DNA 칩의 고해상도 염색체 분석을 통한 미토콘드리아 질환 환자의 새로운 후보 유전자 발굴 (ACPA HR)

미토콘드리아 질환은 임상적, 유전적 이질성이 큰 복합질환으로 진단이 어렵다.

의료 유전학과는 이러한 질병의 진단을 활동에 포함합니다. 2006년부터 국가 차원에서 미토콘드리아 질병에 대한 참조 센터였으며 최근 Nice 대학 병원이 지원하는 "희귀 질병에 대한 유럽 참조 네트워크(ERN)" 프로젝트 요청에 따라 EURO-NMD가 승인되었습니다. 일상적인 진단 전략은 높은 처리량의 미토콘드리아 DNA(mtDNA) 시퀀싱 분석과 281개의 표적 "미토콘드리아 병증" 유전자 패널을 기반으로 합니다. 이러한 분석이 음성이면 연구 환경에서 엑솜 분석(게놈의 모든 엑손에 대한 높은 처리량 시퀀싱)을 수행할 수 있습니다. 현재까지 분석된 환자의 약 40%가 유전적 진단 없이 남아 있습니다. 실제로, 삭제, 중복 또는 CNV(카피 번호 변이) 유형의 큰 변이를 식별하는 것을 허용하지 않습니다. 더욱이, 엑손만을 대상으로 하는 엑솜 시퀀싱은 조절 영역에서 인트론 또는 국소 돌연변이의 검출을 허용하지 않습니다.

CNV의 식별은 DNA 칩(CADC)의 염색체 분석을 통해 가능합니다. 이 인정된 기술은 실험실에서 일상적으로 사용됩니다. 연구자들은 발달 장애가 있는 환자의 CNV에 대한 게놈 전체 연구를 위해 최소 해상도가 약 13Kb인 칩을 사용합니다. 그러나 이 분해능은 엑손 정도의 재작업 이벤트를 감지하기에는 불충분합니다. 당사 플랫폼과 호환되는 고해상도 DNA 칩이 있어 조사관이 엑솜 분석으로 식별할 수 없는 더 작은 재배열을 보다 정확하게 시각화할 수 있습니다. 엑솜/CADC 결합 전략은 수율을 높여 다양한 질병 진단에 효과가 이미 입증됐다.

이러한 맥락에서 연구자들은 mtDNA, 유전자 패널 및 엑솜 분석 후 진단되지 않은 미토콘드리아 질환 환자 15명을 대상으로 한 이 비간섭 연구에서 이 전략을 사용하는 것을 목표로 합니다. 그들은 두 가지 유형의 환자를 테스트합니다.

• 질병이 상염색체 열성 방식으로 전염되는 것으로 추정되는 첫 번째 시리즈에서 비교 가능한 임상상에서 이미 기술된 유전자에서 단 하나의 이형접합 변이체가 확인되었습니다. 따라서 이 환자들은 엑솜 시퀀싱이 식별할 수 없는 CNV의 두 번째 대립유전자의 보균자일 가능성이 있습니다.
• 두 번째 시리즈에서 엑솜 분석은 단일 책임 유전자(유전자 또는 변이체의 병원성에 대한 확신이 없는 여러 후보 유전자)의 식별을 허용하지 않았습니다.