Neoadjuváns kemoterápiában részesülő emlőrák valós idejű molekuláris elemzése (NEO-R)

A mellrák (BC) jelentős közegészségügyi probléma Franciaországban, az előfordulási gyakorisága növekszik, 2017-ben kb. 60 000 új esetet és 12 000 halálesetet becsültek. Annak ellenére, hogy az elmúlt években javult a túlélés, a kemoterápiával szembeni rezisztencia (CT) továbbra is kiemelkedő kihívást jelent a BC-ben: a molekuláris mechanizmusok továbbra is kevéssé ismertek, és a jelenlegi beavatkozások nem megfelelőek a kemorezisztencia céljára. A neoadjuváns chimioterápiát (NAC) ma már egyre gyakrabban alkalmazzák olyan nőknél, akiknél operálható, de agresszív BC, például hármas negatív (TN) vagy HER2+ tumor (Pusztai és mtsai, Lancet Oncol 2019). Legalább három előnnyel jár: i) a konzervatív műtétet lehetővé tevő tumorlebontás, ii) az adjuváns szisztémás terápia személyre szabása a kóros válaszreakciónak megfelelően, kapecitabin adagolásával TN betegekben (Masuda N. et al, N Engl J Med. 2017), ill. T-DM1 HER2+ betegekben (von Minckwitz G et al., N Engl J Med. 2019) patológiás teljes válasz (pCR) hiányában, és iii) forrásokat biztosít a kemorezisztencia molekuláris mechanizmusainak vizsgálatához. A jelenlegi standard NAC-kezelés az antraciklin és a taxán (és a HER2+ esetén a trastuzumab) egymás utáni összekapcsolásán alapul (Huober és von Minckwitz, Breast Care 2011), valamint a pCR elérésén, amelyet a reziduális invazív rák hiányaként határoztak meg a patológiás értékelés alapján. a műtéti minta (reszekált emlőminta és mintavételezett ipsilaterális nyirokcsomók (azaz ypT0/Tis ypN0 az AJCC staging rendszerben) jó prognózist jelent; a pCR nélküli betegeknél magas a relapszus kockázata (a TN és a 50%-a) HER2+ altípusok).

E betegek kezelési hatékonyságának javításában a fő szűk keresztmetszet a NAC-rezisztenciában hatékonyan részt vevő jelöltek azonosítása, a releváns és prediktív modellekben való validálásuk, valamint a helyettesítő markerekből történő kimutatásuk. Természetesen a pre-NAC mintákban eltérően reprezentált molekuláris eltérések keresése a rezisztens (nincs pCR) és az érzékeny (pCR) betegek között, vagy a páros poszt- és pre-NAC minták között feltárhat olyan jelölteket, amelyek részt vesznek a rezisztenciában ("veleszületett"). " és "megszerzett stabil"), de figyelmen kívül hagyja azokat a NAC során bekövetkező változásokat, amelyek reverzibilisek ("megszerzett reverzibilis"), és nem azonosíthatók a reszekált mintában (Echeverria GV, Sci Transl Med 2019), de csak elemzéssel azonosíthatók. sorozatos minták NAC-kezelése során, nehéz és traumás a klinikai gyakorlatban.

A jelen projekt célja a gyógyszerrezisztencia robusztus jelöltjei azonosítása NAC-ra jogosult BC-betegeknél. Eredetisége három különböző és egymást kiegészítő prospektív megközelítés kombinációjában rejlik: a NAC előtt és után vett biopsziák molekuláris analíziséből, az in vitro BC páciensből származó organoidokból (PDO), amelyek utánozzák a páciens NAC-re adott válaszát, és a keringő tumorsejtekből (CTC-kből). ) elkülönítve a NAC előtt/közben/után. Ez a projekt a legfejlettebb technológiákat (RNS- és DNS-szekvenálás kis mennyiségű biológiai anyagból, ritka részhalmazok/egysejt-izolálás és multi-omikai elemzések) kombinálja innovatív modellekkel (emlő OEM-en végzett gyógyszerteszt, reverzibilis gyógyszer-azonosítás, indukált változások) és a gyógyszerrezisztenciában szerepet játszó robusztus markerek ügyes kombinációja, amelyek mindegyikét megállapították és már a laboratóriumban is futtatják (vö. B. rész). Az utóbbi két pont csak a közelmúltban vált megvalósíthatóvá, köszönhetően a közelmúlt két technológiai fejlődésének: a mellrák OEM-tenyészeteinek (Sachs N, et al. Sejt. 2018) és a CTC-k izolálása és jellemzése (Gkountela S, et al. Sejt. 2019). Röviden, a vizsgálók sorozatos tumorbiopsziákat és vérmintákat fognak használni NAC-val kezelt BC-betegek csoportjától (1. ábra). A tumorbiopsziát a NAC előtt és után gyűjtik. Ezeket RNA-seq és targeted-NGS (exome) megközelítésekkel elemezzük, hogy megragadjuk a NAC-ból eredő különbségeket a különböző patológiás válaszreakciókkal rendelkező betegeknél. Ezeket a BC OEM-modellek előállítására is használják majd. A NAC-reakciót prediktív PDO-modelleket releváns modellként fogják használni a NAC-rezisztencia vizsgálatára. Pontosabban, a kutatók ezeket a modelleket arra fogják használni, hogy megvizsgálják az in vitro "szerzett reverzibilis" gyógyszer-indukált rezisztencia mechanizmusokat (azaz csak a gyógyszerexpozíció során észlelhetők). Vérmintákat vesznek a NAC előtt, alatt és után a CTC-k elemzéséhez, és célja a "szerzett reverzibilis" gyógyszer-indukált rezisztencia mechanizmusok ex vivo azonosítása, amelyeket a vizsgálók esetleg nem tudnak kimutatni csak az előtte/utána NAC mintákkal.

Tudomásunk szerint ez az első alkalom, hogy ezt a három innovatív megközelítést együtt alkalmazzák a NAC-t kapó betegek "rezisztenciájának" mélyreható vizsgálatára. Ennek a kombinációnak az erőssége abban rejlik, hogy előre jelez különböző – egymást nem kizáró – helyzeteket, amelyek előfordulhatnak ("veleszületett", "szerzett stabil" és/vagy "reverzibilis" gyógyszer-indukált rezisztencia). Mindegyik megközelítés olyan eredeti, pontos és specifikus információkat fog nyújtani, amelyek hozzájárulnak ahhoz, hogy teljesebb választ adjunk erre a kérdésre, mint a szakirodalomban jelenleg rendelkezésre álló szórt és hiányos adatok.