Reparación de ADN, p53 y fenotipos de apoptosis en cáncer de pulmón

Fondo:

El Laboratorio de Carcinogénesis Humana está realizando un estudio observacional de control de casos de cáncer de pulmón de células no pequeñas (CPCNP) en Baltimore, MD. Este estudio de epidemiología molecular fue desarrollado para probar la confiabilidad y validez del ensayo de sensibilidad mutágeno, donde se necesita un estudio de casos y controles para evaluar la posibilidad de sesgo de casos. Es importante destacar que este protocolo establece un recurso que permite el estudio de biomarcadores adicionales e interacciones gen-ambiente. Al momento del reclutamiento, los casos y los controles reciben una entrevista personal estructurada que evalúa el historial médico y de cáncer previo, el uso de tabaco y cigarrillos electrónicos, el uso de alcohol, los medicamentos actuales, el historial ocupacional, el historial médico familiar, el historial menstrual y el uso de estrógeno, suplementos nutricionales recientes y la ingesta de cafeína y el nivel socioeconómico. La recolección de muestras consiste en una muestra de sangre única y/o enjuague bucal para recolectar células de la mejilla (células orales) y una muestra de orina única. Además, el cáncer y el tejido circundante no canceroso que se extirpó quirúrgicamente y que no fue necesario para el diagnóstico se pueden obtener para los casos, así como la información médica actual de los registros médicos. Los cultivos de células primarias pueden establecerse a partir de tejido tumoral fresco disponible. Los marcadores fenotípicos que se estudiarán evaluarán la capacidad de reparación del ADN en cultivos de linfocitos expuestos in vitro a radiación, bleomicina, benzo(a)pireno-diol-epóxido midiendo la inducción de aberraciones cromosómicas, p53 y apoptosis. El ADN de las capas leucocitarias o de las células de la mejilla se utilizará para el análisis de la variación de la línea germinal en forma de polimorfismos de nucleótido único (SNP) en genes implicados en la reparación del ADN, la inmunidad innata, el control del ciclo celular, la angiogénesis, la apoptosis, las citoquinas, la adicción a la nicotina, la inflamación, Metabolismo hormonal y microARN. Además, en 2010 se recibió la aprobación del IRB para incluir este estudio en un estudio de asociación del genoma completo (GWAS) de varias instituciones sobre el cáncer de pulmón en afroamericanos. Los tumores de los casos se evaluarán en busca de receptores de estrógeno y progesterona, mutaciones somáticas y expresión génica. La metabolómica de las muestras de orina, plasma, suero y tejido se analizará mediante un enfoque no dirigido.

Objetivos:

1. Determinar si la sensibilidad mutágena, la inducción de p53 y la apoptosis en linfocitos cultivados predicen el riesgo de cáncer de pulmón.
2. Determinar la relación entre el metabolismo de los esteroides sexuales, la exposición a los estrógenos y el riesgo de cáncer de pulmón.
3. Investigar y desarrollar marcadores fenotípicos o predictivos de riesgo y supervivencia del cáncer de pulmón, basados ​​en la sensibilidad mutágena, marcadores polimórficos, expresión génica y metabolómica.
4. Para investigar las disparidades raciales asociadas con el riesgo y la supervivencia del cáncer de pulmón.
5. Examinar la relación entre las citocinas circulantes con el riesgo y la supervivencia del cáncer de pulmón y establecer el método más sólido de detección de citocinas.
6. Generar una medida más precisa de la ascendencia mediante el análisis de marcadores informativos de ascendencia e integrar esta variable en nuestros estudios de disparidades en la salud.

7. Realizar estudios de metabolómica en suero, plasma y orina con el fin de descubrir nuevos marcadores de riesgo, diagnóstico y pronóstico. Usaremos cromatografía líquida de ultra rendimiento acoplada a espectrometría de masas (UPLS-MS) para buscar metabolitos endógenos de peso molecular pequeño que puedan clasificar el cáncer y predecir el resultado.

   Este es un enfoque novedoso para el descubrimiento de biomarcadores que también aprovecha el proceso no invasivo de recolección de muestras biológicas. Los tejidos tumorales y no tumorales correspondientes de los pacientes correspondientes también se analizarán utilizando los mismos métodos para ampliar el descubrimiento de nuevos metabolitos tumorales. Además, se examinarán los metabolitos de la vitamina D en muestras de suero de casos y controles de cáncer de pulmón para evaluar la relación entre la circulación

   niveles de metabolitos de vitamina D con riesgo de cáncer y supervivencia. Este análisis se combinará con la prueba de los SNP de la ruta de la vitamina D en los pacientes correspondientes para determinar si ciertos SNP también están asociados con los niveles de vitamina D.

8. Evaluar biomarcadores de diagnóstico y pronóstico de cáncer en ADN tumoral circulante
9. Evaluar el microbioma (microbios) presente en el tejido pulmonar mediante hibridación in situ de tejidos fijados a ser completado en Mayo Clinic por colaboradores. Los colaboradores no recibirán información sobre las muestras que no sea su tejido de origen.
10. Para recopilar datos y muestras biológicas de pacientes que se sometieron a pruebas de detección con TC de dosis baja como parte de su diagnóstico de cáncer de pulmón. Esto es con el fin de investigar biomarcadores no invasivos del diagnóstico y pronóstico del cáncer de pulmón. La UMMS y el VA ahora ofrecen exámenes de detección con TC de dosis baja para la detección temprana del cáncer de pulmón. Estas pautas de detección son según las pautas de CMS, es decir, de 55 a 77 años de edad, >=30 paquetes-año de tabaquismo y haber dejado de fumar durante 15 años o menos. A estos pacientes de alto riesgo se les ofrecerá una evaluación anual.
11. Cultivar microbiomas-bacterias específicas de cáncer de pulmón de cánceres de pulmón humanos. Este trabajo, en parte, se llevará a cabo con nuestro colaborador, el Dr. Paul Owrin, experto en el cultivo de especies microbianas a partir de tejidos humanos. Estas muestras, aproximadamente 10 por año, serán desidentificadas de toda la información del paciente.
12. Realizar análisis de ARN de tejidos tumorales y normales en colaboración con el Dr. Isidore Rigoustos con el objetivo de descubrir nuevas vías de señalización en cáncer de pulmón.
13. Contribuir con nuestros datos a consorcios más grandes para que podamos realizar estudios con mayor potencia y hacer observaciones valiosas y reproducibles sobre la epidemiología del cáncer de pulmón. Estableceremos esta transferencia de datos a través de un DTA.
14. Para realizar la secuenciación de ADN de próxima generación de tumores (y normales correspondientes) de pacientes inscritos en este protocolo.
15. Colaborar con colegas intramuros, específicamente el Dr. Jung Byun en NIMHD en el análisis genómico (secuenciación de ADN de próxima generación) de muestras dentro de este contrato. Anticipamos el envío de hasta 400 muestras. No se enviará ni incluirá ninguna información de identificación personal con estas muestras.
16. Colaborar con colegas externos, específicamente el Dr. John Simmons en Personal Genome Diagnostics, y el Dr. Peter Campbell en el Welcome Sanger Institute, Inglaterra, en el análisis genómico (secuenciación de ADN de próxima generación) de muestras dentro de este contrato. Anticipamos el envío de hasta 400 muestras. No se enviará ni incluirá ninguna información de identificación personal con estas muestras.
17. Para completar los MTA con los colegas señalados en el punto 16 anterior.
18. Capturar las exposiciones relacionadas con el historial reproductivo tanto en hombres como en mujeres, entre casos y controles, y relacionar estas exposiciones con el riesgo de cáncer y la disparidad en la salud.
19. Para utilizar los datos recopilados a través del cuestionario para geocodificar a los participantes.

Elegibilidad:

• NSCLC confirmado histológicamente y diagnosticado en los últimos 2 años (caso).
• Frecuencia pareada a casos según edad (intervalos de 5 años), sexo y raza (control basado en la población).
• Nacido en los Estados Unidos, residente del estado de Maryland

• Características del sujeto:

  • Habla inglés lo suficientemente bien como para ser entrevistado.
  • Capaz física y mentalmente de realizar la entrevista (es decir, debe poder escuchar al entrevistador, comprender mentalmente las preguntas de los entrevistadores y responder verbalmente)
  • Nunca ha sido entrevistado como control para este estudio.
  • Actualmente no reside en una institución como una prisión, hogar de ancianos o albergue
  • Sin antecedentes de cáncer que no sean cáncer de piel no melanoma o carcinoma in situ del cuello uterino (control basado en la población)
  • Tiene un teléfono residencial que funciona dentro del hogar (control basado en la población)

Diseño:

• Control de caso; De observación
• Análisis estadístico planificado: las asociaciones de riesgo entre los genotipos y el cáncer/supervivencia se evaluarán utilizando un modelo de regresión logística incondicional, con ajuste de covariables, según corresponda.
• Número de sujetos que se inscribirán: la acumulación objetivo es de 6000 sujetos, que consta de 450 casos/cada género en afroamericanos y 800 casos/cada género en caucásicos. Se seleccionará un número igual de controles para cada categoría de casos en función de la combinación de género y raza.
• Para los pacientes que se someten a pruebas de detección con TC de dosis baja en los hospitales participantes en este protocolo, inscribiremos a los pacientes que hayan tenido una exploración "positiva" y que asistan a la UMMS o al hospital VA para un seguimiento adicional.