Metagenomisk neste generasjons sekvensering for diagnose av ascitesinfeksjon ved leversykdommer i sluttstadiet

Ascites er den vanligste komplikasjonen av cirrhose, og utviklingen er assosiert med betydelig økt dødelighet. Ascitesinfeksjon inkludert spontan bakteriell peritonitt (SBP), bakterasitt og soppinfeksjoner. SBP er en av de mest fryktede komplikasjonene ved ascites. EASL-retningslinjene anbefaler at diagnostiske kriterier for SBP er definert på antall ascitesvæske polymorfonukleære leukocytter (PMN) ≥250 celler/μl, med eller uten ascitesvæske-positiv kultur. Men i klinisk praksis. Opptil 30 % av sykehuspasienter anses som mistenkelig SBP, og behandles som SBP uten laboratoriebekreftet infeksjonsårsak. og er tilstede hos 10-30 % av alle sykehuspasienter med ascites. Dessuten var soppinfeksjon i ascites også relatert til høy dødelighet hos cirrhosepasienter.

Derfor er det nøkkeltrinn for å forhindre komplikasjonen for å diagnostisere ascitesinfeksjon umiddelbart. Siden er følsomheten til bakteriekultur begrenset selv om ascites injiseres direkte i blodkulturflasker på sidene. Ny metode for å identifisere patogenet er nødvendig.

Her tar vi sikte på å bruke metagenomisk neste generasjons sekvensering (mNGS) for å gi den første demonstrasjonen noensinne av presisjonsmedisin for diagnostisering av ascitesinfeksjon hos sykehusinnlagte pasienter, med umiddelbar innvirkning på klinisk behandling og pasientresultater. Metoden for mNGS utføres av BGI Genomics Company som er et lisensiert klinisk diagnostisk laboratorium i Kina. I denne multisenter og prospektive kliniske studien planlegger vi å oppdage ascitesprøve ved hjelp av mNGS og sammenligne ytelsen til mNGS og rutinemessig mikrobiologisk testing. Til syvende og sist har vi som mål å forbedre diagnosen ascitesinfeksjon og forbedre pasientenes resultater.