Effets rénaux du régime méditerranéen et du régime pauvre en protéines avec des cétoacides sur le mibrobiote intestinal physiologique dans la MRC (MEDIKA)

Contexte : Dans la MRC, le milieu biochimique du tractus gastro-intestinal (GI) est altéré par plusieurs mécanismes, affectant la composition et la fonction du microbiote intestinal. Au-delà d'exercer des fonctions métaboliques, le microbiote influence l'état de santé général. Il digère les aliments principalement par catabolisme saccharolytique ou protéolytique, avec une prévalence du premier en bonne santé. Au contraire, dans l'IRC, on observe une dysbiose avec la prévalence de cette dernière.

Dans ce contexte, la réduction du taux de filtration glomérulaire et l'augmentation des niveaux d'urée entraînent son afflux massif dans le GI. Ici, l'urée est hydrolysée spontanément et/ou par l'uréase microbienne, libérant de l'ammoniac, facilement converti en hydroxyde d'ammonium. Ce dernier augmente le pH gastro-intestinal, provoquant une irritation des muqueuses, une entérocolite et des modifications de la composition du microbiote. Cela contribue à l'aggravation de l'inflammation et à la progression de la maladie : en effet, le microbiote a été identifié comme la principale source de plusieurs composés organiques volatils (COV) bien connus mais non identifiés, dont certaines des principales toxines urémiques.

Certains effets bénéfiques observés à partir d'études avec un régime pauvre en protéines complété par des cétoacides dans l'IRC ne peuvent pas être uniquement expliqués par l'apport réduit en protéines. L'hypothèse des chercheurs est que les cétoacides pourraient avoir des effets protecteurs directs sur la progression des lésions rénales, par le biais de modifications induites du milieu biochimique intestinal et de la composition du microbiote.

De même, le régime méditerranéen avec son apport en fibres peut contribuer à rétablir l'équilibre du microbiote intestinal.

Hypothèse:

La première hypothèse prévoit un effet bénéfique de la KD sur l'équilibre du microbiote et la diminution des toxines urémiques d'origine microbienne chez les patients atteints d'IRC, grâce à la réduction de l'urée induite par la KD. La seconde envisage des effets directs de la DM sur la composition du microbiote intestinal avec une augmentation des espèces protectrices et une diminution de la production de toxines urémiques.

L'étude évaluera les effets de trois régimes alimentaires différents, composés comme suit :

FD contient 1 g/pc/jour de protéines, protéines végétales 15-20 g/jour ;

• MD contient 0,7-0,8 g/pc/jour de protéines, protéines végétales 40-50 g/jour ;
• KD contient 0,3-0,5 g/pc/jour de protéines, 0 g/jour de protéines animales, 30-40 g/jour de protéines végétales et 0,05 g/pc/jour de cétoacides.

Objectif spécifique :

1. Évaluer les effets du régime méditerranéen (MD) et du régime pauvre en protéines supplémenté en cétoacides (KD) sur la composition du microbiote
2. Évaluer les effets de KD et MD sur les niveaux de COV d'origine microbienne (toxines urémiques déjà identifiées mais non identifiées) par métabolomique
3. Évaluer les effets de KD ou MD sur les paramètres de la fonction rénale, l'urémie, l'état inflammatoire et nutritionnel

Conception expérimentale Objectif 1 :

L'étude conçue sera expérimentale, randomisée, croisée. Elle sera réalisée conformément à la Déclaration d'Helsinki (IV Adaptation) et sera soumise à l'approbation du Comité d'Ethique local ; un consentement écrit sera obtenu de tous les sujets. 60 patients atteints d'IRC stades 3b-4 (formule MDRD) seront recrutés, selon les critères d'inclusion et d'exclusion (voir ci-dessous).

Conception expérimentale Objectif 2 :

Une analyse métabolomique non ciblée sera effectuée sur des échantillons fécaux et d'urine prélevés aux mêmes moments décrits dans l'objectif 1 de la conception expérimentale pour le profilage des COV (GC-MS/MS) et non-COV (LC-MS/MS). Les sérums collectés aux mêmes moments seront également analysés par métabolomique non cible pour le profilage non-COV et par métabolomique cible pour quantifier les toxines urémiques déjà connues, à savoir le sulfate d'indoxyle et le sulfate de p-crésyle, et les biomarqueurs de métabolites potentiels trouvés par l'expérience non ciblée.

Conception expérimentale Objectif 3 :

De plus, chaque patient subira un examen médical tous les trois mois, avec une évaluation de : la tension artérielle et l'état nutritionnel. De plus, aux mêmes moments de l'objectif 1 (T0, T3, T9, T12 et T18 mois à partir du début de l'étude), chaque patient fournira des échantillons de sang et d'urine, à la fois pour des analyses de routine et expérimentales.