Aplicação da Técnica de Sequenciamento de Próxima Geração na Meningite Bacteriana Pediátrica

A meningite bacteriana, também conhecida como meningite purulenta, é causada por uma variedade de infecções bacterianas. Embora a incidência em lactentes e crianças tenha diminuído desde o uso de vacinas conjugadas contra Haemophilus influenzae tipo b (Hib), Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae) e Neisseria meningitides (N. meningites), a meningite bacteriana continua sendo uma importante causa de mortalidade e morbidade em recém-nascidos e crianças em todo o mundo. Os patógenos causadores da meningite bacteriana dependem da idade diferente do paciente e dos fatores predisponentes.

A identificação do patógeno é de suma importância para a meningite bacteriana. Atualmente, o patógeno da meningite bacteriana ainda é baseado principalmente na coloração de Gram e na cultura bacteriana. No entanto, a cultura do LCR pode ser negativa em crianças que recebem tratamento antibiótico antes do exame do LCR. Devido às limitações dos testes laboratoriais clínicos, mais da metade dos casos de infecção do sistema nervoso central não pode ser claramente diagnosticado. Embora métodos de não cultura, incluindo PCR multiplex e aglutinação de látex, etc., tenham sido usados ​​em microbiologia clínica, apenas um ou vários patógenos específicos poderiam ser visados ​​por esses tipos de tecnologia, muito menos patógenos raros.

Nos últimos anos, o surgimento da poderosa tecnologia NGS permitiu o sequenciamento imparcial de amostras biológicas devido ao seu rápido tempo de resposta. Wilson et al apresentaram um caso de neuroleptospirose, resultando em uma melhora clínica dramática com penicilina intravenosa após a identificação de infecção por leptospira no LCR pela tecnologia NGS imparcial. NGS imparcial poderia facilitar a identificação de todos os patógenos potenciais em um único ensaio teoricamente. O vírus herpes simplex1, o vírus herpes simplex 2 e o vírus herpes humano tipo 3 foram detectados usando a tecnologia NGS em quatro casos com suspeita clínica de meningoencefalite viral, respectivamente. E os resultados foram posteriormente validados usando a reação em cadeia da polimerase (PCR). Além disso, Yao et al detectaram Listeria monocytogenes no LCR de três pacientes com meningoencefalite por NGS. Esses relatórios destacam a viabilidade da aplicação de NGS de LCR como método diagnóstico para infecção do sistema nervoso central (SNC). No entanto, a maioria dos relatórios é composta por relatos de casos únicos e poucos estudos foram relatados na aplicação de NGS para detecção de patógenos a partir de amostras de LCR de pacientes com meningite bacteriana, especialmente em populações pediátricas. Neste estudo, gostaríamos de usar a tecnologia NGS para detectar diretamente das amostras de LCR de crianças com meningite bacteriana e avaliar a viabilidade e importância da técnica NGS na identificação patogênica da meningite bacteriana.