Aplicación de la técnica de secuenciación de próxima generación en la meningitis bacteriana pediátrica

La meningitis bacteriana, también conocida como meningitis purulenta, es causada por una variedad de infecciones bacterianas. Aunque la incidencia en lactantes y niños ha disminuido desde el uso de vacunas conjugadas contra Haemophilus influenzae tipo b (Hib), Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae) y Neisseria meningitides (N. meningitis), la meningitis bacteriana continúa siendo una causa importante de mortalidad y morbilidad en recién nacidos y niños en todo el mundo. Los patógenos causantes de la meningitis bacteriana dependen de la edad del paciente y de los factores predisponentes.

La identificación de patógenos es de suma importancia para la meningitis bacteriana. En la actualidad, el patógeno de la meningitis bacteriana todavía se basa principalmente en la tinción de Gram y el cultivo bacteriano. Sin embargo, el cultivo del LCR puede ser negativo en niños que reciben tratamiento con antibióticos antes del examen del LCR. Debido a las limitaciones de las pruebas de laboratorio clínico, más de la mitad de los casos de infección del sistema nervioso central no se pueden diagnosticar claramente. Aunque en microbiología clínica se han utilizado métodos que no son de cultivo, como la PCR multiplex y la aglutinación de látex, etc., solo uno o varios patógenos específicos podrían ser el objetivo de este tipo de tecnología, por no hablar de los patógenos raros.

En los últimos años, la aparición de la potente tecnología NGS ha permitido la secuenciación imparcial de muestras biológicas debido a su rápido tiempo de respuesta. Wilson et al presentaron un caso de neuroleptospirosis, que resultó en una mejoría clínica dramática con penicilina intravenosa después de identificar una infección por leptospira en el LCR mediante tecnología NGS imparcial. En teoría, la NGS imparcial podría facilitar la identificación de todos los patógenos potenciales en un único ensayo. El virus del herpes simplex1, el virus del herpes simplex 2 y el virus del herpes humano tipo 3 se detectaron mediante tecnología NGS en cuatro casos con sospecha clínica de meningoencefalitis viral, respectivamente. Y los resultados se validaron aún más mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Además, Yao et al detectaron Listeria monocytogenes en LCR de tres pacientes con meningoencefalitis por NGS. Estos informes destacan la viabilidad de aplicar NGS de LCR como método de diagnóstico para la infección del sistema nervioso central (SNC). Sin embargo, la mayoría de los informes se componen de informes de casos únicos y se han informado pocos estudios en la aplicación de NGS para la detección de patógenos a partir de muestras de LCR de pacientes con meningitis bacteriana, especialmente en poblaciones pediátricas. En este estudio, nos gustaría utilizar la tecnología NGS para detectar directamente a partir de muestras de LCR de niños con meningitis bacteriana y evaluar la viabilidad y la importancia de la técnica NGS en la identificación patogénica de la meningitis bacteriana.