Profilowanie ekspresji genów i analiza bioinformatyczna Identyfikacja genów i szlaków biochemicznych w cukrzycy typu 2

Cukrzyca typu 2 jest zaburzeniem układu metabolicznego, które ma ogromny wpływ na zdrowie jednostki i nakłada znaczne koszty opieki zdrowotnej dla społeczeństwa. Konieczne jest podjęcie badań z naciskiem na poprawę jakości życia i ograniczenie poważnych powikłań cukrzycy typu 2.

W cukrzycy typu 2 insulinooporność i upośledzenie wydzielania insuliny przez komórki beta są głównymi defektami patofizjologicznymi i charakteryzują się podwyższonym poziomem glukozy w osoczu. Obecnie niewiele wiadomo na temat regulacji genów i szlaków biochemicznych związanych z chorobą.

Bioinformatyka i mikromacierze do ekspresji genów (GEM) zostaną zastosowane, aby uzyskać wgląd w molekularną patofizjologię cukrzycy typu 2. Jednoczesne monitorowanie tysięcy genów równolegle może identyfikować nowe geny i całe szlaki biochemiczne, które są rozregulowane na poziomie transkrypcji. Chipy lub macierze punktowe firmy Affymetrix Inc. zostaną zastosowane jako narzędzia do tworzenia mikromacierzy DNA. Programy bioinformatyczne i bazy danych zostaną wykorzystane jako narzędzia eksploracji danych w celu przeprowadzenia analizy statystycznej, analizy skupień i analizy szlaków biochemicznych.

Zostaną zastosowane biopsje mięśni szkieletowych i tkanki tłuszczowej zarówno od diabetyków, jak i osób bez cukrzycy. Zbadane zostaną zmiany w genach i szlakach biochemicznych między cukrzykami i osobami bez cukrzycy oraz zależności funkcjonalne między tkanką tłuszczową a mięśniami szkieletowymi.

Przeprowadzone zostanie grupowanie podtypów w cukrzycy typu 2 oraz skonstruowany zostanie system klasyfikacji. Budowa klasyfikatora może zapewnić lepszą i dokładniejszą diagnostykę cukrzycy typu 2.

Ogromne postępy w naukach medycznych dotyczących cukrzycy typu 2 wydają się zatem obiecujące i torują drogę do indywidualnego leczenia opartego na dokładniejszej diagnozie.