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BlaNDM-1 및 blaKPC 유전자 검출을 위한 LAMP 분석 대 PCR

2020년 7월 18일 업데이트: Ayat Hussein Mohammed, Assiut University

Assiut University Hospitals의 Carbapenem 내성 그람 음성 분리주 중 blaNDM-1 및 blaKPC 유전자 검출을 위한 LAMP Assay 대 PCR

이 연구의 목적은 다양한 임상 검체에서 분리된 그람음성균의 검출, 다양한 항균제에 대한 그람음성균의 항균제 감수성 패턴 결정, PCR을 통한 그람음성균주 중 blaNDM-1 및 blaKPC 유전자의 분자 검출, 분자 LAMP에 의한 그람 음성 분리주 중 blaNDM-1 및 blaKPC 유전자 검출 및 PCR과 비교하여 그람 음성 분리주 중 blaNDM-1 및 blaKPC 유전자의 신속하고 비용 효율적인 검출을 위한 LAMP 분석법의 사용을 평가합니다.

연구 개요

상태

아직 모집하지 않음

상세 설명

그람음성균의 카바페넴 내성은 세계적인 문제가 되었고 계속해서 성장하는 세계적인 유행병을 일으켰습니다.

다중 약물 내성을 부여하는 뉴델리 메탈로-베타-락타마제 1(NDM-1) 효소는 뉴델리 메탈로-베타-락타마제 1 유전자(blaNDM-1)에 의해 암호화됩니다]. NDM-1은 b-락탐 고리를 절단하여 카바페넴을 포함한 베타-락탐 항생제의 주요 부류를 비활성화합니다. NDM-1은 Escherichia coli, Klebsiella sp., Shigella boydii 및 Vibrio cholera를 포함한 11종의 다른 박테리아 종에서 보고되었으며 수평적 유전자 전달의 가능성을 나타냅니다.

KPC(Klebsiella pneumoniae carbapenemase) 효소는 Class A(serine carbapenemase)에 속하고 boronic acid에 의해 억제되며 Enterobacteriaceae, Pseudomonas aeruginosa 및 Acinetobacter baumannii 사이에서 빠르게 세계적인 문제가 되었습니다.

감염병 치료에서 내성균의 출현과 확산을 방지하기 위해서는 적절한 항균제의 투여가 필수적이다. 그러나 박테리아 성장을 기반으로 하는 기존의 항균제 감수성 검사(AST)는 시간이 많이 걸립니다. 따라서 루프 매개 등온 증폭(LAMP)과 같은 임상 실험실에서 적절한 항생제를 적시에 선택하기 위해서는 신속하고 간단한 분석이 필요합니다.

일본 노토미 연구원이 개발한 LAMP는 등온 조건에서 DNA 증폭을 완료할 수 있는 새로운 유전자 증폭 방법이다. LAMP는 가닥 치환 증폭 기술로, 특별히 고안된 4~6개의 올리고뉴클레오티드 프라이머 세트와 특정 DNA 폴리머라제(Bst)를 사용합니다. 가닥 변위 증폭 과정을 통해 사이클 증폭을 위한 주형 역할을 하는 아령 DNA 구조가 생성됩니다. 열 순환 장치에 대한 필요성 부족, 반응 속도 및 LAMP는 자원이 제한된 환경에서 유전자의 분자 검출을 위한 간단하고 민감한 근접 환자 도구 개발을 위한 유망한 플랫폼입니다.

LAMP는 PCR(Polymerase Chain Reaction)에 대한 대안 중 가장 대중적이고 잘 확립된 핵산 증폭 기술입니다. 유전자 검사의 단계에는 검체로부터 핵산 추출, 유전자 증폭 및 검출이 포함됩니다. 이러한 단계에는 상당한 기술과 고가의 장비 및 시설이 필요하므로 주어진 위치에서 편리한 테스트가 어렵습니다. 이러한 한계를 극복하기 위해 신속성, 단순성 및 높은 특이성을 결합한 새로운 유전자 증폭 방법인 LAMP 반응이 개발되었습니다.

연구 유형

관찰

등록 (예상)

100

연락처 및 위치

이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.

연구 연락처

  • 이름: Ayat Mohammed
  • 전화번호: 01064642468

연구 연락처 백업

참여기준

연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.

자격 기준

공부할 수 있는 나이

  • 어린이
  • 성인
  • 고령자

건강한 자원 봉사자를 받아들입니다

해당 없음

연구 대상 성별

모두

샘플링 방법

비확률 샘플

연구 인구

카바페넴 내성 그람 음성균에 감염된 환자

설명

포함 기준:

  • 입원 3일 이후 감염 징후가 나타난 환자(병원 관련 감염)

제외 기준:

  • 입원 3일차 이전에 감염 징후가 나타난 환자(지역사회 감염)

공부 계획

이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.

연구는 어떻게 설계됩니까?

디자인 세부사항

연구는 무엇을 측정합니까?

주요 결과 측정

결과 측정
측정값 설명
기간
PCR과 비교하여 그람 음성 분리주 중에서 blaNDM-1 및 blaKPC 유전자를 신속하고 비용 효율적으로 검출하기 위한 LAMP 분석법의 사용을 평가합니다.
기간: 절차 중
PCR 및 LAMP에 의한 그람 음성 분리주 중 blaNDM-1 및 blaKPC 유전자의 분자 검출
절차 중

공동 작업자 및 조사자

여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.

스폰서

수사관

  • 수석 연구원: Ayat Mohammed, Assiut University

연구 기록 날짜

이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.

연구 주요 날짜

연구 시작 (예상)

2020년 10월 1일

기본 완료 (예상)

2022년 10월 1일

연구 완료 (예상)

2023년 10월 1일

연구 등록 날짜

최초 제출

2020년 7월 15일

QC 기준을 충족하는 최초 제출

2020년 7월 18일

처음 게시됨 (실제)

2020년 7월 21일

연구 기록 업데이트

마지막 업데이트 게시됨 (실제)

2020년 7월 21일

QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출

2020년 7월 18일

마지막으로 확인됨

2020년 7월 1일

추가 정보

이 연구와 관련된 용어

기타 연구 ID 번호

  • LAMP Assay

약물 및 장치 정보, 연구 문서

미국 FDA 규제 의약품 연구

아니

미국 FDA 규제 기기 제품 연구

아니

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유전자 증폭에 대한 임상 시험

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