二代测序技术在小儿细菌性脑膜炎中的应用

细菌性脑膜炎又称化脓性脑膜炎，是由多种细菌感染引起的。 尽管自从使用针对 b 型流感嗜血杆菌 (Hib)、肺炎链球菌 (S. pneumoniae) 和脑膜炎奈瑟菌 (N. 脑膜炎），细菌性脑膜炎仍然是全世界新生儿和儿童死亡和发病的重要原因。 细菌性脑膜炎的致病病原体取决于患者的不同年龄和诱发因素。

病原体鉴定对于细菌性脑膜炎至关重要。 目前，细菌性脑膜炎的病原体仍以革兰氏染色和细菌培养为主。 然而，脑脊液检查前接受抗生素治疗的患儿脑脊液培养可为阴性。由于临床实验室检测的局限性，超过半数的中枢神经系统感染病例无法明确诊断。 尽管多重PCR、胶乳凝集等非培养方法已应用于临床微生物学，但这些技术只能针对一种或几种特定病原体，更不用说罕见病原体了。

近年来，强大的 NGS 技术的出现，由于其快速的周转时间，使生物样本的无偏测序成为可能。 Wilson 等人介绍了一个神经钩端螺旋体病病例，在通过无偏倚的 NGS 技术识别 CSF 中的钩端螺旋体感染后，静脉注射青霉素导致临床显着改善。 理论上，无偏倚的 NGS 可以促进在一次检测中识别所有潜在的病原体。 利用NGS技术分别从4例临床疑似病毒性脑膜脑炎病例中检测出单纯疱疹病毒1、单纯疱疹病毒2和人类疱疹病毒3型。 并使用聚合酶链反应 (PCR) 进一步验证了结果。 此外，Yao 等人通过 NGS 检测了三名脑膜脑炎患者的 CSF 中的单核细胞增生李斯特菌。 这些报告强调了应用 CSF 的 NGS 作为中枢神经系统 (CNS) 感染诊断方法的可行性。 然而，大多数报告都是由单个病例报告组成的，很少有研究报告将 NGS 应用于细菌性脑膜炎患者脑脊液样本中的病原体检测，尤其是在儿科人群中。 本研究拟利用NGS技术对细菌性脑膜炎患儿脑脊液标本进行直接检测，评价NGS技术在细菌性脑膜炎病原学鉴定中的可行性和意义。