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COVID-19 的免疫遗传学预测因子

2021年2月22日 更新者:Mahmoud Elbendary、Mansoura University

在 COVID-19 结果中具有预测和预后意义的各种分子标记

背景:当前全球爆发的新型冠状病毒 Covid-19 起源于中国武汉,现已蔓延至包括 210 个国家在内的 6 大洲。 目前尚缺乏与感染易感性相关的严重急性呼吸系统综合症(SARS-CoV-2)基因多态性的报道。 此外,与抗原呈递相关的 MBL(甘露糖结合凝集素)的基因多态性与 SARS-CoV 感染的风险有关。 目的:研究不同病毒发病机制的不同遗传标记与 COVID-19 结果的关联。 方法:该研究将包括 100 名诊断为 COVID-19 的患者。 将采集生物血样进行常规诊断分析、使用实时聚合酶链反应 (PCR) 进行的常规分子检测、等位基因鉴别和基因分型分析。 结果:不同的遗传标记可能在 COVID-19 病毒感染的结果和预后中发挥作用。

研究概览

地位

未知

详细说明

当前全球爆发新型冠状病毒 Covid-19(冠状病毒病 2019;病原体称为 SARS-CoV-2;以前称为 2019-nCoV),它起源于中国武汉,现已传播到包括 210 个国家在内的 6 大洲。 冠状病毒 (CoV) 是一大类单链 RNA 病毒,可以感染动物和人类,引起呼吸道、胃肠道、肝脏和神经系统疾病。 冠状病毒是一组具有正链单链 RNA 基因组 (26-39 kb) 的包膜病毒。 迄今为止已确定四个冠状病毒属(α、β、γ、δ),其中在α冠状病毒(HCoV-229E和NL63)和β冠状病毒(如MERS-CoV和SARS-CoV)属中检测到人类冠状病毒(HCoVs) . 这种分离的新型 β-CoV 与两种源自蝙蝠的严重急性呼吸系统综合症 (SARS) 样冠状病毒 bat-SL-CoVZC45 和 bat-SL-CoVZXC21 的序列相似性不到 80%,与中东呼吸综合征 (MERS-CoV) 的序列。 COVID-19 患者表现出一般临床表现,包括发烧、干咳、呼吸困难、肌痛、疲劳、白细胞计数正常或减少,以及肺炎的影像学证据。 病毒进入宿主细胞后,病毒RNA基因组被释放到细胞质中,并被翻译成两种多聚蛋白和结构蛋白,之后病毒基因组开始复制。 当病毒进入宿主细胞后,其抗原会被呈递给抗原呈递细胞(antigen presentation cells,APC),这是机体抗病毒免疫的核心部分。 抗原肽由主要组织相容性复合体(MHC;或人类的人类白细胞抗原 (HLA))呈递,然后被病毒特异性细胞毒性 T 淋巴细胞 (CTL) 识别。 因此,了解 SARS-CoV-2 的抗原呈递将有助于我们理解 COVID-19 的发病机制。 然而,目前还缺乏关于 SARS-CoV-2 的报道,我们可以从以往对 SARS-CoV 和 MERS-CoV 的研究中获得很多信息。 SARS-CoV 的抗原呈递主要依赖于 MHC I 分子,但 MHC II 也有助于其呈递。

这些发现可能为合理设计 SARS-CoV-2 疫苗提供有价值的信息。 ARDS 的主要机制之一是细胞因子风暴,这是一种致命的不受控制的全身炎症反应,由 SARS-CoV 感染中的免疫效应细胞释放大量促炎细胞因子和趋化因子引起。 为了更好地在宿主细胞中存活,SARS-CoV 和 MERS-CoV 使用多种策略来避免免疫反应。 称为病原体相关分子模式的进化上保守的微生物结构可以被模式识别受体 (PRR) 识别。

抗原呈递也会受到冠状病毒的影响。 例如,与抗原呈递相关的基因表达在 MERS-CoV 感染后下调。 因此,破坏SARS-CoV-2的免疫逃避在其治疗和特异性药物开发中势在必行。

研究类型

观察性的

注册 (预期的)

200

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。

学习地点

    • Dakahlyia
      • Mansoura、Dakahlyia、埃及、35516
        • 招聘中
        • Mansoura faculty of Medicine

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

18年 及以上 (成人、OLDER_ADULT)

接受健康志愿者

不适用

有资格学习的性别

全部

取样方法

概率样本

研究人群

他们将评估在临床实践中应用不同诊断测试、监测工具和治疗方案以改善疾病结果并降低疾病负担成本的临床实用性。

简而言之,该方法将包括以下步骤:

  1. 对有 COVID-19 演变风险的患者进行早期诊断,并通过不同方式对他们进行监测和监测。
  2. 针对 COVID 19 感染的不同基因分子检测的具体实验室分析。
  3. 监测随访期间的遗传分子测试。

描述

纳入标准:

  • 感染 COVID-19 的成人受试者(> 18 岁)。将根据疾病的严重程度对患者进行分类。

排除标准:

  • -患者有发烧和/或呼吸道症状,COVID-19 PCR 阴性。

学习计划

本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的?

设计细节

队列和干预

团体/队列
感染人群
感染人群将根据严重程度分为轻度、中度或重度
易感(未感染
这群人要么暴露,要么没有被感染。
控制组
正常对照对象

研究衡量的是什么?

主要结果指标

结果测量
措施说明
大体时间
为患者
大体时间:2年
通过检测患者 ACE2 的遗传多态性来评估基因突变,并进行控制以检测哪些等位基因与 COVID-19 易感性相关,哪些等位基因与清除或保护免受感染相关。 使用等位基因鉴别 SSCP(即实时 PCR 和基因测序仪)。
2年

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

调查人员

  • 首席研究员:Mahmoud El-Bendary, M.D、Mansoura University

出版物和有用的链接

负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。

一般刊物

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (实际的)

2020年9月10日

初级完成 (预期的)

2021年10月10日

研究完成 (预期的)

2022年5月9日

研究注册日期

首次提交

2020年5月12日

首先提交符合 QC 标准的

2020年5月13日

首次发布 (实际的)

2020年5月15日

研究记录更新

最后更新发布 (实际的)

2021年2月24日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2021年2月22日

最后验证

2020年5月1日

更多信息

与本研究相关的术语

计划个人参与者数据 (IPD)

计划共享个人参与者数据 (IPD)?

药物和器械信息、研究文件

研究美国 FDA 监管的药品

研究美国 FDA 监管的设备产品

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