Useiden proteiinien ja molekyylien biomarkkereiden arviointi syöpäriskin arvioimiseksi gynekologisilla potilailla, joilla on lantion massaa. (EMBER)

Tämä tutkimus on luonteeltaan tutkiva, ja se on suunniteltu luomaan hypoteesia tukemaan tulevien tutkimusten suunnittelua. Naiset, joilla on diagnosoitu lantion massa (munasarja, kohtu, retroperitoneaalinen jne.), joille on määrätty kuvantamisohjattu biopsia, kirurginen biopsia tai kirurginen leikkaus lantion massan arvioimiseksi. Arvioiden mukaan noin 200 naista otetaan mukaan arvioimaan ensisijaisia ​​ja tutkivia päätepisteitä. Tutkimukseen otetaan tarvittaessa mukaan yli 200 naista, jotta saadaan vähintään 50 arvioitavissa olevaa naista, joilla on histopatologisesti vahvistettu maligniteetti, mukaan lukien munasarjat, munanjohtimet, vatsakalvon, kohdun limakalvon, kohdunkaulan jne.

Jokaisella koehenkilöllä on 60 päivän sisällä ennen lantion massan arviointia lantion kuvantamistutkimus (esim. ultraääni, CT-skannaus, MRI jne.) suoritettiin ja luetaan lantion massan visualisoimiseksi nykyisen hoitostandardin mukaisesti. Lantion kuvantamistutkimuksen (tutkimusten) tulokset kirjataan.

Kerää enintään 35 ml kokoverta yhteen 5 ml:n SST-putkeen 30 päivän kuluessa ennen lantion massan arviointimenettelyä tai sen päivänä, joka on otettava ensin ja sen jälkeen kolme erillistä 10 ml:n EDTA-putkea. SST-putken seerumia käytetään proteiinien biomarkkerien testaamiseen. Veri EDTA-putkista yhdistetään ja käsitellään Parsortix™-järjestelmässä harvinaisten solujen sieppaamiseksi ja keräämiseksi. Siepatut harvinaiset solut eluoidaan (kerätään talteen) ja hajotetaan, ja kokonais-RNA uutetaan solulysaatista useiden geenikohteiden arvioimiseksi.

Pätevä henkilö suorittaa kuvantamisohjatun biopsian, kirurgisen biopsian tai kirurgisen leikkauksen lantion massan arvioimiseksi. Kudosnäytteet lähetetään paikalliselle patologian osastolle histologiseen tutkimukseen laitoskäytäntöjen mukaisesti. Histopatologisen arvioinnin tulokset kirjataan, mukaan lukien lopullinen diagnoosi sekä syövän histologinen alatyyppi ja, jos saatavilla, vaihe, jossa sairaus tunnistetaan. Lantion massasta otetaan mahdollisuuksien mukaan edustavia tuoreita pakastekudosnäytteitä tutkimustarkoituksiin samojen solukeräyksissä käytettyjen mRNA-geenikohteiden arvioimiseksi.

Koehenkilöt katsotaan negatiivisiksi pahanlaatuisuuden suhteen:

• jos kohteelle tehdään leikkaus eikä massaa tunnisteta, tai
• jos histopatologiset löydökset ovat negatiivisia pahanlaatuisuuden suhteen (esim. hyvänlaatuiset tilat).

Koehenkilöt katsotaan positiivisiksi maligniteettien suhteen:

• jos biopsian tai leikkauksen yhteydessä otettu kudoksen histologinen tutkimus vahvistaa pahanlaatuisen kasvaimen olemassaolon (esim. munasarja-, primaarinen vatsakalvon, munanjohtimen, endometriumin, kohdun, kohdunkaulan syövät, metastaattiset syövät jne.).

Rekisteröintiä varten henkilöt, joilla on diagnosoitu alhainen pahanlaatuisuuspotentiaali (LMP) / rajakasvaimet, katsotaan hyvänlaatuisiksi (negatiivisiksi pahanlaatuisten kasvainten suhteen). Lopullisista tutkimustiedoista tehdään kuitenkin kaksi erillistä analyysiä: yksi, jossa koehenkilöt, joilla on diagnosoitu alhainen maligniteettipotentiaali (LMP) / rajakasvaimet, luokitellaan negatiivisiksi maligniteettien suhteen ja toisen kerran, jossa nämä koehenkilöt luokitellaan maligniteetin suhteen positiivisiksi.

Potilaille, joilla on diagnosoitu pahanlaatuinen kasvain, potilastiedot tarkistetaan kahdesti vuodessa enintään viiden vuoden ajan tutkimukseen ilmoittautumisen jälkeen kerätäkseen tietoa heidän hoitovasteestaan, kemoterapian herkkyydestä ja vastustuskyvystä, uusiutumiseen kuluvasta ajasta, etenemisajasta ja kokonaisuudesta. eloonjääminen.

Algoritmi hyvänlaatuisen vs. pahanlaatuisen taudin ennustamiseksi rakennetaan käyttämällä kliinisiä tietoja, seerumin biomarkkereita ja mRNA-markkereita. Lisäanalyysejä voidaan tehdä eri histopatologisen diagnoosin alaryhmissä ja niiden välillä. Muuttujien valinta ja algoritmien rakentaminen tehdään erilaisilla tilastollisilla menetelmillä, kuten logistinen regressio, hierarkkinen klusterointi, luokitus- ja regressiopuut (CART), ROC-käyrän arviointi, herkkyys/spesifisyysanalyysi, visuaalinen piirtäminen kynnysarvojen määrittämiseksi jne. Arvioinnin syötteet voivat sisältää jatkuvia muuttujia (esim. ikä, munasarjan ja hallitsevan massan mitat, seerumin biomarkkeritulokset, mRNA:n ilmentymistasot jne.), kategorialliset muuttujat (esim. ikäryhmät, biomarkkeritulokset vaihteluvälien mukaan, mRNA:n ilmentymistasot vaihteluvälien mukaan jne.) ja/tai binääriset muuttujat (esim. tiettyjen riskitekijöiden ja/tai kuvantamisominaisuuksien läsnäolo tai puuttuminen, ikä tietyn kynnyksen ylä- tai alapuolella, menopausaalinen tila, biomarkkeritulokset tietyn kynnyksen ylä- tai alapuolella, mRNA:n ilmentymistasot tietyn kynnyksen ylä- tai alapuolella jne.). Tuloksena olevan algoritmin (tulostusalgoritmien) kynnys hyvänlaatuisen ja pahanlaatuisen taudin (tai niiden alaryhmän, kuten vain epiteelin munasarjasyöpäpotilaiden) erottamiseksi valitaan herkkyyden optimoimiseksi tietyllä spesifisyydellä (esim. maksimoida herkkyys vähintään >80 %:n spesifisyystasolla.

Pitkän seurantajakson päätyttyä kliinisten tietojen ja merkkiaineiden yhteys potilaan hoitovasteeseen, kemoterapian herkkyyteen ja resistenssiin, uusiutumiseen kuluvaan aikaan, etenemiseen kuluvaan aikaan ja kokonaiseloonjäämiseen arvioidaan asianmukaisin tilastollisin menetelmin ( esim. 2x2 taulukkoa, korrelaatioanalyysit, Cox-hazards -regressio, Kaplan-Meier-kaavio, jne.).