Effekt af Rifaximin på tarmbakterieflora efter stamcelletransplantation hos patienter med akut leukæmi

Tarmmikrobiomet spiller en væsentlig rolle i at modulere immungenopbygningen efter allogen stamcelletransplantation (ASCT). Lav tarmmikrobiel diversitet er konsekvent blevet forbundet med dårlige resultater af transplantation, herunder øget forekomst af akut transplantat versus værtssygdom (aGVHD), bakteriel sepsis efter transplantation og ikke-tilbagefaldsdødelighed (NRM). Den nøjagtige mekanisme, hvorved tarmmikrobiom påvirker lokal såvel som systemisk immunitet, er imidlertid ikke fuldstændig kendt og menes at skyldes virkningen af ​​mikrobielle metabolitter på tarmepitelceller og værtsantigen-præsenterende celler. Forståelse af disse mekanismer og modulering af mikrobiomet kan være afgørende for at forbedre transplantationsresultater. Rifaximin er et lokalt virkende antibiotikum, der er blevet godkendt til at manipulere tarmmikrobiomet ved leversvigt. Den er unik på grund af dens evne til at fjerne patogene bakterier, samtidig med at den bevarer de anaerobe kommensaler. Det kan potentielt modificere tarmmikrobiomet for at øge alfa-diversiteten, og dette kan hjælpe med at reducere aGVHD, infektiøse komplikationer og dødelighed efter transplantation. Høj forekomst af multidrug-resistent sepsis og hyppig brug af bredspektrede antibiotika i Indien, ville resultere i højere rater af dysbiotisk tarmfrembringende mikrobiommanipulation for at forbedre transplantationsresultater mere relevante i vores land. Vi foreslår et randomiseret kontrolleret forsøg for at forstå fordelene ved at modulere tarmmikrobiomet hos patienter med ASCT, mens vi undersøger det lokale og globale immunrepertoire ved hjælp af enkeltcellesekventering og flerfarvet flowcytometri.

Studiedesign: Enkeltcenter, åbent, fase II-studie, randomiseret kontrolleret forsøg.

Primært mål: At bestemme virkningen af ​​rifaximin på tarmens mikrobielle alfa-diversitet og sammenligne den med kontroller.

Sekundære mål:

For at bestemme virkningen af ​​rifaximin på 1 års ikke-tilbagefaldsdødelighed efter transplantation, forekomst af grad III/IV aGVHD, forekomst af MDR-sepsis, mønstre for immuncelle-rekonstitution og cytokinprofil efter transplantation.

Eksplorativt mål: At bruge enkeltcellet transkriptomik (SCT) til at identificere immuncelleprofiler i tarmbiopsier efter ASCT for at få indsigt i mikrobiomets indvirkning på lokal tarmimmunitet.

Undersøgelsespopulation: Voksne patienter, der gennemgår ASCT på Tata Memorial Centre.

Kort om undersøgelsesmetodologi: Patienter vil blive randomiseret til at modtage enten oral tablet rifaximin 200 mg to gange dagligt sammen med standard posttransplantationsbehandling eller til at modtage standardbehandling alene. Afføringsprøver og blodprøver vil blive indsamlet på forskellige tidspunkter til henholdsvis mikrobiomanalyse og immuncelleprofilering. Vi planlægger at udføre 16s rRNA-baseret næste generations sekventering af alle variable regioner ved hjælp af en faset primer-tilgang ved hjælp af afførings-DNA som skabelon. Tarmmikrobiomdiversitet vil blive beregnet ved hjælp af det omvendte Simpson-indeks. Immuncelleprofil ville blive analyseret ved anvendelse af 16-farve flowcytometri. I udvalgte tilfælde, hvor patienter gennemgår koloskopisk tarmbiopsi for aGVHD, vil vi også få prøver til transkriptom-sekventering. Dette vil hjælpe os med at forstå, hvordan immunceller interagerer med tarmslimhinder og mikrobiom hos patienter med aGVHD