Transmission périnatale des bactéries MDR (ACQUIRE)

L’augmentation rapide des entérobactéries multirésistantes (MDR-E) menace gravement la manière dont nous traitons les maladies infectieuses courantes. Les nouveau-nés constituent une population particulièrement vulnérable, pour laquelle un retard dans le traitement du sepsis MDR-E peut être fatal. De plus, les bactéries hautement résistantes aux médicaments, telles que la souche pandémique E. coli ST131, sont des colonisateurs persistants de l’intestin et du vagin (1). Dans les modèles animaux de colonisation intestinale, ces souches supplantent Escherichia coli commensale et sensible aux médicaments. Une exposition précoce au MDR-E pourrait donc avoir des effets à long terme sur le développement du microbiome et la santé globale de l’enfant (2).

Parmi les entérobactéries pathogènes extra-intestinales, la résistance à un certain nombre d’antibiotiques, notamment les bêta-lactamines, a rapidement augmenté au cours de la dernière décennie. Étant donné que l'intestin est un réservoir majeur de ces agents pathogènes, même chez des individus par ailleurs en bonne santé, il est probable qu'il y ait une augmentation concomitante de la colonisation intestinale avec des entérobactéries productrices de bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE-E) parmi la population générale (3, 4). Même dans les régions où la prévalence des infections communautaires de BLSE-E est faible, la transmission périnatale survient chez 35 % des nourrissons nés de mères colonisées par ces souches (5). Nous et d’autres avons récemment montré que les nourrissons en bonne santé d’Asie du Sud, une région où l’on utilise beaucoup d’antibiotiques par habitant, sont porteurs de BLSE-E (6). Des études in vitro menées dans notre laboratoire suggèrent que les E. coli BLSE isolées de ces nourrissons ont un potentiel de croissance plus élevé que les E. coli commensales. En utilisant un modèle murin de transmission périnatale d'E. coli, nous avons montré que certaines des souches d'E. coli BLSE adeptes de la colonisation intestinale du nourrisson humain peuvent également facilement coloniser les mères enceintes et être transmises par voie périnatale. Le fardeau de la colonisation des BLSE-E chez les femmes enceintes et leurs nouveau-nés aux États-Unis ainsi que les déterminants génétiques de la transmission périnatale sont inconnus.

Nous visons à mener une étude prospective de surveillance des mères et de leurs nourrissons nés par voie vaginale et admis au Northwestern Medicine Prentice Women's Hospital pour déterminer la prévalence du portage de BLSE-E chez les femmes post-partum en bonne santé et le taux de transmission de ces souches à leurs nourrissons. . En utilisant le séquençage du génome entier et une approche génomique comparative, nous déterminerons le lien de parenté entre les souches entre les dyades mère-enfant et identifierons les régions génétiques communes aux souches transmises. Nous émettons l’hypothèse suivante ; 1) étant donné la diversité de la population de Chicago, il y aura un taux significatif de colonisation intestinale par les BLSE-E chez les mères admises à Prentice, 2) les souches de BLSE-E isolées des nouveau-nés seront identiques à celles de leurs mères et 3) les déterminants génétiques de la transmission est conservée entre les souches de BLSE E. coli transmises par voie périnatale. Ces hypothèses seront testées en utilisant les objectifs suivants :

Objectif 1 : Déterminer la prévalence de la colonisation intestinale des BLSE-E et le taux de transmission périnatale parmi les dyades mère-enfant. Objectif 2 : Identifier les déterminants génétiques de la transmission communs aux BLSE E. coli qui sont transmis par voie périnatale.

Notre objectif à long terme est de comprendre les caractéristiques uniques des colonisateurs persistants de BLSE-E intestinales et vaginales et d'identifier les éléments génétiques et moléculaires qui pourraient constituer des cibles thérapeutiques attrayantes pour réduire le fardeau de la colonisation des BLSE-E et de la transmission périnatale.