Влияние рифаксимина на бактериальную флору кишечника после трансплантации стволовых клеток у пациентов с острым лейкозом

Микробиом кишечника играет важную роль в модуляции восстановления иммунитета после аллогенной трансплантации стволовых клеток (АТСК). Низкое микробное разнообразие кишечника постоянно связано с плохими результатами трансплантации, включая повышенную частоту острой реакции «трансплантат против хозяина» (оРТПХ), посттрансплантационного бактериального сепсиса и безрецидивной смертности (NRM). Однако точный механизм, с помощью которого микробиом кишечника влияет на местный, а также системный иммунитет, полностью не известен и, как полагают, обусловлен воздействием микробных метаболитов на эпителиальные клетки кишечника и антигенпрезентирующие клетки хозяина. Понимание этих механизмов и модуляция микробиома может иметь решающее значение для улучшения результатов трансплантации. Рифаксимин — антибиотик местного действия, одобренный для воздействия на микробиом кишечника при печеночной недостаточности. Он уникален своей способностью уничтожать патогенные бактерии, сохраняя при этом анаэробных комменсалов. Потенциально он может изменить микробиом кишечника, увеличив альфа-разнообразие, и это может помочь снизить РТПХ, инфекционные осложнения и смертность после трансплантации. Высокая заболеваемость сепсисом с множественной лекарственной устойчивостью и частое использование антибиотиков широкого спектра действия в Индии приведет к более высокому уровню дисбиотических манипуляций с микробиомом кишечника для улучшения результатов трансплантации, что более актуально в нашей стране. Мы предлагаем рандомизированное контролируемое исследование, чтобы понять преимущества модуляции микробиома кишечника у пациентов с ASCT, одновременно исследуя локальный и глобальный иммунный репертуар с использованием секвенирования отдельных клеток и многоцветной проточной цитометрии.

Дизайн исследования: Одноцентровое открытое исследование II фазы, рандомизированное контролируемое исследование.

Основная цель: определить влияние рифаксимина на альфа-разнообразие микробов кишечника и сравнить его с контролем.

Второстепенные цели:

Определить влияние рифаксимина на безрецидивную смертность после трансплантации в течение 1 года, частоту развития РТПХ III/IV степени, частоту МЛУ-сепсиса, характер восстановления иммунных клеток и профиль цитокинов после трансплантации.

Исследовательская цель: использовать одноклеточную транскриптомику (SCT) для идентификации профилей иммунных клеток в биопсиях кишечника после ASCT, чтобы получить представление о влиянии микробиома на местный иммунитет кишечника.

Исследуемая популяция: взрослые пациенты, проходящие ASCT в Мемориальном центре Тата.

Краткое описание методологии исследования: Пациенты будут рандомизированы для приема пероральных таблеток рифаксимина по 200 мг два раза в день вместе со стандартным лечением после трансплантации или для получения только стандартного лечения. Образцы стула и крови будут собираться в разные моменты времени для анализа микробиома и определения профиля иммунных клеток соответственно. Мы планируем выполнить секвенирование следующего поколения всех вариабельных областей на основе 16s рРНК, используя подход с поэтапным праймером, используя ДНК стула в качестве матрицы. Разнообразие кишечного микробиома будет рассчитываться с использованием обратного индекса Симпсона. Профиль иммунных клеток будет анализироваться с использованием 16-цветной проточной цитометрии. В отдельных случаях, когда пациентам проводится колоноскопическая биопсия кишечника по поводу РТПХ, мы также получаем образцы для секвенирования транскриптома. Это поможет нам понять, как иммунные клетки взаимодействуют со слизистой оболочкой кишечника и микробиомом у пациентов с оРТПХ.