Genová exprese u zánětlivého onemocnění střev

V posledních letech bylo dosaženo pokroku v pochopení patologických mechanismů IBD, zejména při hledání genů náchylnosti k IBD. Vzhledem k extrémní složitosti onemocnění je však stále ještě dlouhá cesta k objasnění podrobných molekulárních mechanismů patogeneze IBD a identifikaci účinnějších terapeutických cílů. Cílem této výzkumné studie je proto odhalit genetické, mikrobiální, genové a sérologické faktory podílející se na patogenezi IBD, které mohou připravit cestu k identifikaci účinnějších terapeutických cílů.

Konkrétní cíle pro tyto cíle jsou následující:

CÍL 1: Identifikovat proteiny, které jsou změněny v expresi a posttranslační modifikaci ve střevní sliznici pacientů s aktivní UC nebo CD ve srovnání s i) nepostiženou střevní sliznicí od stejných pacientů, ii) normální střevní sliznicí u kontrolních subjektů a iii) infekční/zánětlivá kolitida (C. difficile kolitida).

CÍL 2: Identifikovat změny v expresi střevních membránových transportérů pro absorpci Na a sekreci Cl, včetně NHE3, ve střevní sliznici pacientů s aktivní UC nebo CD ve srovnání s i) nepostiženou střevní sliznicí od stejných pacientů, ii) normální střevní sliznicí u kontrolních subjektů a iii) infekční/zánětlivá kolitida (C. difficile kolitida). Cílený screening bude také zahrnovat několik proteinů obsahujících PDZ asociovaných s kartáčkovým lemem střevního epitelu, u kterých bylo nedávno prokázáno, že regulují přenos a aktivitu membránových transportérů.

CÍL 3: Podstudie enteroidů - Porovnat fyziologickou regulaci absorpce Na, sekrece Cl, sekrece proteinů a dalších střevních fyziologických procesů u případů IBD, jiných případů infekční kolitidy a zdravých kontrol, protože tyto procesy se často mění s aktivitami onemocnění. Tyto procesy budou studovány prostřednictvím vývoje samo se množících kultivačních modelů nazývaných organoidy nebo enteroidy. Kultivační modely jsou vyvinuty z bioptických vzorků odebraných z horní části tenkého střeva, včetně duodena a jejuna, dolního tenkého střeva (ilea) a proximálního a distálního tračníku a používají se k růstu organoidů/enteroidů. Jedná se o ministřeva, která mají celé osy klků krypt, které rostou v kultuře a mohou být v kultuře udržovány při životě po neomezenou dobu.

CÍL 4: Mechanismus střevního zánětu Dílčí studie - Porozumět mechanismům zapojeným do recidivy zánětu po resekci ilea u Crohnovy choroby (CD). Důvody recidivy jsou v současnosti neznámé, ale předpokládá se, že jsou způsobeny interakcí genetických, imunitních a mikrobiálních vlastností. Informace získané z této studie budou použity k sestavení prediktivního modelu k identifikaci pacientů s vyšším rizikem rychlé recidivy a pomohou lékařům přizpůsobit následnou léčbu.

CÍL 5: Dílčí studie demarkace UC - Získat další pochopení mechanismů zapojených do náchylnosti k zánětu a vzplanutí zánětu u pacientů s UC. Vzorky krve, stolice, moči, slin, výplachů a tkání od pacientů s UC budou použity ke studiu genetických, mikrobiálních, metabolických a imunitních faktorů podílejících se na remisi a vzplanutí onemocnění. Informace získané z této studie budou také použity k vytvoření prediktivního modelu toho, u kterých pacientů je větší riziko vzplanutí onemocnění a u kterých je méně pravděpodobné, že tak učiní, což lékařům umožní odpovídajícím způsobem přizpůsobit následnou léčbu.