BlaNDM-1 および blaKPC 遺伝子の検出のための LAMP アッセイと PCR の比較
アシュート大学病院におけるカルバペネム耐性グラム陰性菌株中の blaNDM-1 および blaKPC 遺伝子の検出のための LAMP アッセイと PCR の比較
調査の概要
状態
条件
詳細な説明
グラム陰性菌のカルバペネム耐性は世界的な問題となっており、拡大し続ける世界的な流行を引き起こしています..
多剤耐性を付与するニューデリー メタロ-ベータ-ラクタマーゼ 1 (NDM-1) 酵素は、ニューデリー メタロ-ベータ-ラクタマーゼ 1 遺伝子 (blaNDM-1) によってコードされています]。 NDM-1 は、β-ラクタム環を切断することにより、カルバペネムを含む主要なクラスのβ-ラクタム系抗生物質を不活性化します。 NDM-1 は、大腸菌、クレブシエラ属、赤痢菌、コレラ菌を含む 11 の異なる細菌種で報告されており、水平遺伝子伝達の可能性を示しています。
クラス A (セリン カルバペネマーゼ) に属し、ボロン酸によって阻害される肺炎桿菌カルバペネマーゼ (KPC) 酵素は、腸内細菌科、緑膿菌、アシネトバクター バウマニの間で急速に世界的な問題になっています。
感染症の治療では、耐性菌の出現と拡散を防ぐために、適切な抗菌薬の投与が不可欠です。 ただし、細菌の増殖に基づく従来の抗菌薬感受性試験 (AST) は時間がかかります。したがって、ループ媒介等温増幅 (LAMP) などの臨床検査室で適切な抗生物質をタイムリーに選択するには、迅速で簡単なアッセイが必要です。
日本の研究者納富によって開発されたLAMPは、等温条件下でDNA増幅を完了することができる新しい遺伝子増幅法です。 LAMP は、特別に設計された 4 ～ 6 個のオリゴヌクレオチド プライマーと特定の DNA ポリメラーゼ (Bst) のセットを利用する鎖置換増幅技術です。 鎖置換増幅のプロセスにより、サイクル増幅のテンプレートとして機能するダンベル DNA 構造が生成されます。 サーモサイクラーの必要性がなく、反応速度が速いため、LAMP は、リソースが限られた環境で遺伝子を分子検出するためのシンプルで高感度の患者に近いツールを開発するための有望なプラットフォームとなっています。
LAMP は、ポリメラーゼ連鎖反応 (PCR) の代替技術の中で最も人気があり、確立された核酸増幅技術です。 遺伝子検査のステップには、検体からの核酸抽出、遺伝子増幅、および検出が含まれます。 これらの手順には、かなりのスキルと高価な機器と設備が必要なため、任意の場所での便利なテストが困難になります。 これらの制限を克服するために、迅速性、シンプルさ、および高い特異性を兼ね備えた新しい遺伝子増幅法、LAMP 反応が開発されました。
研究の種類
入学 (予想される)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前：Ayat Mohammed
- 電話番号：01064642468
研究連絡先のバックアップ
- 名前：.Shereen Mohammed
- メール：Dr.ayat1200@aun.edu.eg
参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 入院3日目以降に感染症を発症した患者（病院関連感染症）
除外基準:
- 入院3日目までに感染症の徴候を発症した患者（市中感染）
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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PCR と比較して、グラム陰性菌株中の blaNDM-1 および blaKPC 遺伝子の迅速かつ費用効果の高い検出のための LAMP アッセイの使用を評価する
時間枠：手続き中
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PCR および LAMP によるグラム陰性菌株中の blaNDM-1 および blaKPC 遺伝子の分子検出
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手続き中
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協力者と研究者
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捜査官
- 主任研究者：Ayat Mohammed、Assiut University
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (予想される)
一次修了 (予想される)
研究の完了 (予想される)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
その他の研究ID番号
- LAMP Assay
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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