data (patient's age, diabetes, occurrence of peritonitis, cumulative PD prescription including total glucose exposure, use of icodextrin, and the results of a peritoneal equilibrium test carried out for clinical purposes between 3 and 12 months from the start of peritoneal dialysis). The investigators will use whole genome DNA methylation analysis to assess epigenetic changes in mesothelial cells from incident PD patients.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Effettivo)

58

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Luoghi di studio

  • Canada
    • Ontario
      • Hamilton, Ontario, Canada, L8N 4A6
        • St. Joseph's Healthcare

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

18 anni e precedenti (Adulto, Adulto più anziano)

Accetta volontari sani

No

Sessi ammissibili allo studio

Tutto

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

Patients with end stage renal disease recently started on peritoneal dialysis. Patients will be over the age of 18.

Descrizione

Inclusion Criteria:

  • Patients with end stage renal disease recently started on peritoneal dialysis. Patients will be over the age of 18.

Exclusion Criteria:

-

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
DNA methylation pattern
Lasso di tempo: 12 months
DNA methylation pattern will be measured after 12 months of glucose exposure compared with a baseline sample. Gene expression will be measured by Genome wide methylation analysis. In the incident patients, a within-subject analysis will be carried out between the naive and 12 month cell culture sample. Gene expression analysis will be performed with the statistical software R and "BioConductor", a collection of tools for gene expression analysis. Gene-level summaries from Human HT-12 BeadChip data will be generated using the widely used Bioconductor package lumi, which includes background correction, variance stabilization and normalization of expression data. The Linear Models for Microarray Analysis (LIMMA) package of Bioconductor will be used for differential expression analysis.
12 months

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
DNA methylation and solute transport
Lasso di tempo: 12 months
The investigators will correlate changes in DNA methylation with solute transport measured by a peritoneal equilibrium test and peritoneal glucose exposure. Solute transport is calculated from the dialysate to plasma creatinine ratio which is obtained from the peritoneal equilibrium test.
12 months

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Sponsor

McMaster University

Investigatori

  • Investigatore principale: Peter J Margetts, MD PhD, McMaster University

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio

1 settembre 2015

Completamento primario (Effettivo)

1 dicembre 2018

Completamento dello studio (Effettivo)

1 dicembre 2018

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

30 luglio 2015

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

30 luglio 2015

Primo Inserito (Stima)

31 luglio 2015

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

4 marzo 2020

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

3 marzo 2020

Ultimo verificato

1 marzo 2020

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Parole chiave

Termini MeSH pertinenti aggiuntivi

Altri numeri di identificazione dello studio

  • 14CECPDNA1006

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

NO

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