小児細菌性髄膜炎における次世代シーケンシング技術の応用
調査の概要
詳細な説明
化膿性髄膜炎としても知られる細菌性髄膜炎は、さまざまな細菌感染によって引き起こされます。 インフルエンザ菌b型（Hib）、肺炎連鎖球菌（S. pneumoniae）、髄膜炎菌（N. 髄膜炎)、細菌性髄膜炎は、世界中の新生児と子供の死亡率と罹患率の重要な原因であり続けています。 細菌性髄膜炎の原因となる病原体は、患者の年齢や素因によって異なります。
病原体の同定は、細菌性髄膜炎にとって最も重要です。 現在、細菌性髄膜炎の病原体は依然として主にグラム染色と細菌培養に基づいています。 しかし、CSF 検査の前に抗生物質治療を受けた小児では、CSF 培養は陰性である可能性があります。 臨床微生物学では、マルチプレックス PCR やラテックス凝集法などの非培養法が使用されてきましたが、これらの種類の技術で標的とすることができる特定の病原体は 1 つまたは複数にすぎず、まれな病原体は言うまでもありません。
近年、強力な NGS 技術の出現により、ターンアラウンド タイムが短いため、生物学的サンプルの偏りのない配列決定が可能になりました。 Wilsonらは、ニューロレプトスピラ症の症例を発表し、偏りのないNGS技術によってCSF中のレプトスピラ感染を特定した後、静脈内ペニシリンで劇的な臨床的改善をもたらしました。 公平な NGS は、理論的には単一のアッセイですべての潜在的な病原体の識別を容易にすることができます。 単純ヘルペスウイルス1、単純ヘルペスウイルス2、およびヒトヘルペスウイルス3型は、臨床的にウイルス性髄膜脳炎が疑われる4例からそれぞれNGS技術を使用して検出されました。 そして結果は、ポリメラーゼ連鎖反応 (PCR) を使用してさらに検証されました。 さらに、Yao らは、髄膜脳炎患者 3 人の脳脊髄液中にリステリア菌を NGS によって検出しました。 これらのレポートは、CSF の NGS を中枢神経系 (CNS) 感染症の診断法として適用する可能性を強調しています。 ただし、報告の大部分は単一の症例報告で構成されており、特に小児集団における細菌性髄膜炎患者の CSF サンプルから病原体を検出するために NGS を適用した研究はほとんど報告されていません。 この研究では、NGS 技術を使用して細菌性髄膜炎の小児の CSF サンプルから直接検出し、細菌性髄膜炎の病原性同定における NGS 技術の実現可能性と重要性を評価したいと考えています。
研究の種類
入学 (予想される)
連絡先と場所
研究場所
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北京
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Beijing、北京、中国、100045
- 募集
- Beijing Children's Hospital
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コンタクト：
- Gang Liu
- 電話番号：008613370115008
- メール：liugang10@hotmail.com
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 細菌性髄膜炎の疑いが強い患者
除外基準:
- ウイルス性髄膜炎、結核性髄膜炎、クリプトコッカス髄膜炎などで確認された非細菌感染性中枢神経系（CNS）
- 自己免疫性脳炎の症例
- 腫瘍性疾患によって影響を受ける中枢神経系
- 出血性脳脊髄液
- 脳脊髄液1ml未満
- グループへの参加を拒否する
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
- 観測モデル：コホート
- 時間の展望：見込みのある
この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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小児細菌性髄膜炎の病原体検出における次世代シークエンスの診断価値（感度と感受性、陽性・陰性適中率）
時間枠：2年
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小児細菌性髄膜炎の患者からサンプルの脳脊髄液を収集することを目指しています。
次世代シーケンスは、収集されたサンプルに対して実行されます。
シーケンシング結果の分析は、病原体遺伝子の分析と同定に焦点を当て、次世代シーケンシングの診断性能を従来の病因診断法と比較します。
小児細菌性髄膜炎の次世代シーケンシングは、従来の方法 (培養、特定の病原体抗原、核酸の PCR 検出など) よりも大きな診断価値を示すと予想されます。
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2年
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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感染症の病原体検出における伝統的手法の診断価値（感度と感受性、陽性・陰性的中率）
時間枠：2年
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小児細菌性髄膜炎患者からCSFサンプルを収集することを目指しています。
培養、特殊な病原体血清学、核酸の PCR 検出などを含む従来の方法が、収集されたサンプルに対して実行されます。
私たちの分析は、感染症における従来の診断方法の診断力を研究することを目的としています。
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2年
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協力者と研究者
協力者
捜査官
- 主任研究者：Gang Liu、Beijing Children's Hospital
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (予想される)
研究の完了 (予想される)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- 20190514
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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