Perinatální přenos bakterií MDR (ACQUIRE)

Rychlý nárůst multirezistentních Enterobacteriaceae (MDR-E) vážně ohrožuje způsob, jakým léčíme běžná infekční onemocnění. Obzvláště zranitelnou populací jsou novorozenci, u nichž může být zpoždění v léčbě sepse MDR-E fatální. Kromě toho jsou bakterie vysoce odolné vůči lékům, jako je pandemický kmen E. coli ST131, perzistentní střevní a vaginální kolonizátory (1). Na zvířecích modelech kolonizace střeva tyto kmeny konkurují komenzální Escherichia coli citlivé na léky. Expozice MDR-E v raném věku by proto mohla mít dlouhodobé účinky na vyvíjející se mikrobiom a celkové zdraví dítěte (2).

Mezi extraintestinálními patogenními Enterobacteriaceae v posledním desetiletí rychle vzrostla rezistence vůči řadě antibiotik, zejména beta-laktamům. Vzhledem k tomu, že střevo je hlavním rezervoárem těchto patogenů i u jinak zdravých jedinců, je pravděpodobné, že v běžné populaci dochází současně ke zvýšení kolonizace střeva s rozšířeným spektrem beta-laktamáz produkujících Enterobacteriaceae (ESBL-E) (3, 4). I v oblastech s nízkou prevalencí komunitně získaných infekcí ESBL-E dochází k perinatálnímu přenosu u 35 % dětí narozených matkám kolonizovaným těmito kmeny (5). My a další jsme nedávno prokázali, že zdraví kojenci v jižní Asii, regionu s vysokou spotřebou antibiotik na obyvatele, jsou nositeli ESBL-E (6). In vitro studie v naší laboratoři naznačují, že ESBL E. coli izolované z těchto kojenců mají vyšší růstový potenciál než komenzální E. coli. S použitím myšího modelu perinatálního přenosu E. coli jsme ukázali, že některé kmeny ESBL E. coli adepty na kolonizaci střeva lidských kojenců mohou také snadno kolonizovat březí samice a být perinatálně přenášeny. Zátěž kolonizace ESBL-E mezi těhotnými ženami a jejich novorozenci v USA a genetické determinanty perinatálního přenosu nejsou známy.

Naším cílem je provést prospektivní sledovací studii matek a jejich dětí narozených vaginálně a přijatých do ženské nemocnice Northwestern Medicine Prentice, abychom určili prevalenci přenosu ESBL-E u zdravých žen po porodu a míru přenosu těchto kmenů na jejich děti. . Pomocí celogenomového sekvenování a komparativního genomického přístupu určíme příbuznost kmenů mezi dyádami matka-dítě a identifikujeme genetické oblasti společné pro přenášené kmeny. Předpokládáme, že; 1) vzhledem k různorodé populaci Chicaga bude u matek přijatých do Prentice docházet k významné míře kolonizace střev ESBL-E, 2) kmeny ESBL-E izolované od novorozenců budou totožné s kmeny od jejich matek a 3) genetické determinanty přenos jsou zachovány u kmenů ESBL E. coli, které jsou perinatálně přenášeny. Tyto hypotézy budou testovány pomocí následujících cílů:

Cíl 1: Určit prevalenci kolonizace střeva ESBL-E a míru perinatálního přenosu mezi matkami a dětmi dyádami Cíl 2: Identifikovat genetické determinanty přenosu společné pro ESBL E. coli, které jsou perinatálně přenášeny.

Naším dlouhodobým cílem je porozumět jedinečným rysům perzistentních střevních a vaginálních kolonizátorů ESBL-E a identifikovat genetické a molekulární prvky, které by mohly být atraktivními terapeutickými cíli ke snížení zátěže kolonizace ESBL-E a perinatálního přenosu.