Secuenciación metagenómica de próxima generación para el diagnóstico de infección de ascitis en enfermedades hepáticas en etapa terminal

La ascitis es la complicación más común de la cirrosis y su desarrollo se asocia con un aumento sustancial de la mortalidad. Infección por ascitis, incluida la peritonitis bacteriana espontánea (SBP), bacterascitis e infecciones fúngicas. La PBE es una de las complicaciones más temidas de la ascitis. Las guías de la EASL recomiendan que los criterios diagnósticos de PBE se definan en el recuento de leucocitos polimorfonucleares (PMN) en líquido ascítico ≥250 células/μl, con o sin cultivo positivo en líquido ascítico. Sin embargo, en la práctica clínica. Hasta el 30% de los pacientes hospitalizados son considerados como PBE sospechosa y tratados como PBE sin causa de infección confirmada por laboratorio. y está presente en el 10-30% de todos los pacientes hospitalizados con ascitis. Además, la infección por hongos en la ascitis también se relacionó con una alta mortalidad en pacientes con cirrosis.

Por lo tanto, diagnosticar la infección de ascitis de manera oportuna es el paso clave para prevenir la complicación. Dado que, la sensibilidad del cultivo bacteriano es limitada incluso si la ascitis se inyecta directamente en los frascos de hemocultivo además. Se necesita un nuevo método para identificar el patógeno.

Aquí, nuestro objetivo es utilizar la secuenciación metagenómica de próxima generación (mNGS) para proporcionar la primera demostración de medicina de precisión para el diagnóstico de la infección por ascitis en pacientes hospitalizados, con un impacto inmediato en la atención clínica y los resultados de los pacientes. El método de mNGS lo lleva a cabo BGI Genomics Company, que es un laboratorio de diagnóstico clínico con licencia en China. En este estudio clínico prospectivo y multicéntrico, estamos planeando detectar muestras de ascitis por mNGS y comparar el rendimiento de mNGS y las pruebas microbiológicas de rutina. En última instancia, nuestro objetivo es mejorar el diagnóstico de la infección de ascitis y mejorar los resultados de los pacientes.