COVID-19-vasta-ainetestien arviointi

Tausta

Molekyylitestit (RT-PCR) ovat tällä hetkellä kultainen standardi COVID-19:n diagnosoinnissa. Ne havaitsevat viruksen RNA:ta ja ovat hyvä merkkiaine nykyiselle infektiolle ja tarttuvuudelle. Nämä testit ovat kuitenkin kalliita ja niistä on pulaa. Pitkälle edenneissä COVID-19-tapauksissa viruspitoisuus ylemmissä hengitysteissä on usein alhainen, koska infektio on levinnyt keuhkoihin ja viruksen RNA:ta ei toisinaan voida havaita RT-PCR:llä nenän vaihtoa käyttäen. Vasta-ainetestit havaitsevat ihmisen vasta-aineita virusproteiineja vastaan ​​verestä tai muista kehon nesteistä. Ne voivat olla hyödyllisiä nykyisten infektioiden diagnosoinnissa (hieman vähemmän herkkiä kuin RT-PCR-testit), ja ne pysyvät positiivisina, kun ihmiset ovat toipuneet infektiosta. Siten vasta-ainetestien odotetaan olevan hyödyllisiä nykyisten infektioiden diagnosoinnissa, äskettäisten infektioiden todentamisessa henkilöillä, joita ei ole testattu RT-PCR:llä heidän ollessaan sairaana, ja mahdollisen viruksen vastustuskyvyn dokumentoimiseksi. Vasta-ainetestit voivat olla erityisen arvokkaita käytettäviksi matala- ja keskituloisissa maissa, joissa ei ole resursseja SARS-CoV-2-infektion laajaan molekyylitestaukseen.

Odotettu testin herkkyys ja spesifisyys. Valmistajan tiedot useista vasta-ainetesteistä väittävät, että yli 90 %:lla COVID-19-potilaista (kliiniset oireet ja positiiviset molekyylitestit) on positiiviset IgM- ja/tai IgG-vasta-ainetestit. He väittävät myös spesifisyyden olevan 93–95 % sellaisten henkilöiden näytteille, jotka eivät ole altistuneet SARS-CoV-2:lle.

Vasta-ainetestien saatavuus. Viime kuukausina on kehitetty ja markkinoitu monia vasta-ainetestejä. Sveitsin Genevessä toimiva innovatiivisen uuden diagnostiikan säätiö (FIND, läheisesti yhteydessä Maailman terveysjärjestöön (WHO) ja Iso-Britannian hallituksen suurella apurahalla) ilmoitti tunnistaneensa yli 70 tällaista testiä, ja he valitsivat 27 testiä. lisäarviointia. Näistä vain yksi Yhdysvalloissa valmistettu testi (tuottaja Cellex) on saanut USA:n FDA:n hätäkäyttöluvan (EUA), eikä yhdelläkään testillä ole virallista FDA:n hyväksyntää. Vasta-ainetesteissä käytetään erilaisia ​​diagnostisia alustoja, mutta useimmat testit käyttävät SARS-CoV-2 S1 -proteiinia ja muutamat testit myös SARS-CoV-2 N -proteiinia. Harvoja tutkimuksia, jotka ovat arvioineet riippumattomasti näiden nopeiden vasta-ainetestien suorituskykyä, on tähän mennessä julkaistu vertaisarvioiduissa aikakauslehdissä. Siksi tarvitaan enemmän tietoa näiden testien herkkyyden, spesifisyyden ja arvon arvioimiseksi.

menetelmät

Washingtonin yliopiston lääketieteellisen korkeakoulun (WUSM) Weil Lab -tutkimusryhmällä on laaja kokemus tartuntatautien nopeamuotoisten diagnostisten testien kehittämisestä ja arvioinnista. Ryhmä on erityisen kiinnostunut tartuntatautidiagnostiikasta, jota voidaan käyttää matalan ja keskitulotason maissa ja jolla työskennellään haastavissa olosuhteissa taudinpurkauksen jälkeen. Tässä projektissa arvioidaan SARS-CoV-2:n nopeat vasta-ainetestit ja vasta-ainetestien tuloksia verrataan RT-PCR-tuloksiin ja metatietoihin (ikä, sukupuoli, kliiniset oireet, altistuksen jälkeinen aika, jos tiedossa).

Potilasnäytteet. Tunnistamattomat seerumi- tai plasmanäytteet testataan potilailta, jotka ovat olleet sairaalahoidossa ja joiden COVID-19-testi on positiivinen. Testataan myös seerumipankkimme kontrollinäytteet (tunnistetut näytteet terveiltä ihmisiltä ja näytteet henkilöiltä, ​​joilla on loistauteja). Testattavien seerumi- tai plasmanäytteiden määrä jätetään avoimeksi, mutta tämä riippuu osittain saatavilla olevien näytteiden määrästä ja testipakkausten saatavuudesta. Aluksi arvioidaan, että noin 500 näytettä testataan, mutta lisää voidaan testata, jos se on tarpeen tutkimustavoitteiden saavuttamiseksi. Testit ja tutkimukset ovat vain tutkimusta varten, emmekä raportoi yksittäisten potilasnäytteiden testituloksia kliinikoille potilaan hoidon tueksi.

Huomautus: Tähän tutkimukseen ei tehdä vapaaehtoista ilmoittautumista; kaikki testit on suoritettava nimettömänä.

Vasta-ainetestisarjat. Markkinoille saatavat kaupalliset tai prototyyppiset vasta-aineiden havaitsemispakkaukset hankitaan lahjoittamalla tai ostamalla. Arvioitavat testit on määrättävä, mutta tämä riippuu saatavuudesta ja hinnasta. Painopiste on nopeamuotoisissa, hoitokohtaisissa vasta-ainetesteissä, jotka havaitsevat sekä IgM- että IgG-vasta-aineita rekombinanttivirusproteiineja vastaan. Tavoitteena on testata vähintään viittä (5) erilaista sarjaa, joista vähintään kaksi (2) on valmistettu Yhdysvalloissa.

Testausmenettelyt. Valmistajien pakkausselosteita tai testauskäytäntöjä noudatetaan. Nämä vaihtelevat eri testialustoilla. Testejä suorittavat henkilöt eivät tiedä PCR-tuloksia tai muita ihmisnäytteisiin liittyviä metatietoja testejä tehdessään. Kaksi riippumatonta lukijaa lukee testit ja tallentaa ne. Kolmas lukija on ratkaiseva ääni tapauksissa, joissa lukemat ovat ristiriidassa.

Testitiedot. Jokaisen eri testisarjan vasta-ainetestitulokset (IgM ja IgG) syötetään testituloslomakkeelle, jossa on osallistujan yksilöllinen tunnistenumero (UI). Tulokset yhdistetään myöhemmin tietokantaan, joka sisältää käyttöliittymän ja metatiedot, kuten ikä, sukupuoli, kuume, yskä, näytteenottopäivämäärä, oireiden alkamispäivä, altistushistoria (matka, kotitalous, työ). Testin suorituskyvyn hyväksyttävyys arvioidaan tämän protokollan loppuun liitetyn toimivan kohdetuoteprofiilin (TPP) mukaan.

Ensisijainen tavoite

1. Arvioida COVID-19-tautia aiheuttavan viruksen SARS-CoV-2:n vasta-ainetestien herkkyyttä ja spesifisyyttä. Akuutin ja toipilaan näytteiden herkkyyden määrittämiseen käytetään erillisiä kriteerejä.

1. Herkkyys akuuttien tapausten diagnosoinnissa määritellään prosentteina positiivisuudesta näytteissä, jotka ovat peräisin oireellisista tapauksista, joissa RT-PCR-tulokset ovat positiivisia. .
2. Herkkyys vasta-aineen havaitsemiseen toipilasnäytteissä prosentteina ilmaistuna on positiivisten vasta-ainetestien lukumäärä jaettuna näytteiden määrällä, jotka on testattu henkilöiltä, ​​joilla on dokumentoitu aiempia infektioita (RT-PCR:llä), jotka ovat nyt vähintään 2 viikkoa ohittaneet oireet ja tällä hetkellä RT-PCR negatiivinen.
3. Herkkyys määritellään myös prosentteina, jotka ovat yhtäpitäviä vertailuvasta-ainetestin tulosten kanssa heti, kun sellainen tunnistetaan.
4. Spesifisyys määritellään prosentteina negatiivisista kontrollinäytteistä (kerätty ennen 1.1.2020), joilla on negatiiviset vasta-ainetestitulokset.

Toissijaiset tavoitteet

1. Määrittää tartunnan tai COVID-19-oireiden alkamisen jälkeisen ajan ja viruksen vasta-aineiden esiintymisen välisen suhteen vasta-ainetestien avulla.
2. Määrittää vasta-ainevasteiden kesto infektion jälkeen.
3. Vertaamaan taustareaktiivisuutta (vääriä positiivisia määriä) seerumeille Yhdysvalloista ja kehitysmaiden seerumeista alueilla, joilla krooniset loisinfektiot ja pensaanlihan kulutus ovat yleisiä tai joilla ihmiset elävät läheisessä suhteessa villieläimiin, jotka voivat olla zoonoottisten virusten varasto.
4. Testin suorituskyvyn ominaisuuksien arviointi (käytön helppous).

Edut osallistujille. Ei mitään

Edut yhteiskunnalle. Vasta-ainetestit voivat olla hyödyllisiä infektion diagnosoinnissa ja aiemman infektion dokumentoinnissa. Riippumattomat testin validointitutkimukset ovat erittäin tärkeitä. Tämä johtuu siitä, että yritysten testitulokset voivat olla puolueellisia. Lisäksi yritykset eivät usein raportoi pikadiagnostiikan käyttäjäystävällisyydestä. Vasta-ainetestit voivat olla erityisen arvokkaita käytettäviksi matala- ja keskituloisissa maissa, joissa ei ole resursseja SARS-CoV-2-infektion laajaan molekyylitestaukseen.