Sequenziamento metagenomico di nuova generazione per la diagnosi dell'infezione da ascite nelle malattie epatiche allo stadio terminale

L'ascite è la complicanza più comune della cirrosi e il suo sviluppo è associato a un aumento sostanziale della mortalità. Infezione da ascite inclusa peritonite batterica spontanea (SBP), batteriascite e infezioni fungine. SBP è una delle complicanze più temute dell'ascite. Le linee guida EASL raccomandano che i criteri diagnostici di SBP siano definiti sulla conta dei leucociti polimorfonucleati nel liquido ascitico (PMN) ≥250 cell/μl, con o senza coltura positiva del liquido ascitico. Tuttavia, nella pratica clinica. Fino al 30% dei pazienti ospedalizzati sono considerati sospetti di SBP e trattati come SBP senza una causa di infezione confermata dal laboratorio. ed è presente nel 10-30% di tutti i pazienti ospedalizzati con ascite. Inoltre, l'infezione fungina nell'ascite era anche correlata all'elevata mortalità nei pazienti con cirrosi.

Pertanto, diagnosticare tempestivamente l'infezione da ascite è il passaggio chiave per prevenire la complicazione. Poiché, la sensibilità della coltura batterica è limitata anche se l'ascite viene iniettata direttamente nei flaconi per l'emocoltura. È necessario un nuovo metodo per identificare l'agente patogeno.

Qui, miriamo a utilizzare il sequenziamento metagenomico di nuova generazione (mNGS) per fornire la prima dimostrazione in assoluto di medicina di precisione per la diagnosi dell'infezione da ascite nei pazienti ospedalizzati, con un impatto immediato sull'assistenza clinica e sugli esiti dei pazienti. Il metodo di mNGS è intrapreso da BGI Genomics Company che è un laboratorio diagnostico clinico autorizzato in Cina. In questo studio clinico multicentrico e prospettico, stiamo pianificando di rilevare il campione di ascite mediante mNGS e confrontare le prestazioni di mNGS e test microbiologici di routine. In definitiva, miriamo a migliorare la diagnosi di infezione da ascite e migliorare i risultati dei pazienti.