Genuttryck vid inflammatorisk tarmsjukdom

Framsteg har gjorts under de senaste åren för att förstå de patologiska mekanismerna för IBD, särskilt i sökandet efter IBD-känslighetsgener. Men på grund av sjukdomarnas extrema komplexitet finns det fortfarande en lång väg framåt när det gäller att belysa detaljerade molekylära mekanismer för IBD-patogenes och identifiera mer effektiva terapeutiska mål. Därför är det målet med denna forskningsstudie att upptäcka genetiska, mikrobiella, genuttryck och serologiska faktorer som är involverade i patogenesen av IBD, vilket kan bana väg för identifiering av mer effektiva terapeutiska mål.

De specifika målen för dessa mål är följande:

SYFTE 1: Identifiera proteiner som förändras i uttryck och posttranslationell modifiering i tarmslemhinnan hos patienter med aktiv UC eller CD jämfört med i) oinvolverad tarmslemhinna från samma patienter, ii) normal tarmslemhinna hos kontrollpersoner och iii) infektiös/inflammatorisk kolit (C. difficile kolit).

SYFTE 2: Identifiera förändringar i uttrycket av tarmmembrantransportörer för Na-absorption och Cl-sekretion, inklusive NHE3, i tarmslemhinnan hos patienter med aktiv UC eller CD jämfört med i) oinvolverad tarmslemhinna från samma patienter, ii) normal tarmslemhinna hos kontrollpersoner och och iii) infektiös/inflammatorisk kolit (C. difficile kolit). Den riktade screeningen kommer också att inkludera flera intestinala epitelial borste gräns-associerade PDZ-innehållande proteiner som nyligen har visat sig reglera trafficking och aktivitet av membrantransportörer.

SYFTE 3: Enteroid delstudie - Att jämföra den fysiologiska regleringen av Na-absorption, Cl-sekretion, proteinsekretion och andra intestinala fysiologiska processer i IBD-fall, andra infektiösa kolitfall och friska kontroller eftersom dessa processer ofta förändras med sjukdomsaktiviteter. Processerna kommer att studeras genom utveckling av självförökande kulturmodeller som kallas organoider eller enteroider. Odlingsmodellerna är utvecklade från biopsiprov tagna från övre tunntarmen, inklusive tolvfingertarmen och jejunum, nedre tunntarmen (ileum) och proximala och distala kolon och används för att odla organoider/enteroider. Dessa är minitarmarna som har hela kryptvillusyxorna som växer i kultur och kan hållas vid liv i oändlighet i kulturen.

MÅL 4: Mechanism of Intestinal Inflammation Sub-studie - Att förstå mekanismerna involverade i återfall av inflammation efter ileal resektionskirurgi för Crohns sjukdom (CD). Orsaker till återfall är för närvarande okända men tros vara orsakade av en interaktion mellan genetiska, immunförsvar och mikrobiella egenskaper. Informationen från denna studie kommer att användas för att bygga en prediktiv modell för att identifiera de patienter som löper större risk för snabbt återfall, och kommer att hjälpa läkare att skräddarsy uppföljningsbehandlingar.

SYFTE 5: UC Demarkation Sub-studie - Att få ytterligare förståelse för de mekanismer som är involverade i känsligheten för och flare av inflammation hos UC-patienter. Blod, avföring, urin, saliv, sköljning och vävnadsprover från UC-patienter kommer att användas för att studera de genetiska, mikrobiella, metabola och immunfaktorer som är involverade i sjukdomens remission och uppblossning. Information från denna studie kommer också att användas för att bygga en prediktiv modell för vilka patienter som löper större risk för sjukdomsutbrott och vilka som är mindre benägna att göra det, vilket gör det möjligt för läkare att skräddarsy uppföljningsbehandlingar därefter.