Test LAMP versus PCR pro detekci genů blaNDM-1 a blaKPC
Test LAMP versus PCR pro detekci genů blaNDM-1 a blaKPC mezi gramnegativními izoláty rezistentními na karbapenem v univerzitních nemocnicích v Assiutu
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Detailní popis
Karbapenemová rezistence u gramnegativních bakterií se stala celosvětovým problémem a způsobila celosvětovou epidemii, která stále roste.
Enzym metalo-beta-laktamázy 1 z Nového Dillí (NDM-1), který uděluje rezistenci vůči více léčivům, je kódován genem pro metalo-beta-laktamázu 1 z Nového Dillí (blaNDM-1)]. NDM-1 inaktivuje hlavní třídy beta-laktamových antibiotik včetně karbapenemů štěpením b-laktamových kruhů. NDM-1 byl hlášen u 11 různých bakteriálních druhů včetně Escherichia coli, Klebsiella sp., Shigella boydii a Vibrio cholera, což ukazuje na potenciál horizontálního přenosu genů.
Enzymy karbapenemázy Klebsiella pneumoniae (KPC), patřící do třídy A (serinové karbapenemázy) a inhibované kyselinou boronovou, se rychle staly globálním problémem mezi Enterobacteriaceae, Pseudomonas aeruginosa a Acinetobacter baumannii.
Při terapii infekčních chorob je podávání adekvátních antimikrobiálních látek zásadní pro prevenci vzniku a šíření rezistentních bakterií. Nicméně konvenční testování antimikrobiální citlivosti (AST), založené na růstu bakterií, je časově náročné; proto je zapotřebí rychlý a jednoduchý test pro včasný výběr vhodných antibiotik v klinických laboratořích, jako je izotermická amplifikace zprostředkovaná smyčkou (LAMP).
LAMP, vyvinutý japonským výzkumníkem Notomim, je nová metoda amplifikace genu, která dokáže dokončit amplifikaci DNA za izotermických podmínek. LAMP je technika amplifikace s vytěsněním řetězce, která využívá sadu 4 až 6 speciálně navržených oligonukleotidových primerů a specifickou DNA polymerázu (Bst). Procesem amplifikace vytěsněním vlákna se vytvoří struktura DNA činky, která slouží jako templát pro amplifikaci cyklu. Nepotřeba termocykleru, rychlost reakce a LAMP činí slibnou platformu pro vývoj jednoduchého a citlivého nástroje pro blízké pacienty pro molekulární detekci genů v prostředí s omezenými zdroji.
LAMP je nejoblíbenější a dobře zavedená technologie amplifikace nukleové kyseliny mezi alternativami pro polymerázovou řetězovou reakci (PCR). Kroky genetického testování zahrnují extrakci nukleové kyseliny ze vzorků, amplifikaci genu a detekci. Tyto kroky vyžadují značné dovednosti a drahé vybavení a zařízení, což ztěžuje pohodlné testování na jakémkoli místě. K překonání těchto omezení byla vyvinuta nová metoda genové amplifikace, reakce LAMP, která kombinuje rychlost, jednoduchost a vysokou specificitu.
Typ studie
Zápis (Očekávaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Ayat Mohammed
- Telefonní číslo: 01064642468
Studijní záloha kontaktů
- Jméno: .Shereen Mohammed
- E-mail: Dr.ayat1200@aun.edu.eg
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Pacienti, u kterých se objeví známky infekce třetí den po přijetí do nemocnice nebo později (nemocniční infekce)
Kritéria vyloučení:
- Pacienti, u kterých se projeví známky infekce před třetím dnem přijetí do nemocnice (komunitní infekce)
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
zhodnotit použití testu LAMP pro rychlou a nákladově efektivní detekci genů blaNDM-1 a blaKPC mezi gramnegativními izoláty ve srovnání s PCR
Časové okno: během procedury
|
Molekulární detekce genu blaNDM-1 a blaKPC mezi gramnegativními izoláty pomocí PCR a LAMP
|
během procedury
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Ayat Mohammed, Assiut University
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Očekávaný)
Primární dokončení (Očekávaný)
Dokončení studie (Očekávaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další identifikační čísla studie
- LAMP Assay
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .