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LAMP 检测与 PCR 检测 blaNDM-1 和 blaKPC 基因

2020年7月18日 更新者:Ayat Hussein Mohammed、Assiut University

在 Assiut 大学医院使用 LAMP 检测与 PCR 检测碳青霉烯类耐药革兰氏阴性分离株中的 blaNDM-1 和 blaKPC 基因

这项工作的目的是检测来自不同临床样本的革兰氏阴性分离株,确定革兰氏阴性分离株对各种抗菌药物的抗菌敏感性模式,通过 PCR 对革兰氏阴性分离株中的 blaNDM-1 和 blaKPC 基因进行分子检测,分子生物学通过 LAMP 检测革兰氏阴性分离株中的 blaNDM-1 和 blaKPC 基因,并与 PCR 相比较,评估使用 LAMP 法快速且经济高效地检测革兰氏阴性分离株中的 blaNDM-1 和 blaKPC 基因。

研究概览

地位

尚未招聘

条件

详细说明

革兰氏阴性菌对碳青霉烯类的耐药性已成为一个世界性问题,并导致全球流行病持续蔓延。

赋予多重耐药性的新德里金属-β-内酰胺酶 1 (NDM-1) 酶由新德里金属-β-内酰胺酶 1 基因 (blaNDM-1) 编码。 NDM-1 通过裂解 β-内酰胺环使主要类别的 β-内酰胺类抗生素失活,包括碳青霉烯类。 NDM-1 在 11 种不同的细菌物种中被报道,包括大肠杆菌、克雷伯氏菌属、博伊氏志贺氏菌和霍乱弧菌,表明水平基因转移的潜力。

肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶 (KPC) 属于 A 类(丝氨酸碳青霉烯酶)并被硼酸抑制,已迅速成为肠杆菌科、铜绿假单胞菌和鲍曼不动杆菌中的全球性问题。

在传染病治疗中,施用足够的抗菌剂对于防止耐药细菌的出现和传播至关重要。 然而,传统的基于细菌生长的抗菌药敏试验 (AST) 非常耗时;因此,临床实验室需要一种快速、简单的检测方法来及时选择合适的抗生素,例如环介导等温扩增 (LAMP)。

LAMP是由日本研究人员Notomi开发的,是一种在等温条件下完成DNA扩增的新型基因扩增方法。 LAMP 是一种链置换扩增技术,它利用一组 4 到 6 个专门设计的寡核苷酸引物和特定的 DNA 聚合酶 (Bst)。 通过链置换扩增的过程,产生哑铃型DNA结构,作为循环扩增的模板。 不需要热循环仪,反应速度快,使 LAMP 成为一个有前途的平台,可以开发一种简单、灵敏的临近患者工具,用于在资源有限的环境中进行基因分子检测。

LAMP 是聚合酶链反应 (PCR) 替代方案中最流行和最成熟的核酸扩增技术。 基因检测的步骤包括标本核酸提取、基因扩增和检测。 这些步骤需要相当高的技能和昂贵的设备和设施,使得在任何给定位置进行方便的测试变得困难。 为了克服这些限制,开发了一种新的基因扩增方法,即 LAMP 反应,它结合了快速、简单和高特异性。

研究类型

观察性的

注册 (预期的)

100

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。

学习联系方式

  • 姓名:Ayat Mohammed
  • 电话号码:01064642468

研究联系人备份

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

  • 孩子
  • 成人
  • 年长者

接受健康志愿者

不适用

有资格学习的性别

全部

取样方法

非概率样本

研究人群

感染碳青霉烯类耐药革兰氏阴性菌的患者

描述

纳入标准:

  • 入院第三天或之后出现感染迹象的患者(医院相关感染)

排除标准:

  • 入院第三天前出现感染体征的患者(社区获得性感染)

学习计划

本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的?

设计细节

研究衡量的是什么?

主要结果指标

结果测量
措施说明
大体时间
与 PCR 相比,评估使用 LAMP 检测快速且经济高效地检测革兰氏阴性分离株中的 blaNDM-1 和 blaKPC 基因
大体时间:在手术过程中
通过 PCR 和 LAMP 对革兰氏阴性分离株中的 blaNDM-1 和 blaKPC 基因进行分子检测
在手术过程中

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

调查人员

  • 首席研究员:Ayat Mohammed、Assiut University

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (预期的)

2020年10月1日

初级完成 (预期的)

2022年10月1日

研究完成 (预期的)

2023年10月1日

研究注册日期

首次提交

2020年7月15日

首先提交符合 QC 标准的

2020年7月18日

首次发布 (实际的)

2020年7月21日

研究记录更新

最后更新发布 (实际的)

2020年7月21日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2020年7月18日

最后验证

2020年7月1日

更多信息

与本研究相关的术语

其他研究编号

  • LAMP Assay

药物和器械信息、研究文件

研究美国 FDA 监管的药品

研究美国 FDA 监管的设备产品

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