Determinantes microbianos del riesgo de demencia en diabéticos tipo 2 de ascendencia mexicana

la diabetes tipo 2 (T2D) como antecedente común de la neurodegeneración patológica y la demencia, incluida la enfermedad de Alzheimer (EA); sin embargo, el vínculo mecánico entre los trastornos metabólicos y neurodegenerativos sigue sin resolverse. Aquí, los investigadores estudiarán una población humana bien definida con una mayor prevalencia y un inicio temprano tanto de DT2 como de EA, personas de ascendencia mexicana que viven en el sur de Texas. El estudio sentará las bases fundamentales para abordar la hipótesis general de los investigadores de que la disbiosis del microbioma intestinal en personas con diabetes tipo 2 de ascendencia mexicana que viven en el sur de Texas está causalmente relacionada con el aumento de la prevalencia de EA comórbida de aparición temprana en esta población. En este estudio, los investigadores realizarán la secuenciación del gen metagenómico 16S ribosomal RNA (rNRA) y el análisis bioinformático de última generación en muestras fecales recolectadas de individuos de control diabéticos tipo 2 y no diabéticos de ascendencia mexicana para probar la hipótesis de trabajo de que la estructura de la comunidad del microbioma intestinal de las personas de ascendencia mexicana con diabetes tipo 2 está significativamente alterada en comparación con la de los no diabéticos dentro de la misma población. Según el conocimiento de los investigadores, este estudio piloto multidisciplinario será el primero en investigar la estructura de la comunidad microbiana intestinal de los diabéticos tipo 2 frente a la de los individuos no diabéticos de ascendencia mexicana. Además, tiene el potencial de proporcionar información mecánica sobre cómo la DT2 predispone a las personas a la neuropatología y el deterioro cognitivo característicos de la EA e identificar una nueva clase de intervenciones dirigidas al microbioma intestinal del huésped para la prevención de la EA de aparición temprana en una población predispuesta. así como a la población en general.

Los sujetos humanos serán reclutados a través de la Endocrinología de la Rama Médica de la Universidad de Texas en Galveston (UTMB) y preseleccionados para confirmar que los participantes potenciales cumplan con los criterios de inclusión y exclusión establecidos como controles no diabéticos o con diabetes tipo 2, según se define en el protocolo de sujetos humanos de UTMB asociado con este proyecto. Los participantes preseleccionados que cumplan con los criterios definidos serán invitados a asistir a una cita con un coordinador del estudio en el Centro de Investigación Clínica de la UTMB. A los participantes en el estudio que hayan dado su consentimiento e inscritos se les pedirá que completen cuestionarios de historial médico, preferencia dietética y función gastrointestinal, y se les indicará cómo usar el kit de recolección de muestras fecales (DNA GenoTek) OMNIgene-GUT RNA (OMR)-200 proporcionado. Los participantes enviarán la muestra fecal recolectada mediante el envío de un sobre de envío prepago y etiquetado. Las muestras serán desidentificadas y almacenadas a -80oC en el Laboratorio Buffington antes de su envío al Centro de Investigación Metagenómica y del Microbioma (CMMR) de Baylor College of Medicine para la secuenciación del gen 16S rRNA metagenómico. En resumen, el ADN genómico bacteriano se extraerá con el kit MagAttract PowerSoil (Qiagen) y la región V4 del ADN ribosómico 16S (ADNr) se amplificará mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y se secuenciará en la plataforma MiSeq (Illumina). Los pares de lectura del gen 16S rRNA se desmultiplexarán en función de los códigos de barras moleculares únicos agregados a los cebadores utilizados para la amplificación y las lecturas se fusionarán mediante USEARCH. Las secuencias del gen 16S rRNA se agruparán en unidades taxonómicas operativas (OTU) utilizando el algoritmo UPARSE y se asignarán a una versión optimizada de la base de datos SILVA para determinar las taxonomías. Luego, los investigadores usarán un script personalizado desarrollado por el CMMR para construir una tabla OTU enrarecida para análisis posteriores de diversidad alfa, diversidad beta y tendencias filogenéticas para identificar cualquier cambio en la estructura de la comunidad entre individuos diabéticos tipo 2 y no diabéticos de Ascendencia mexicana inscrita en el estudio.