Minimální reziduální nemoc jako možný prediktivní faktor pro relaps u pacientů s AL amyloidózou

Tento protokol bude hodnotit pacienty s AL amyloidózou, kteří dosáhnou CR nebo VGPR k léčbě první linie, na průkaz MRD pomocí Q-PCR, NGS a analýzy plazmatických proteinů pomocí hmotnostní spektrometrie s použitím buněk kostní dřeně získaných každoročně v době standardních klinických hodnocení.

Vzorek aspirátu kostní dřeně z diagnózy bude použit k vytvoření základního profilu onemocnění každého pacienta. Tento vzorek umožní výzkumníkům vytvořit sady primer-sonda požadované pro testování MRD pomocí Q-PCR, které bude provedeno poté, co pacient dosáhne CR nebo VGPR. Základní vzorek biopsie kostní dřeně bude buď odebrán v době souhlasu, nebo může být odebrán ze skladu, pokud pacient dříve souhlasil s uložením buněk své dřeně pro výzkumné účely. Z jejich diagnostické biopsie kostní dřeně, která se běžně provádí u nově diagnostikovaných pacientů pro klinické účely, bude odebráno dalších 15 ml aspirátu. Roční aspiráty kostní dřeně nebudou pro výzkumné účely odebrány, dokud pacient nezareaguje. Pacienti zůstanou podle protokolu, ale testování MRD zahájí až po dosažení CR nebo VGPR k terapii první linie, kdy začnou roční odběry dřeně pro testování MRD. V případě, že pacient nedosáhne CR nebo VGPR k terapii první linie, výchozí aspirát kostní dřeně z diagnózy bude vyřazen.

Pacienti, kteří se rozhodnou povolit použití své dřeně v této studii, podepíší formulář souhlasu speciálně pro tuto studii. V době souhlasu budou odebrány tři zelené horní zkumavky periferní krve pro WGS nenádorových buněk. Pro tuto studii nebudou vyžadovány žádné další vzorky krve. Po dosažení CR nebo VGPR budou pacienti v ročních intervalech kompletně přeřazeni na standardní péči. Vzorky pro testování přítomnosti MRD v jejich dřeních budou odebírány v těchto časech klinického přestavování po dobu až 3 let po jejich odpovědi na terapii. Vzorky krve i kostní dřeně pro tuto studii budou okamžitě odebrány do místní laboratoře, kde budou před testováním krátce uloženy. To zajistí, že žádné studijní vzorky nebudou narušovat běžnou klinickou péči.

Pro testování přítomnosti MRD budou použity tři techniky: Q-PCR, WGS a analýza plazmatických proteinů pomocí hmotnostní spektrometrie. Q-PCR i WGS budou používat genomovou DNA ze vzorků aspirátu dřeně. K vytvoření sad primer-sonda pro Q-PCR budou vzorky kostní dřeně ze základní linie použity k vytvoření individualizovaných sad primer-sonda, které dokážou rozpoznat geneticky jedinečný gen LC, který způsobuje onemocnění každého pacienta. Pro provedení WGS bude genomová DNA dodána do hlavní genetické laboratoře pro vytvoření knihovny a multiplexního sekvenování nové generace. Pro provedení analýzy plazmatických proteinů bude plazma izolována z části vzorků periferní krve a aspirátu kostní dřeně každého subjektu v laboratoři na místě. Deidentifikovaná sekvence genu LC každého subjektu a jejich deidentifikované vzorky plazmy budou poté odeslány do Memorial Sloan-Kettering Cancer Center (MSKCC) pro hmotnostní spektrometrii, aby se hledaly fragmentární proteinové sekvence spojené s viníkem genu LC každého subjektu.

Po dosažení CR nebo VGPR se při ročních hodnoceních po dobu až 3 let použije genomová DNA z výzkumného vzorku kostní dřeně odebrané během standardních klinických postupů k potvrzení udržení odpovědi testováním na přítomnost MRD s každým ze 3 metod (Q-PCR, WGS a analýza plazmatických proteinů) uvedených výše. Materiál kostní dřeně odebraný pro účely této studie nebude po analýze uchováván a návrh sady primer-sonda bude prováděn výhradně v Tufts Medical Center. Všechny vzorky dřeně, které nebyly během analýzy plně spotřebovány, budou zničeny.

Pomocí těchto tří metod tento protokol určí, zda je jedna metoda lepší než ostatní a zda tyto tři metody poskytují výsledky, které spolu korelují. Rozhodnutí o ukončení účasti na testování MRD učiní pacient a lékař individuálně. Pacienti, u kterých dojde během tříletého období k relapsu nebo hematologické progresi onemocnění podle standardních krevních a močových testů, již nebudou testováni na MRD.