Applicazione della tecnica di sequenziamento di nuova generazione nella meningite batterica pediatrica

La meningite batterica, nota anche come meningite purulenta, è causata da una varietà di infezioni batteriche. Sebbene l'incidenza nei neonati e nei bambini sia diminuita dall'uso di vaccini coniugati contro Haemophilus influenzae di tipo b (Hib), Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae) e Neisseria meningitides (N. meningitides), la meningite batterica continua ad essere un'importante causa di mortalità e morbilità nei neonati e nei bambini in tutto il mondo. I patogeni causali della meningite batterica dipendono dalla diversa età del paziente e dai fattori predisponenti.

L'identificazione del patogeno è di fondamentale importanza per la meningite batterica. Allo stato attuale, l'agente patogeno della meningite batterica si basa ancora principalmente sulla colorazione di Gram e sulla coltura batterica. Tuttavia, la coltura del liquor può essere negativa nei bambini che ricevono un trattamento antibiotico prima dell'esame del liquor. Sebbene nella microbiologia clinica siano stati utilizzati metodi non colturali, tra cui la PCR multiplex e l'agglutinazione al lattice, ecc., solo uno o più patogeni specifici potrebbero essere presi di mira da questo tipo di tecnologia, per non parlare dei patogeni rari.

Negli ultimi anni, l'emergere della potente tecnologia NGS ha consentito il sequenziamento imparziale di campioni biologici grazie al suo rapido tempo di risposta. Wilson et al hanno presentato un caso di neuroleptospirosi, che ha portato a un notevole miglioramento clinico con la penicillina per via endovenosa dopo aver identificato l'infezione da leptospira nel liquido cerebrospinale mediante tecnologia NGS imparziale. L'NGS imparziale potrebbe facilitare teoricamente l'identificazione di tutti i potenziali agenti patogeni in un singolo test. Il virus dell'herpes simplex1, il virus dell'herpes simplex 2 e il virus dell'herpes umano di tipo 3 sono stati rilevati utilizzando la tecnologia NGS rispettivamente da quattro casi con meningoencefalite virale clinicamente sospetta. E i risultati sono stati ulteriormente convalidati utilizzando la reazione a catena della polimerasi (PCR). Inoltre, Yao et al. hanno rilevato Listeria monocytogenes nel liquido cerebrospinale di tre pazienti con meningoencefalite mediante NGS. Questi rapporti evidenziano la fattibilità dell'applicazione di NGS di CSF come metodo diagnostico per l'infezione del sistema nervoso centrale (SNC). Tuttavia, la maggior parte delle segnalazioni è composta da segnalazioni di casi singoli e sono stati riportati pochi studi sull'applicazione dell'NGS per il rilevamento di agenti patogeni da campioni di CSF di pazienti con meningite batterica, specialmente nelle popolazioni pediatriche. In questo studio, vorremmo utilizzare la tecnologia NGS per rilevare direttamente dai campioni di CSF di bambini con meningite batterica e valutare la fattibilità e il significato della tecnica NGS sull'identificazione patogena della meningite batterica.