Anwendung der Sequenzierungstechnik der nächsten Generation bei bakterieller Meningitis bei Kindern

Bakterielle Meningitis, auch bekannt als eitrige Meningitis, wird durch eine Vielzahl von bakteriellen Infektionen verursacht. Obwohl die Inzidenz bei Säuglingen und Kindern seit der Anwendung von konjugierten Impfstoffen gegen Haemophilus influenzae Typ b (Hib), Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae) und Neisseria meningitides (N. Meningitiden) ist die bakterielle Meningitis nach wie vor eine wichtige Ursache für Mortalität und Morbidität bei Neugeborenen und Kindern auf der ganzen Welt. Die ursächlichen Erreger der bakteriellen Meningitis hängen vom unterschiedlichen Alter des Patienten und prädisponierenden Faktoren ab.

Bei der bakteriellen Meningitis ist die Erregeridentifikation von größter Bedeutung. Derzeit basiert der Erreger der bakteriellen Meningitis noch hauptsächlich auf Gram-Färbung und Bakterienkultur. Die Liquorkultur kann jedoch bei Kindern, die vor der Liquoruntersuchung eine Antibiotikabehandlung erhalten, negativ sein. Aufgrund der Einschränkungen klinischer Labortests kann mehr als die Hälfte der Fälle von Infektionen des Zentralnervensystems nicht eindeutig diagnostiziert werden. Obwohl in der klinischen Mikrobiologie Nicht-Kulturverfahren wie Multiplex-PCR und Latex-Agglutination usw. verwendet wurden, konnten mit dieser Art von Technologie nur ein oder mehrere spezifische Pathogene angegriffen werden, ganz zu schweigen von seltenen Pathogenen.

In den letzten Jahren hat das Aufkommen der leistungsstarken NGS-Technologie aufgrund ihrer schnellen Durchlaufzeit eine unvoreingenommene Sequenzierung biologischer Proben ermöglicht. Wilson et al. stellten einen Fall von Neuroleptospirose vor, der zu einer dramatischen klinischen Verbesserung mit intravenösem Penicillin führte, nachdem eine Leptospira-Infektion im Liquor durch unvoreingenommene NGS-Technologie identifiziert worden war. Unvoreingenommenes NGS könnte theoretisch die Identifizierung aller potenziellen Krankheitserreger in einem einzigen Assay erleichtern. Herpes-simplex-Virus1, Herpes-simplex-Virus 2 und humaner Herpesvirus Typ 3 wurden mit der NGS-Technologie in jeweils vier Fällen mit klinischem Verdacht auf virale Meningoenzephalitis nachgewiesen. Und die Ergebnisse wurden mittels Polymerase-Kettenreaktion (PCR) weiter validiert. Weiterhin entdeckten Yao et al. Listeria monocytogenes im Liquor von drei Patienten mit Meningoenzephalitis durch NGS. Diese Berichte unterstreichen die Durchführbarkeit der Anwendung von NGS von CSF als diagnostisches Verfahren für Infektionen des Zentralnervensystems (ZNS). Allerdings handelt es sich bei den meisten Berichten um Einzelfallberichte, und es wurden nur wenige Studien zur Anwendung von NGS zum Nachweis von Krankheitserregern aus Liquorproben von Patienten mit bakterieller Meningitis, insbesondere bei pädiatrischen Populationen, berichtet. In dieser Studie möchten wir die NGS-Technologie verwenden, um direkt aus den Liquorproben von Kindern mit bakterieller Meningitis zu detektieren und die Machbarkeit und Bedeutung der NGS-Technik für die pathogene Identifizierung von bakterieller Meningitis zu bewerten.