Metagenomisk næste generations sekvensering til diagnosticering af ascitesinfektion ved leversygdomme i slutstadiet

Ascites er den mest almindelige komplikation af skrumpelever, og dens udvikling er forbundet med væsentligt øget dødelighed. Ascitesinfektion inklusive spontan bakteriel peritonitis (SBP), bakterascites og svampeinfektioner. SBP er en af ​​de mest frygtede komplikationer af ascites. EASL-retningslinjerne anbefaler, at diagnostiske kriterier for SBP defineres på antallet af ascitesvæske polymorfonukleære leukocytter (PMN) ≥250 celler/μl, med eller uden ascitesvæske positiv kultur. Dog i klinisk praksis. Op til 30 % af indlagte patienter betragtes som mistænkelige SBP og behandles som SBP uden en laboratoriebekræftet årsag til infektion. og er til stede hos 10-30 % af alle indlagte patienter med ascites. Desuden var svampeinfektion i ascites også relateret til høj dødelighed hos cirrhosepatienter.

At diagnosticere ascitesinfektion omgående er således nøgletrinet til at forhindre komplikationen. Da bakteriekulturens følsomhed er begrænset, selvom ascites injiceres direkte i blodkulturflasker ved siden af. Der er behov for en ny metode til at identificere patogenet.

Her sigter vi efter at bruge metagenomisk næste generations sekvensering (mNGS) til at give den første nogensinde demonstration af præcisionsmedicin til diagnosticering af ascitesinfektion hos indlagte patienter med øjeblikkelig indvirkning på klinisk pleje og patienters resultater. Metoden til mNGS udføres af BGI Genomics Company, som er et licenseret klinisk diagnostisk laboratorium i Kina. I dette multicenter og prospektive kliniske studie planlægger vi at detektere ascitesprøve ved mNGS og sammenligne ydeevnen af ​​mNGS og rutinemæssig mikrobiologiske test. I sidste ende sigter vi mod at forbedre diagnosticeringen af ​​ascitesinfektion og forbedre patienternes resultater.