Effetto della rifaximina sulla flora batterica intestinale dopo trapianto di cellule staminali in pazienti con leucemia acuta

Il microbioma intestinale svolge un ruolo significativo nel modulare la ricostituzione immunitaria post trapianto allogenico di cellule staminali (ASCT). Una bassa diversità microbica intestinale è stata costantemente associata a scarsi esiti del trapianto, inclusa una maggiore incidenza di malattia acuta del trapianto contro l’ospite (aGVHD), sepsi batterica post-trapianto e mortalità non dovuta a recidiva (NRM). Tuttavia, l’esatto meccanismo attraverso il quale il microbioma intestinale influenza l’immunità locale e sistemica non è completamente noto e si ritiene che sia dovuto all’impatto dei metaboliti microbici sulle cellule epiteliali intestinali e sulle cellule presentanti l’antigene dell’ospite. Comprendere questi meccanismi e modulare il microbioma può essere cruciale per migliorare i risultati dei trapianti. La rifaximina è un antibiotico ad azione locale approvato per la manipolazione del microbioma intestinale nell’insufficienza epatica. È unico per la sua capacità di eliminare i batteri patogeni, preservando i commensali anaerobici. Può potenzialmente modificare il microbioma intestinale per aumentare la diversità alfa e questo può aiutare a ridurre l’aGVHD, le complicanze infettive e la mortalità post-trapianto. L’elevata incidenza di sepsi multiresistente e l’uso frequente di antibiotici ad ampio spettro in India porterebbero a tassi più elevati di manipolazione del microbioma intestinale disbiotico per migliorare i risultati dei trapianti più rilevanti nel nostro Paese. Stiamo proponendo uno studio randomizzato e controllato per comprendere i benefici della modulazione del microbioma intestinale nei pazienti sottoposti ad ASCT, studiando al contempo il repertorio immunitario locale e globale utilizzando il sequenziamento di singole cellule e la citometria a flusso multicolore.

Disegno dello studio: studio di fase II, in aperto, a centro singolo, randomizzato e controllato.

Obiettivo primario: determinare l'impatto della rifaximina sulla diversità alfa della flora microbica intestinale e confrontarlo con i controlli.

Obiettivi secondari:

Per determinare l'impatto della rifaximina sulla mortalità post-trapianto senza recidiva a 1 anno, sull'incidenza di aGVHD di grado III/IV, sull'incidenza della sepsi MDR, sui modelli di ricostituzione delle cellule immunitarie e sul profilo delle citochine post-trapianto.

Obiettivo esplorativo: utilizzare la trascrittomica unicellulare (SCT) per identificare i profili delle cellule immunitarie nelle biopsie intestinali post ASCT al fine di ottenere informazioni sull'impatto del microbioma sull'immunità intestinale locale.

Popolazione in studio: pazienti adulti sottoposti ad ASCT presso il Tata Memorial Centre.

Metodologia dello studio in breve: i pazienti sarebbero stati randomizzati a ricevere una compressa orale di rifaximina da 200 mg due volte al giorno insieme al trattamento post-trapianto standard o a ricevere il solo trattamento standard di cura. Campioni di feci e campioni di sangue verranno raccolti in momenti diversi rispettivamente per l'analisi del microbioma e la profilazione delle cellule immunitarie. Abbiamo in programma di eseguire il sequenziamento di nuova generazione basato su rRNA 16s di tutte le regioni variabili utilizzando un approccio di primer a fasi utilizzando il DNA delle feci come modello. La diversità del microbioma intestinale sarà calcolata utilizzando l'indice Simpson inverso. Il profilo delle cellule immunitarie verrebbe analizzato utilizzando la citometria a flusso a 16 colori. Nei casi selezionati in cui i pazienti vengono sottoposti a biopsia intestinale colonscopica per aGVHD, otterremo anche campioni per il sequenziamento del trascrittoma. Questo ci aiuterà a capire come le cellule immunitarie interagiscono con la mucosa intestinale e il microbioma nei pazienti con aGVHD