Az allergiás rhinitis integráló omika megközelítése (IntegOmics)

Az orrnyálka és az orrhám az első védekezési akadály az allergének ellen. Különféle fehérjék találhatók az orrnyálkahártyában, amelyek szerepet játszanak az allergiás rhinitisben, és tükrözik az allergén expozícióra adott immunválaszt. Az allergiás nátha betegek és az egészséges kontrollok proteomikus profiljának különbsége betekintést nyújthat a válasz működésébe, és mely fehérjék vezethetnek fokozott immunreakcióhoz vagy védekezési reakcióhoz, például a hám integritásának fokozásához. Az is ismert, hogy a légúti hám döntő szerepet játszik a légúti immunválaszok és a gyulladás szabályozásában. A génexpressziós profilozást széles körben használják összetett betegségek elemzésére. A légúti epitélium génexpressziós profilja beteg és egészséges állapotban, valamint kiindulási és provokált állapotban tisztázza a védekezési reakciók mechanizmusát és a gyulladásos folyamatok lefolyását. Az orrnyálkahártya fehérjék az eltérő génexpresszió következményeként az allergének és a hám közötti komplex mechanizmusok és kölcsönhatások végtermékeiként tekinthetők.

Az orrnyálkahártya-fehérjék eredete és termelőhelye eltérő, és a génexpresszió nem feltétlenül eredményez funkcionális metabolitokat. A javasolt projekt célja, hogy holisztikus proteomikai megközelítésben megpróbálja elemezni az allergénre adott választ genetikai/genomikus szinten az orrhámtól az orrnyálka fehérje/proteomikus szintjéig. Ez az elemzés betekintést nyújt abba, hogy a különböző génexpressziós profilok hogyan eredményeznek fehérjeexpressziót, és tovább tisztázza, hogy mely fehérjék származnak közvetlenül a hámból, és melyek a plazma kiürülésének eredményeként, illetve a különböző szabályozási folyamatok hátterében.

Allergiás nátha betegek és egészséges kontrollok esetében orrnyálka, orrnyálkahártya és szérum nyerhető. Az orrnyálkahártya nyálkahártya-csapdával felszerelt speciális szívóberendezésével endoszkópos ellenőrzés mellett, a nyálkahártya érintése nélkül gyűjtik össze a középső húsüregből. Az orrnyálkahártyát orrkefével, helyi érzéstelenítéssel nyerik ki, és az elsődleges tenyészetbe helyezik. Vérmintákból készített szérum. A fű- vagy fapollenallergiás betegeket bevonjuk, és az allergiás állapotot bőrszúrási tesztekkel és RAST-val (Radio-Allergo-Sorbent-test) határozzák meg. A tervezett mintanagyság csoportonként 15 beteg lesz. A mintákat a pollenszezonban és azon kívül is veszik. Az allergiás betegek tünetpontszámot töltenek ki, és mintákat vesznek, amikor a tünetek erősek (pollenszezonban) és eltűntek (pollenszezonon kívül). Egészséges kontrollok esetében a mintavétel időpontja összefügg az allergiás rhinitisben szenvedő betegek hasonló pollenexpozíciójával. Az orrnyálkahártyát folyadékkromatográfiára küldik tandem tömegspektrometriára proteomikai elemzés céljából, az orrhámsejtekből pedig RNS-t izolálnak és elküldik Microarray elemzésre. Integratív omika megközelítéssel a gén és a fehérje expressziója korrelál, és az orrnyálkahártya és a hám közötti átbeszélést elemezzük. A kulcsfontosságú gének vagy génklaszterek azonosítása további kulcsfontosságú fehérjék vagy fehérjecsoportok biomarkerek azonosításához vezet, amelyek új terápiás vagy diagnosztikai stratégiákat szolgálhatnak az allergiás rhinitisben. Az integratív ómikus megközelítés lecsökkenti a potenciális jelölteket, mivel a hangsúly az epiteliális génexpresszión és fehérjetermékeiken van, és kizárja azokat a fehérjéket, amelyek nagy mennyiségben fordulnak elő anélkül, hogy közvetlen összefüggést mutatnának az allergén expozícióval, pl. plazma váladékozáson keresztül. Ezenkívül a genomikai és proteomikai elemzés részletesebben megmagyarázhatja, hogy a nyálkahártya és a hám gátját hogyan befolyásolja az allergén expozíció. Az egészséges kontrollokkal való összehasonlítás és az évszak során bekövetkezett longitudinális változások még jobban rávilágítanak arra, hogy ezek az egyének hogyan reagálnak az allergénnel való érintkezésre, és hogyan vezethet ez az érzékenység megelőzéséhez.