Udvikling af nye fækale mikrobielle biomarkører for inflammatorisk tarmsygdom

Inflammatorisk tarmsygdom (IBD), herunder Crohns sygdom (CD) og colitis ulcerosa (UC), er en kronisk idiopatisk betændelsestilstand i tarmen, som resulterer i diarré, rektal blødning, haster, vægttab og mavesmerter. Det naturlige forløb af IBD er karakteriseret ved aktivitetsudbrud og perioder med remission.

Endoskopi er blevet brugt til at overvåge sygdommen, men det er tidskrævende, dyrt, invasivt og forbundet med visse risici for morbiditet. Mange patienter er tilbageholdende med at gennemgå gentagne endoskopiske undersøgelser, især når deres sygdom er stille. Akutfasereaktanter er blevet brugt til at overvåge sygdom, herunder C-reaktivt protein og afførings-leukocytmarkører, herunder fækalt calprotectin, men deres sensitivitet og specificitet i forhold til intestinal inflammationsaktivitet er lav. Klinisk udfordring af patientens heterogenitet i sygdomsfænotype og respons på terapi har forværret opdagelsen af ​​sygdomsrelaterede biomarkører. Ved IBD er der konsekvent rapporteret om ændrede fækale mikrobiotasignaturer, som inkluderede en reduktion i biodiversitet med lavere andele af Firmicutes og stigninger i Proteobacteria og Bacteroidetes phylum medlemmer. Desuden er den overordnede bakteriediversitet konsekvent nedsat hos IBD-patienter sammenlignet med kontroller. Selvom en række fækale biomarkører er blevet evalueret for deres anvendelighed til sygdomsdiagnose ved IBD, har ingen til dato været nøjagtige nok til klinisk anvendelse. Derfor er identifikation og validering af en ikke-invasiv biomarkør, som let kan anvendes i sygdomsdiagnose og prognose, berettiget for at give en tidligere mulighed for at gribe ind.

I denne undersøgelse sigter den mod at udvikle en metagenomisk-baseret model ved hjælp af fækale mikrobielle biomarkører til at differentiere IBD-patienter fra raske kontroller og derefter validere disse fækale mikrobielle biomarkører i forskellige populationer.

Dette er en tværgående multicenterundersøgelse. To grupper af forsøgspersoner, IBD-patienter (tilfælde) og raske forsøgspersoner (kontroller), vil blive rekrutteret fra hvert center. Hvert center vil give afføringsprøver fra 80-100 Crohns sygdom, 80-100 colitis ulcerosa og 80-100 kontroller. Vi vil indsamle kliniske data og afføringsprøve fra hvert individ. Fækal mikrobiotasammensætning vil blive sammenlignet mellem tilfælde og kontroller. Mængden af ​​bakterielle biomarkører vil blive vurderet, og effektiviteten af ​​en diagnostisk model vil blive valideret.