Vývoj nových fekálních mikrobiálních biomarkerů pro zánětlivá střevní onemocnění

Zánětlivé onemocnění střev (IBD), včetně Crohnovy choroby (CD) a ulcerózní kolitidy (UC), je chronické idiopatické zánětlivé onemocnění střeva, které má za následek průjem, krvácení z konečníku, nutkání, úbytek hmotnosti a bolesti břicha. Přirozený průběh IBD je charakterizován propuknutím aktivity a obdobími remise.

Ke sledování onemocnění byla použita endoskopie, která je však časově náročná, nákladná, invazivní a spojená s určitými riziky morbidity. Mnoho pacientů se zdráhá podstupovat opakovaná endoskopická vyšetření, zvláště když je jejich onemocnění v klidu. Reaktanty akutní fáze byly použity k monitorování onemocnění včetně C-reaktivního proteinu a markerů leukocytů ve stolici včetně fekálního kalprotektinu, ale jejich citlivost a specifita ve vztahu k aktivitě střevního zánětu je nízká. Klinický problém heterogenity pacientů ve fenotypu onemocnění a odpovědi na terapii přispěl k objevu biomarkerů souvisejících s onemocněním. U IBD byly trvale hlášeny změněné fekální mikrobioty, které zahrnovaly snížení biologické rozmanitosti s nižším podílem Firmicutes a zvýšením členů kmene Proteobacteria a Bacteroidetes. Kromě toho je celková bakteriální diverzita u pacientů s IBD ve srovnání s kontrolami trvale snížena. I když řada fekálních biomarkerů byla hodnocena z hlediska jejich užitečnosti pro diagnostiku onemocnění u IBD, dosud žádný nebyl dostatečně přesný pro klinickou aplikaci. Proto je zaručena identifikace a validace neinvazivního biomarkeru, který lze snadno použít při diagnostice a prognóze onemocnění, aby poskytla časnější příležitost zasáhnout.

V této studii si klade za cíl vyvinout model založený na metagenomice využívající fekální mikrobiální biomarkery pro odlišení pacientů s IBD od zdravých kontrol a poté validovat tyto fekální mikrobiální biomarkery v různých populacích.

Jedná se o průřezovou multicentrickou studii. Z každého centra budou vybrány dvě skupiny subjektů, pacienti s IBD (případy) a zdraví jedinci (kontroly). Každé centrum poskytne vzorky stolice z 80-100 Crohnovy choroby, 80-100 ulcerózní kolitidy a 80-100 kontrol. Od každého subjektu shromáždíme klinická data a vzorek stolice. Složení fekální mikroflóry bude porovnáno mezi případy a kontrolami. Bude hodnocena hojnost bakteriálních biomarkerů a bude ověřena účinnost diagnostického modelu.