Definition von Subphenotypen von Lungenentzündung basierend auf der Atemmikrobiomzusammensetzung, um mikrobielle und klinische Behandlungsfehler vorherzusagen (PHENOMENON)

Lungenentzündung kann in der Gemeinde wie Covid-19 oder Grippe oder während des Krankenhausaufenthaltes für eine andere Krankheit erworben werden.

Die erhebliche Belastung der CAP wird mit alternden Bevölkerungsgruppen und wachsenden Komorbiditätsraten zunehmen. CAP war die häufigste Ursache für übertragbare Krankheiten und die zweite Ursache für durch Behinderungen angepasste Lebensjahresverlust in der Welt im Jahr 2019, noch vor der Covid-19-Pandemie (GBD 2019 Jugendsterbschaftskollaborateure 2021; GBD 2019 Erkrankungen und Verletzungen für Mitarbeiter 2020). CAP wird klassisch durch virulente Bakterien (wie Streptococcus pneumoniae) oder Viren (Influenza) induziert, aber auch neue pathogene Viren wie SARS-COV-2 (COVID-19).

Die Inzidenz von VAP liegt je nach Fallmischung und diagnostischen Kriterien von 5% bis 67%. In den USA liegt die Inzidenz von VAP von 2 bis 16 Folgen pro 1.000 Beatmungs-Tag. Das geschätzte VAP -Risiko ist zunächst hoch und nimmt nach 14 Tagen mechanischer Beatmung auf weniger als 0,5% pro Tag ab. VAP erhöht die Dauer des Krankenhausaufenthaltes um 7 Tage und die Gesundheitskosten um ca. 40.000 USD pro Episode (Safdar et al. 2005; Eber et al. 2010). Die antimikrobielle Resistenz steigt und führt zu einer erhöhten Dauer des Krankenhausaufenthalts und zu übermäßigen Todesfällen bei septischen Patienten weltweit. Die Weltgesundheitsorganisation betrachtet die Antibiotika -Resistenz als eine der größten globalen Gesundheitsbedrohungen, mit denen wir derzeit konfrontiert sind. AMR, einschließlich Malaria, Tuberkulose und Bakterieninfektionen, kann bis 2050 weltweit auf 10 Millionen Todesfälle steigen. Während in einigen bakteriellen Taxa eine gewisse Resistenz intrinsisch ist, ist das Hauptproblem die gewonnene Resistenz, da Bakterien genetisches Material austauschen und dadurch Antibiotikaresistenzgene (ARG) verbreiten können.

Vorheriger Beförderung von Beta-Lactamasen-Produzierungen von Enterobacterales (ESBL-E) von erweitertem Spektrum findet sich bei 5 bis 25% der Intensivpatienten. Obwohl ein früherer Wagen der Hauptrisikofaktor ist, der mit VAP im Zusammenhang mit ESBL-E verbunden ist, entwickeln nur 5% bis 20% der ESBL-E-Fluggesellschaften einen VAP im Zusammenhang mit ESBL-E. Der Beförderstatus hat daher einen hohen negativen Vorhersagewert für ESBL-E-assoziierte VAP, während ein positiver Vorhersagewert, d. H. Die Wahrscheinlichkeit einer ESBL-E-Infektion bei ESBL-E-Beförderung, weniger als 50%beträgt.

Bei der Betreuung von VAP-Patienten haben jüngste Studien gezeigt, dass die Angemessenheit der anfänglichen antimikrobiellen Therapie nicht mit einer signifikanten Verbesserung der VAP-Prognose verbunden ist, insbesondere wenn ein Multire-resistenter (MDR) gramnegativer Bakterium beteiligt ist (Sommer et al. 2018; Titov et al. 2021). Eine wahrscheinliche Erklärung für das Fehlen eines Nutzens einer angemessenen Therapie innerhalb von 24h ist die schnelle Diffusion und Expression von Argumenten innerhalb des Mikrobioms während der Behandlung. Es wurde gezeigt, dass die Machbarkeit der Charakterisierung von Lungenmikrobiota durch die Herstellung vorläufiger Daten aus 174 Atemproben, die bei 65 Patienten in der IBIS -Biobank innerhalb der IBIS -Kohorte eingeschlossen wurden, erzeugt wurden. Diese vorläufigen Analysen haben auch bestätigt, dass sich das Atmungsmikrobiom von Krankenhauspatienten von einer normalen Zusammensetzung (Tag 1) zu einem spezifischen Muster in Streptococcus verschiebt und in Haemophilus angereichert ist (Tag 7). Kürzlich wurde in einer randomisierten klinischen Studie beobachtet, dass Probiotika den Arg -Reichtum des Darmmikrobioms während der antimikrobiellen Behandlung erhöhen (Abbildung 2) (Montassier et al. 2021). Diese Daten zeigten die Fähigkeit, den zeitlichen Verlauf von ARG während der Behandlung in menschlichen Proben zu untersuchen und die Hypothese schneller Modifikationen des ARG während der Behandlung zu verstärken.

Zusammenfassend sind Behandlungsfehler bei Patienten mit CAP und HAP üblich, selbst in Fällen einer angemessenen antimikrobiellen Therapie. Einige spezifische antimikrobielle Therapien führen zu besseren Ergebnissen als Standard für Cares, und die klassische Mikrobiologie erklärt dieses Ergebnis nicht.

Jüngste Daten zeigten, dass das Mikrobiom eine signifikante Quelle für Antibiotikaresistenzgene (ARG) ist, die während der Behandlung schnell zwischen den Arten zwischen den Arten diffundiert werden kann.

Angesichts dieser vorläufigen Ergebnisse beabsichtigen wir

1. Definieren Sie VAP- und CAP-Subphenotypen basierend auf dem Echtzeitverlauf der Last von Argum in vivo
2. In vivo zu demonstrieren, dass eine spezifische mikrobiomliche Bearbeitung basierend auf diesen Phänotypen die Ergebnisse der Lungenentzündung verbessern kann.

Die Definition dieser Phänotypen der Lungenentzündung beeinflusst wahrscheinlich die Art und Weise, wie Patienten in der täglichen Praxis behandelt werden, und verlagert die antimikrobielle Behandlung von In -vitro -Funktionstests auf die in vivo -Vorhersage der Reaktion auf die Behandlung.