DNAチップの高分解能染色体解析によるミトコンドリア病患者の新規候補遺伝子の同定 (ACPA HR)

ミトコンドリア病は、臨床的および遺伝的不均一性が大きい複雑な疾患であり、診断が困難です。

医療遺伝学部門の活動には、これらの病気の診断が含まれます。 2006年以来、国家レベルでミトコンドリア疾患のリファレンスセンターとなっており、最近、ニース大学病院の支援による「希少疾患のためのヨーロッパリファレンスネットワーク（ERN）」プロジェクト、EURO-NMDの募集の下で承認された。 日常的な診断戦略は、ハイスループットのミトコンドリア DNA (mtDNA) 配列解析と、標的となる 281 個の「ミトコンドリア症」遺伝子のパネルに基づいています。 これらの分析が陰性の場合、研究現場でエクソーム分析（ゲノム内のすべてのエクソンのハイスループットシークエンシング）を実行できます。 現在までに、分析された患者の約 40% は遺伝子診断を受けていない。 実際、欠失、重複、または CNV (コピー数変異) タイプの大きな変異を特定することはできません。 さらに、エクソンのみをターゲットとするエクソームシークエンシングでは、制御領域におけるイントロン変異や局所変異を検出することはできません。

CNV の同定は、DNA チップ (CADC) での染色体分析によって可能になります。 この認知された技術は研究室で日常的に使用されています。 研究者らは、発達障害患者の CNV のゲノムワイド研究に最小解像度約 13Kb のチップを使用しています。 ただし、この解像度は、エクソン程度のサイズのリワーク イベントを検出するには不十分です。 当社のプラットフォームと互換性のある高解像度 DNA チップがあり、研究者はエクソーム分析では特定できなかった小さな再配列をより正確に視覚化できます。 エクソームと CADC を組み合わせた戦略は、収量を増加させることでさまざまな病気の診断に有効であることがすでに証明されています。

これに関連して、研究者らは、mtDNA、遺伝子パネル、エクソームの分析後も未診断のままであるミトコンドリア病患者15人を対象とした一連の非介入研究でこの戦略を使用することを目指している。 彼らは 2 種類の患者を検査します。

• 最初のシリーズでは、この疾患は常染色体劣性遺伝様式で伝播すると考えられており、比較可能な臨床像ですでに記載されている遺伝子でヘテロ接合型変異が 1 つだけ同定されました。 したがって、これらの患者は、エクソーム配列決定では特定できなかった CNV の 2 番目の対立遺伝子の保因者である可能性があります。
• 2 番目のシリーズでは、エクソーム解析では単一の原因遺伝子 (遺伝子または変異体の病原性について確信がないいくつかの候補遺伝子) を同定できませんでした。