Minimal resterende sygdom som en mulig forudsigelig faktor for tilbagefald hos patienter med AL-amyloidose

Denne protokol vil vurdere AL-amyloidosepatienter, der opnår en CR eller VGPR til førstelinjebehandling for tegn på MRD ved Q-PCR, NGS og plasmaproteinanalyse ved massespektrometri ved hjælp af marvceller opnået årligt på tidspunkter for kliniske standardevalueringer.

En knoglemarvsaspiratprøve fra diagnosen vil blive brugt til at skabe en basislinjeprofil for hver patients sygdom. Denne prøve vil give efterforskerne mulighed for at skabe de primer-probesæt, der kræves til MRD-testning ved Q-PCR, som vil blive udført, efter at patienten har opnået en CR eller VGPR. En baseline knoglemarvsbiopsiprøve vil enten blive taget på tidspunktet for samtykke eller kan tages fra opbevaring, hvis patienten tidligere har givet sit samtykke til at få deres marvceller banket til forskningsformål. En ekstra 15 ml aspirat vil blive taget fra deres diagnostiske knoglemarvsbiopsi, som rutinemæssigt udføres på nydiagnosticerede patienter til kliniske formål. Årlige knoglemarvsaspirater vil ikke blive taget til forskningsformål, før patienten har reageret. Patienterne forbliver på protokollen, men begynder først MRD-testning efter at have opnået en CR eller VGPR til førstelinjebehandling, hvorefter årlige marvopsamlinger til MRD-testning vil begynde. I tilfælde af at patienten ikke når en CR eller VGPR til førstelinjebehandling, vil baseline knoglemarvsaspiratet fra diagnosen blive kasseret.

Patienter, der vælger at tillade, at deres marv bruges i denne undersøgelse, vil underskrive en samtykkeerklæring specifikt til denne undersøgelse. På tidspunktet for samtykke vil der blive opnået tre grønne toprør med perifert blod til WGS af ikke-tumorceller. Der kræves ingen yderligere blodprøver til denne undersøgelse. Efter at have opnået en CR eller VGPR, vil patienterne blive fuldstændig genoptaget som standardbehandling med årlige intervaller. Prøver til at teste for tilstedeværelsen af ​​MRD i deres marve vil blive opnået på disse tidspunkter for klinisk genopbygning i op til 3 år efter deres respons på behandlingen. Både blod- og knoglemarvsprøver til denne undersøgelse vil straks blive taget til et laboratorium på stedet, hvor de vil blive opbevaret kort før testning. Dette vil sikre, at ingen undersøgelsesprøver forstyrrer rutinemæssig klinisk pleje.

For at teste for tilstedeværelsen af ​​MRD vil tre teknikker blive brugt: Q-PCR, WGS og plasmaproteinanalyse ved massespektrometri. Både Q-PCR og WGS vil bruge genomisk DNA fra marv-aspiratprøver. For at lave primer-probe-sæt til Q-PCR, vil knoglemarvsprøver fra baseline blive brugt til at skabe individualiserede primer-probe-sæt, der kan genkende det genetisk unikke LC-gen, der forårsager hver patients sygdom. For at udføre WGS vil genomisk DNA blive leveret til kernegenetiklaboratoriet for oprettelse af et bibliotek og multiplex næste generations sekventering. For at udføre plasmaproteinanalyse vil plasma blive isoleret fra en del af hvert individs perifere blod- og knoglemarvsaspiratprøver i et laboratorium på stedet. Hvert individs de-identificerede LC-gensekvens og deres de-identificerede plasmaprøver vil derefter blive sendt til Memorial Sloan-Kettering Cancer Center (MSKCC) til massespektrometri for at lede efter fragmentariske proteinsekvenser forbundet med den skyldige LC-gen for hvert individ.

Efter opnåelse af en CR eller VGPR, ved årlige evalueringer i op til 3 år, vil det genomiske DNA fra forskningsprøven af ​​knoglemarv indsamlet under kliniske standardprocedurer blive brugt til at bekræfte opretholdelse af respons ved at teste for tilstedeværelsen af ​​MRD med hver af de 3 metoder (Q-PCR, WGS og plasmaproteinanalyse) nævnt ovenfor. Marvmateriale indsamlet til formålet med denne undersøgelse vil ikke blive opbevaret efter analyse, og primer-probe sæt design vil blive udført udelukkende inden for Tufts Medical Center. Marvprøver, der ikke er fuldt forbrugt under analysen, vil blive destrueret.

Ved at bruge disse tre metoder vil denne protokol afgøre, om en metode er bedre end de andre, og om de tre metoder producerer resultater, der korrelerer med hinanden. Beslutningen om at afbryde deltagelse i MRD-test tages af patienten og lægen på individuel basis. Patienter, som har tilbagefald eller hæmatologisk progression af sygdommen i løbet af treårsperioden ved standard blod- og urinprøver, vil ikke længere have test for MRD.