Minimal kvarvarande sjukdom som en möjlig prediktiv faktor för återfall hos patienter med AL-amyloidos

Detta protokoll kommer att bedöma AL-amyloidospatienter som uppnår en CR eller VGPR till första linjens terapi för bevis på MRD genom Q-PCR, NGS och plasmaproteinanalys genom masspektrometri med användning av märgceller som erhålls årligen vid tidpunkter för kliniska standardutvärderingar.

Ett benmärgsaspiratprov från diagnos kommer att användas för att skapa en baslinjeprofil för varje patients sjukdom. Detta prov gör det möjligt för utredarna att skapa de primer-probuppsättningar som krävs för MRD-testning med Q-PCR, som kommer att utföras efter att patienten har uppnått en CR eller VGPR. Ett baslinjeprov från benmärgsbiopsi kommer antingen att tas vid tidpunkten för samtycke eller kan tas från förvaring om patienten tidigare har samtyckt till att få sina märgceller samlade för forskningsändamål. Ytterligare 15 ml aspirat kommer att tas från deras diagnostiska benmärgsbiopsi, som rutinmässigt utförs på nydiagnostiserade patienter för kliniska ändamål. Årliga benmärgsaspirationer tas inte för forskningsändamål förrän efter att patienten har svarat. Patienterna kommer att fortsätta med protokollet, men påbörjar MRD-testning först efter att ha uppnått en CR eller VGPR till förstahandsbehandling, vid vilken tidpunkt årliga märgsamlingar för MRD-testning kommer att börja. I händelse av att patienten inte når en CR eller VGPR till första linjens behandling, kommer benmärgsaspiraten från diagnosen att kasseras.

Patienter som väljer att låta sin märg användas i denna studie kommer att underteckna ett samtyckesformulär specifikt för denna studie. Vid tidpunkten för samtycke kommer tre gröna topprör med perifert blod att erhållas för WGS av icke-tumörceller. Inga ytterligare blodprover kommer att krävas för denna studie. Efter att ha uppnått en CR eller VGPR, kommer patienterna att vara helt återställda, vilket är standardvård med årliga intervall. Prover för att testa förekomsten av MRD i deras märg kommer att erhållas vid dessa tidpunkter av klinisk omstadieindelning i upp till 3 år efter deras svar på behandlingen. Både blod- och benmärgsprover för denna studie kommer omedelbart att tas till ett laboratorium på plats där de kommer att förvaras en kort stund före testning. Detta säkerställer att inga studieprover stör rutinmässig klinisk vård.

För att testa förekomsten av MRD kommer tre tekniker att användas: Q-PCR, WGS och plasmaproteinanalys genom masspektrometri. Både Q-PCR och WGS kommer att använda genomiskt DNA från märgspiratprover. För att göra primer-prob-set för Q-PCR kommer benmärgsprover från baslinjen att användas för att skapa individualiserade primer-prob-set som kan känna igen den genetiskt unika LC-genen som orsakar varje patients sjukdom. För att utföra WGS kommer genomiskt DNA att levereras till kärngenetiklaboratoriet för att skapa ett bibliotek och multiplex nästa generations sekvensering. För att utföra plasmaproteinanalys kommer plasma att isoleras från en del av varje individs perifera blod- och benmärgsaspiratprover i ett laboratorium på plats. Varje individs avidentifierade LC-gensekvens och deras avidentifierade plasmaprover kommer sedan att skickas till Memorial Sloan-Kettering Cancer Center (MSKCC) för masspektrometri för att leta efter fragmentariska proteinsekvenser associerade med den skyldige LC-genen för varje individ.

Efter att ha uppnått en CR eller VGPR, vid årliga utvärderingar i upp till 3 år, kommer det genomiska DNA:t från forskningsprovet av benmärg som samlats in under kliniska standardprocedurer att användas för att bekräfta bibehållande av respons genom att testa förekomsten av MRD med varje av de tre metoderna (Q-PCR, WGS och plasmaproteinanalys) som noterats ovan. Märgmaterial som samlas in för denna studie kommer inte att lagras efter analys, och design av primer-probe kommer att utföras helt inom Tufts Medical Center. Alla märgprover som inte är helt förbrukade under analysen kommer att förstöras.

Genom att använda dessa tre metoder kommer detta protokoll att avgöra om en metod är överlägsen de andra och om de tre metoderna ger resultat som korrelerar med varandra. Beslutet att avbryta deltagandet i MRD-testning kommer att fattas av patienten och läkaren på individuell basis. Patienter som har återfall eller hematologisk progression av sjukdomen under treårsperioden genom standardblod- och urintester kommer inte längre att ha testning för MRD.