重度の急性呼吸器疾患患者における病原体の迅速分子検査の臨床的影響: 実用的な試験 (CIRT-RMT-SARI)

市中肺炎は、救急外来 (ED) を受診する最も一般的な理由の 1 つであり、ウイルス性と細菌性の両方の病原体によって引き起こされる可能性があります。 適切な抗ウイルス療法や抗生物質療法を迅速に実施するには、考えられる病原体を明確に理解することが不可欠です。 ウイルス病原体と細菌性病原体の臨床症状が区別できないため、ウイルス性呼吸器感染症患者は通常過小評価され、不必要な抗菌剤が投与される可能性が高くなります。 CAP の主な細菌原因は詳しく説明されており、肺炎球菌はすべての年齢層において最も重要な病原体です。 最近の研究と私たちのこれまでの研究では、ウイルス関連の CAP が CAP の 20 ～ 30% に関与している可能性があることが示されました。 したがって、CAP に関連する感染因子を正確かつタイムリーに判定できる臨床検査が重要です。 ウイルス性呼吸器病原体を検出するには、幅広い検査が利用可能です。 インフルエンザ A 型および B 型、呼吸器合胞体ウイルス (RSV) には迅速抗原検査が利用できますが、これらの検査は感度と特異度が低くなります。

ポリメラーゼ連鎖反応 (PCR) 法を使用して感染因子の RNA または DNA を検出する分子診断検査は、臨床サンプル中のウイルス病原体と細菌病原体の両方を検出する能力を向上させましたが、技術的には難しく、時間がかかります。 高感度のポイントオブケア (POC) 分子検出法の出現により、呼吸器ウイルス感染症の迅速な診断が可能になりました。 リアルタイム PCR プロセスを自動化し、サンプル調製、増幅、検出、分析を 1 つの完全なプロセスに統合する POC システムが開発され、FDA によって承認されました。 初期の研究では、このようなPOCマルチプレックスPCRシステムが、ED呼吸困難患者におけるこれまで過小評価されていたウイルス感染または非定型感染を同定したことを実証した。 高精度のウイルス検査結果が利用可能になったにもかかわらず、細菌性およびウイルス性病原体が関与する複合微生物感染症は高齢者によく見られるため、抗生物質の段階的縮小の中止は依然として懸念を引き起こしています。 したがって、抗生物質の正確な処方を導くことができる CAP 用の理想的な病原体診断ツールには、次の 3 つの特徴が含まれている必要があります。1 つ目は、CAP 用の一般的なウイルス病原体と細菌性病原体の両方を幅広く含むこと、2 つ目は、細菌性病原体の一般的な薬剤耐性遺伝子を含むこと、そして最後に、操作が簡単で、所要時間が短く、精度が高いことです。

このような診断ツールが最近開発されました。 BIOFIRE® FILMARRAY® 肺炎パネルに加えて、肺炎およびその他の下気道感染症を引き起こす 18 種類の細菌 (11 グラム陰性、4 グラム陽性、および非定型 3 種類)、7 種類の抗生物質耐性マーカー、および 9 種類のウイルスを検査します。 対象となる細菌には、アシネトバクター・カルコアセティクス・バウマンニ複合体、エンテロバクター・クロアカエ、大腸菌、インフルエンザ菌、クレブシエラ・エアロゲネス、クレブシエラ・オキシトカ、肺炎桿菌群、モラクセラ・カタラーリス、プロテウス属、緑膿菌、セラチア・マルセセンス、ブドウ球菌などが含まれる。ウレウス、アガラクティエ連鎖球菌、肺炎連鎖球菌、化膿性連鎖球菌。 7 つの抗生物質遺伝子には、ESBL (CTX-M)、カルバペネマーゼ (KPC、NDM、Oxa48 様、VIM、IMP、メチシリン耐性 (mecA/mecC および MREJ)) が含まれます。 非定型病原体には、レジオネラ・ニューモフィラ、マイコプラズマ・ニューモニエ、およびクラミジア・ニューモニアエが含まれる。 このウイルスには、インフルエンザ A 型、インフルエンザ B 型、アデノウイルス、コロナウイルス、パラインフルエンザ ウイルス、呼吸器合胞体ウイルス、ヒト ライノ ウイルス/エンテロ ウイルス、ヒト メタニューモ ウイルス、さらには中東呼吸器症候群 コロナウイルス (MERS-CoV) も含まれていました。 Filmarray システムは、サンプル前処理、核酸抽出と精製、増幅、検出、分析を 1 つのシンプルなシステムに統合した米国 FDA システムで、実作業時間はわずか 2 分で、合計実行時間は約 1 時間です。 現在、気管支肺胞（BAL）様サンプルの全体的な感度と特異度はそれぞれ 96.2% と 98.3%、喀痰サンプルの感度と特異度はそれぞれ 96.3% と 97.2% です。

この研究では、重度の急性呼吸器疾患を患い救急外来を受診する高齢患者に対する、プロカルシトニン検査と組み合わせた肺炎病原体のPOC分子検査の実施の影響を評価することを目的としています。 私たちは都市部の 2 つの医療センターの ED で前向きコホート研究を実施します。 臨床的影響は、実験コホートとランダムに選択された対照コホートとを並行して比較することによって評価されます。 POC分子検査に加えて、これらの患者に対してプロカルシトニンも検査します。 高感度の POC 分子検査を使用すると、定着した病原体の検出が大幅に増加する可能性があります。 PCT は、甲状腺の C 細胞および肺の K 細胞によって構成的に分泌されるカルシトニンの前駆体です。 健康な人では、PCT は通常検出できません (0.01 ng/mL 未満)。 エンドトキシンによって刺激されると、PCT は体中の実質組織によって急速に生成されます。 C 反応性タンパク質とは異なり、PCT は無菌炎症やウイルス感染には反応しません。 複数のランダム化比較試験により、プロカルシトニン濃度が 0.25 μg/L 未満であると、抗生物質の投与を中止するか、治療を早期に中止するかの決定につながる可能性があることが実証されています。 さらに、プロカルシトニン レベルが 0.1 μg/L 未満の場合は、コロニー形成を示している可能性があります。 私たちは、新しい診断アプローチが抗生物質治療をより適切に導き、最終的には患者の転帰を改善すると仮説を立てています。