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Epigenetic Determinants of Peritoneal Fibrosis

3. März 2020 aktualisiert von: Peter Margetts, McMaster University
Peritoneal dialysis (PD) is a type of kidney replacement therapy for patients with chronic kidney disease where the peritoneal membrane is used to filter the blood. Exposure to PD fluid results in scarring of the peritoneal membrane and increased blood vessel growth. This condition can progress even when peritoneal dialysis is stopped. Therefore, the investigators hypothesize glucose in the dialysis fluid may result in DNA modifications called epigenetic changes. These changes modify how genes are expressed and how cells function. The investigators want to study these epigenetic changes and the effect on peritoneal membrane scarring, blood vessel growth and peritoneal membrane function.

Studienübersicht

Status

Abgeschlossen

Bedingungen

Detaillierte Beschreibung

There is considerable evidence that epigenetic changes in effector cells underlie the progressive nature of fibrogenic diseases. The investigators have developed an ex-vivo mesothelial cell culture system based on work by Aroeira and colleagues. Ex vivo cell cultures were treated with the DNA methyltransferase inhibitor 5-AZA for 72 hours. Overall, the investigators found that 11 of 14 patients' cells showed an increase in the E-Cad/alpha-SMA ratio with treatment to 5-AZA, indicating a return to a more epithelial-like phenotype and supporting an epigenetic mechanism of progressive fibrosis. The investigators hope to identify DNA methylation patterns associated with glucose exposure and peritoneal membrane solute transport in PD patients.

The investigators will take the peritoneal effluent from an overnight dwell from patients within one month of initiation of dialysis. The overnight effluent is centrifuged and the pellet is washed and cells are grown in DMEM medium. At confluence, cells are passaged into 2 flasks then taken for DNA and RNA. At 12 months, a second overnight peritoneal effluent sample will be obtained. The investigators will also gather demographic data (patient's age, diabetes, occurrence of peritonitis, cumulative PD prescription including total glucose exposure, use of icodextrin, and the results of a peritoneal equilibrium test carried out for clinical purposes between 3 and 12 months from the start of peritoneal dialysis). The investigators will use whole genome DNA methylation analysis to assess epigenetic changes in mesothelial cells from incident PD patients.

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Tatsächlich)

58

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

    • Ontario
      • Hamilton, Ontario, Kanada, L8N 4A6
        • St. Joseph's Healthcare

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

18 Jahre und älter (Erwachsene, Älterer Erwachsener)

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Studienberechtigte Geschlechter

Alle

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

Patients with end stage renal disease recently started on peritoneal dialysis. Patients will be over the age of 18.

Beschreibung

Inclusion Criteria:

  • Patients with end stage renal disease recently started on peritoneal dialysis. Patients will be over the age of 18.

Exclusion Criteria:

-

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
DNA methylation pattern
Zeitfenster: 12 months
DNA methylation pattern will be measured after 12 months of glucose exposure compared with a baseline sample. Gene expression will be measured by Genome wide methylation analysis. In the incident patients, a within-subject analysis will be carried out between the naive and 12 month cell culture sample. Gene expression analysis will be performed with the statistical software R and "BioConductor", a collection of tools for gene expression analysis. Gene-level summaries from Human HT-12 BeadChip data will be generated using the widely used Bioconductor package lumi, which includes background correction, variance stabilization and normalization of expression data. The Linear Models for Microarray Analysis (LIMMA) package of Bioconductor will be used for differential expression analysis.
12 months

Sekundäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
DNA methylation and solute transport
Zeitfenster: 12 months
The investigators will correlate changes in DNA methylation with solute transport measured by a peritoneal equilibrium test and peritoneal glucose exposure. Solute transport is calculated from the dialysate to plasma creatinine ratio which is obtained from the peritoneal equilibrium test.
12 months

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Ermittler

  • Hauptermittler: Peter J Margetts, MD PhD, McMaster University

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn

1. September 2015

Primärer Abschluss (Tatsächlich)

1. Dezember 2018

Studienabschluss (Tatsächlich)

1. Dezember 2018

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

30. Juli 2015

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

30. Juli 2015

Zuerst gepostet (Schätzen)

31. Juli 2015

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

4. März 2020

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

3. März 2020

Zuletzt verifiziert

1. März 2020

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)

Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?

NEIN

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Klinische Studien zur Peritoneale Fibrose

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