Hodnocení mnohočetných proteinových a molekulárních biomarkerů k odhadu rizika rakoviny u gynekologických pacientek s pánevní hmotou. (EMBER)

Tato studie je ve své podstatě průzkumná a je navržena tak, aby generovala hypotézy na podporu návrhu budoucích studií. Ženy s diagnózou pánevní hmoty (ovariální, děložní, retroperitoneální atd.), které jsou naplánovány na zobrazovací řízenou biopsii, chirurgickou biopsii nebo chirurgickou excizi za účelem vyhodnocení jejich pánevní hmoty. Odhaduje se, že do hodnocení primárních a průzkumných cílových bodů bude zařazeno přibližně 200 žen. Zařazení do studie bude pokračovat po více než 200 ženách, pokud to bude nutné, aby bylo získáno minimálně 50 hodnotitelných žen s histopatologicky potvrzenou malignitou, včetně ovariální, vejcoplodé, peritoneální, endometriální, cervikální atd.

Do 60 dnů před procedurou hodnocení pánevní hmoty musí každý subjekt podstoupit vyšetření pánve (např. ultrazvuk, CT sken, MRI atd.) provedené a odečtené k vizualizaci pánevní hmoty podle aktuálního standardu péče. Výsledky studie(í) pánevního zobrazení budou zaznamenány.

Do 30 dnů před nebo v den procedury hodnocení pánevní hmoty odeberte až 35 ml plné krve do jedné 5ml zkumavky SST, kterou je třeba odebrat jako první, a poté tři samostatné zkumavky s 10 ml EDTA. Sérum ze zkumavky SST bude použito pro testování proteinových biomarkerů. Krev ze zkumavek s EDTA bude shromážděna a zpracována v systému Parsortix™ k zachycení a sklizni vzácných buněk. Zachycené vzácné buňky budou eluovány (sklizeny) a lyžovány a celková RNA bude extrahována z buněčného lyzátu pro hodnocení více genových cílů.

Zobrazovací řízenou biopsii, chirurgickou biopsii nebo chirurgickou excizi pro hodnocení pánevní hmoty provede kvalifikovaná osoba. Vzorky tkání budou zaslány na místní patologické oddělení k histologickému vyšetření v souladu se standardními ústavními zvyklostmi. Výsledky histopatologického hodnocení budou zaznamenány, včetně konečné diagnózy spolu s histologickým podtypem, a pokud je k dispozici, stadiem rakoviny, kde je onemocnění identifikováno. Tam, kde je to možné, budou získány reprezentativní vzorky čerstvé zmrazené tkáně z pánevní hmoty pro výzkumné účely pro hodnocení stejných cílů genu mRNA použitých při sklizni buněk.

Subjekty budou považovány za negativní na malignitu:

• pokud subjekt podstoupí chirurgický zákrok a není identifikován žádný útvar, nebo;
• pokud jsou histopatologické nálezy negativní na malignitu (tj. benigní stavy).

Subjekty budou považovány za pozitivní na malignitu:

• pokud histologické vyšetření tkáně odebrané v době biopsie nebo chirurgického zákroku potvrdí přítomnost zhoubného nádoru (tj. rakoviny vaječníků, primární peritoneální rakoviny, vejcovodů, endometria, dělohy, děložního čípku, metastatické rakoviny atd.).

Pro účely zařazení budou jedinci s diagnostikovaným nízkým maligním potenciálem (LMP) / borderline tumory považováni za benigní (negativní na malignitu). Budou však provedeny dvě samostatné analýzy konečných dat studie: jedna, kde jsou jedinci diagnostikovaní s nízkým maligním potenciálem (LMP) / hraniční nádory klasifikováni jako negativní na malignitu, a druhá, kdy jsou tito jedinci klasifikováni jako pozitivní na malignitu.

U subjektů s diagnózou zhoubného nádoru bude po dobu až 5 let po jejich zařazení do studie prováděna dvouletá kontrola lékařského záznamu, aby se shromáždily informace týkající se jejich odpovědi na léčbu, citlivosti a rezistence na chemoterapii, doby do recidivy, doby do progrese a celkové přežití.

S využitím klinických informací, sérových biomarkerů a mRNA markerů bude sestaven algoritmus pro predikci benigního vs. maligního onemocnění. Další analýzy mohou být prováděny v rámci a mezi různými histopatologickými diagnostickými podskupinami. Výběr proměnných a konstrukce algoritmu budou prováděny pomocí různých statistických metod, jako je logistická regrese, hierarchické shlukování, klasifikační a regresní stromy (CART), vyhodnocení ROC křivky, analýza citlivosti/specifičnosti, vizuální vykreslování pro stanovení prahů atd. Vstupy pro vyhodnocení mohou zahrnovat spojité proměnné (např. věk, ovariální a dominantní hmotnostní rozměry, výsledky sérových biomarkerů, hladiny exprese mRNA atd.), kategorické proměnné (např. věkové skupiny, výsledky biomarkerů podle rozsahů, úrovně exprese mRNA podle rozsahů atd.) a/nebo binární proměnné (např. přítomnost nebo nepřítomnost konkrétních rizikových faktorů a/nebo zobrazovacích znaků, věk nad nebo pod určitou prahovou hodnotou, menopauzální stav, výsledky biomarkerů nad nebo pod konkrétní prahovou hodnotou, hladiny exprese mRNA nad nebo pod konkrétní prahovou hodnotou atd.). Prahová hodnota pro výsledný výstup algoritmu(ů) pro rozlišení mezi benigním a maligním onemocněním (nebo jejich podskupinou, jako jsou pouze pacienti s epiteliálním karcinomem vaječníků) bude vybrána tak, aby optimalizovala citlivost při nastavené specificitě (např. maximalizovat citlivost při minimální úrovni specifičnosti > 80 %).

Po dokončení období dlouhodobého sledování bude pomocí vhodných statistických metod hodnocena souvislost klinických dat a markerů s léčebnou odpovědí subjektu, citlivostí a rezistencí na chemoterapii, dobou do recidivy, dobou do progrese a celkovým přežitím ( např. 2x2 tabulky, korelační analýzy, Coxova regrese rizik, Kaplan-Meierovy grafy atd.).