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遺伝子パネルにおけるバリアントの共分離 (COVAR)

2024年1月16日 更新者：Institut Curie

遺伝子カウンセリングにおける遺伝子の使用を検証するための遺伝子パネルにおけるヌクレオチド変異体の家族共同分離の研究

COVAR プロジェクトの目的は、遺伝子カウンセリングに使用するために、フランスのデータベースの最大 VUS を確実に分類することです。 この研究を通じて得られた結果は、場合によっては予防的手術を提案するために実施する患者とその家族の臨床管理に大きな影響を与えるでしょう。

調査の概要

状態

募集

条件

介入・治療

詳細な説明

当初、COVAR 研究は、遺伝性乳がんおよび/または卵巣がんで同定された 2 つの主要な遺伝子である BRCA1 (BReast Cancer 1) および BRCA2 (BReast Cancer 2) 遺伝子の未知の生物学的意義 (VUS) のバリアントを調査するために設計されました。 それ以来、研究は診断の進化と並行して進化し、2015年以来診断で調査されたPALB2（BRCA2のパートナーおよびローカライザー）遺伝子を最初に導入し、現在、家族の診断で行われたパネルのすべての遺伝子に研究を開放していますがんの遺伝的素因症候群。

フランス国立癌研究所の認定を受けたフランスの UMD (Universal Mutation Database)-BRCA1/2 は、1995 年以来、認可されたフランスの研究所によって実施された遺伝子検査の匿名の結果を収集し、同じ VUS を持つ家族のリアルタイムのビジョンを提供します。 2011 年 9 月、フランスの UMD-BRCA1/2 データベースには、1,300 の BRCA1 ファミリーの 706 の異なるバリアントと、2,101 の BRCA2 ファミリーの 1,089 の異なるバリアントが含まれていました。 2021 年 4 月、このデータベースには、BRCA1 の 1,651 の異なる VSU、BRCA2 の 3,015 の異なる VUS、PALB2 の 471 の異なる VUS、RAD51C の 68、RAD51D の 66 が含まれていました。

2017 年以降、がんの素因として報告されている新しい遺伝子が診断の場で調査されています。 このリストは常に進化しています (Moretta et al., 2018; Dhooge et al., 2020)。 これらの遺伝子のデータ収集は進行中であり、フランスの癌遺伝子ネットワークで特定されたすべての VUS と変異を収集する新しいデータベース (FrOG) がセットアップされました。 2020年末にコンソーシアム協定を締結しました。 このデータベースは、現在までに 40,000 を超えるフランス人家族の 12 の遺伝子と 11,912 の異なるバリアントを収集しています。

VUS を原因変異として分類するための重要な測定可能なパラメーターの 1 つは、疾患との共分離です。 フランスの家族の平均サイズは比較的小さく、1 つの家族に限定されたバリアント共分離の情報は重要ではありません。 ただし、いくつかの家族から得られた共分離の結果をまとめることで、特定のバリアントの因果関係の確率をより正確かつ完全に推定することができます。

COVAR 研究 (COsegregation VARiants) の目的は、データベース UMD-BRCA1/2 の VUS の共分離研究を組織して、これらの変異体の因果関係または非因果関係を判断することです。 臨床的関連性によってバリアントを整理するために、5 つのクラスのグリッドが使用されています。 クラス 3 および 4 の VUS は、遺伝カウンセリングに使用できないため、共分離研究の候補となります。

選択された家族では、発端症例は、VUS の存在をテストするために唾液のサンプルを提供するように家族 (罹患者および非罹患者) を招待します。 VUS が原因である確率は、ベイジアン モデルを使用して共分離データから計算されます。 結果は、D. Goldgar によって記述された多因子モデル、アミノ酸保存、バリアントの構造的影響、病原性変異との共起、家族歴、および腫瘍特性などのさまざまなパラメーターを統合するモデルに統合されます。

研究の種類

介入

入学 (推定)

3500

段階

  • 適用できない

連絡先と場所

このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。

研究連絡先

研究連絡先のバックアップ

研究場所

  • グアドループ
      • Pointe à Pitre、グアドループ、97110
        • 募集
        • CHU de Pointe à Pitre
        • コンタクト：
          • Marilyn LACKMY-PORT-LIS, MD
        • 主任研究者：
          • Marilyn LACKMY-PORT-LIS, MD
  • フランス
      • Amiens、フランス、80054
        • 募集
        • CHU Amiens - Hopital Nord
        • コンタクト：
          • Gilles MORIN, MD
        • 主任研究者：
          • Gilles MORIN, MD
      • Angers、フランス、49933
        • 募集
        • ICO - Centre Paul Papin
        • コンタクト：
          • Marie COUDERT, MD
        • 主任研究者：
          • Marie COUDERT, MD
      • Angoulême、フランス、16959
        • 募集
        • Centre Hospitalier d'Angoulème
        • コンタクト：
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • 主任研究者：
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Avignon、フランス、84918
        • 募集
        • Institut Sainte-Catherine
        • コンタクト：
          • Hélène DREYFUS, MD
        • 主任研究者：
          • Hélène DREYFUS, MD
      • Besancon、フランス、25030
        • 募集
        • CHU Besançon
        • コンタクト：
          • Marie-Agnès COLLONGE-RAME, MD
        • 主任研究者：
          • Marie-Agnès COLLONGE-RAME, MD
      • Bordeaux、フランス、33076
        • 募集
        • Institut Bergonie
        • コンタクト：
          • Virginie BUBIEN, MD
        • 主任研究者：
          • Virginie BUBIEN, MD
      • Bordeaux、フランス、33076
        • 募集
        • Groupe Hospitalier Pellegrin
        • コンタクト：
          • Julie TINAT, MD
        • 主任研究者：
          • Julie TINAT, MD
      • Bourges、フランス、18020
        • 募集
        • Centre Hospitalier Jacques Coeur
        • 主任研究者：
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
        • コンタクト：
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
      • Brest、フランス、29200
        • 募集
        • CHU Morvan de Brest
        • コンタクト：
          • Marc PLANES, MD
        • 主任研究者：
          • Marc PLANES, MD
      • Caen、フランス、14076
        • 募集
        • Centre Francois Baclesse
        • コンタクト：
          • Pascaline BERTHET, MD
        • 主任研究者：
          • Pascaline BERTHET, MD
      • Chambery、フランス、73011
        • 募集
        • Centre Hospitalier Hôtel Dieu
        • コンタクト：
          • Sandra FERRER, MD
        • 主任研究者：
          • Sandra FERRER, MD
      • Clermont-Ferrand、フランス、63011
        • 募集
        • Centre Jean Perrin
        • コンタクト：
          • Mathilde GAY-BELLILE, MD
        • 主任研究者：
          • Mathilde GAY-BELLILE, MD
      • Colmar、フランス、68024
        • まだ募集していません
        • Hôpital Civil de Colmar
        • コンタクト：
          • Jean-Marc LIMACHER
        • 主任研究者：
          • Jean-Marc LIMACHER, MD
      • Dijon、フランス、21079
        • 募集
        • CHU de Dijon
        • コンタクト：
          • Laurence FAIVRE-OLIVIER, MD
        • 主任研究者：
          • Laurence FAIVRE-OLIVIER, MD
      • Grenoble、フランス、38043
        • 募集
        • CHU de Grenoble
        • コンタクト：
          • Clémentine LEGRAND, MD
        • 主任研究者：
          • Clémentine LEGRAND, MD
      • La Rochelle、フランス、17019
        • 募集
        • Groupe Hospitalier La Rochelle-Ré-Aunis
        • コンタクト：
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • 主任研究者：
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Le Havre、フランス、76083
        • 募集
        • Hôpital Flaubert
        • コンタクト：
          • Elodie LACAZE, MD
        • 主任研究者：
          • Elodie LACAZE, MD
      • Lille、フランス、59000
        • 募集
        • Centre OSCAR LAMBRET
        • コンタクト：
          • Audrey MAILLIEZ, MD
        • 主任研究者：
          • Audrey MAILLIEZ, MD
      • Lille、フランス、59037
        • 募集
        • CHRU Lille
        • コンタクト：
          • Sophie LEJEUNE, MD
        • 主任研究者：
          • Sophie LEJEUNE, MD
      • Limoges、フランス、87042
        • 募集
        • Chu Dupuytren
        • コンタクト：
          • Laurence Venat-Bouvet, MD
        • 主任研究者：
          • Laurence VENAT-BOUVET, MD
      • Lyon、フランス、69373
        • 募集
        • Centre LEON BERARD
        • コンタクト：
          • Christine LASSET, MD
        • 主任研究者：
          • Christine LASSET, MD
      • Lyon、フランス、69229
        • 募集
        • Hospices Civils de Lyon
        • コンタクト：
          • Sophie GIRAUD, MD
        • 主任研究者：
          • Sophie GIRAUD, MD
      • Marseille、フランス、13009
        • 募集
        • Institut Paoli Calmettes
        • コンタクト：
          • Hagay SOBOL, PhD
        • 主任研究者：
          • Hagay SOBOL, PhD
      • Marseille、フランス、13385
        • 募集
        • CHU La Timone
        • コンタクト：
          • Hélène ZATTARA, MD
        • 主任研究者：
          • Hélène ZATTARA, MD
      • Montpellier、フランス、34295
        • 募集
        • CHU Arnaud de Villeneuve
        • コンタクト：
          • Isabelle COUPIER, MD
        • 主任研究者：
          • Isabelle COUPIER, MD
      • Nantes、フランス、44202
        • 募集
        • Centre Catherine de Sienne
        • 主任研究者：
          • Alain Lortholary, MD
        • コンタクト：
          • Alain LORTHOLARY, MD
      • Nice、フランス、06189
        • 募集
        • Centre Antoine Lacassagne
        • コンタクト：
          • Véronique MARI, MD
        • 主任研究者：
          • Véronique MARI, MD
      • Niort、フランス、79021
        • 募集
        • Centre Hospitalier Georges Renon
        • コンタクト：
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • 主任研究者：
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Nîmes、フランス、30029
        • 募集
        • CHRU Caremeau
        • コンタクト：
          • Jean CHIESA, MD
        • 主任研究者：
          • Jean CHIESA, MD
      • Orléans、フランス、45067
        • 募集
        • Hôpital de la Source
        • コンタクト：
          • E COTTEREAU, MD
        • 主任研究者：
          • E COTTEREAU, MD
      • Paris、フランス、75012
        • 募集
        • Hopital Saint-Antoine
        • コンタクト：
          • Antoine DARDENNE, MD
        • 主任研究者：
          • Antoine DARDENNE, MD
      • Paris、フランス、75475
        • 募集
        • Hôpital Saint-Louis
        • コンタクト：
          • Odile COHEN-HAGUENAUER, MD
        • 主任研究者：
          • Odile COHEN-HAGUENAUER, MD
      • Paris、フランス、75013
        • 募集
        • Groupe Hospitalier Pitie-Salpetriere
        • コンタクト：
          • Véronica CUSIN, MD
        • 主任研究者：
          • Véronica CUSIN, MD
      • Paris、フランス、75020
        • 募集
        • Hopital Tenon
        • コンタクト：
          • Clémence EVREVIN, MD
        • 主任研究者：
          • Clémence EVREVIN, MD
      • Paris、フランス、75908
        • 募集
        • HEGP
        • コンタクト：
          • Pierre-Laurent PUIG, Phd
        • 主任研究者：
          • Pierre-Laurent PUIG, Phd
      • Poitiers、フランス、86021
        • 募集
        • CHU La Milétrie
        • コンタクト：
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • 主任研究者：
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Reims、フランス、51092
        • 募集
        • CHU de Reims
        • コンタクト：
          • Anne DURLACH, MD
        • 主任研究者：
          • Anne DURLACH, MD
      • Reims、フランス、51100
        • 募集
        • Institut Jean Godinot
        • コンタクト：
          • Tan Dat NGUYEN, PHD
        • 主任研究者：
          • Tan Dat NGUYEN, PHD
      • Reims、フランス、51100
        • 募集
        • ICC Courlancy
        • コンタクト：
          • Fanny BRAYOTEL, MD
        • 主任研究者：
          • Fanny BRAYOTEL, MD
      • Rennes、フランス、35042
        • 募集
        • Centre Eugene Marquis
        • コンタクト：
          • Louise CRIVELLI, MD
        • 主任研究者：
          • Louise CRIVELLI, MD
      • Rouen、フランス、76031
        • 募集
        • CHU de Rouen
        • コンタクト：
          • Isabelle TENNEVET, MD
        • 主任研究者：
          • Isabelle TENNEVET, MD
      • Saint-Herblain、フランス、44804
        • 募集
        • ICO - Centre René Gauducheau
        • コンタクト：
          • Capucine DELNATTE, MD
        • 主任研究者：
          • Capucine DELNATTE, MD
      • Saint-Étienne、フランス、42055
        • 募集
        • CHU Saint Etienne
        • コンタクト：
          • Fabienne PRIEUR, MD
        • 主任研究者：
          • Fabienne PRIEUR, MD
      • Strasbourg、フランス、67033
        • 募集
        • Institut de Cancerologie Strasbourg Europe ICANS
        • コンタクト：
          • Philippe BOUDIER, MD
        • 主任研究者：
          • Philippe BOUDIER, MD
      • Strasbourg、フランス、67200
        • 募集
        • Hopital de Hautepierre - Hôpital Universitaire
        • コンタクト：
          • Christine MAUGARD, MD
        • 主任研究者：
          • Christine MAUGARD, MD
      • Toulouse、フランス、31059
        • 募集
        • Institut Claudius Regaud - IUCT - Oncopole
        • 主任研究者：
          • Laurence GLADIEFF, MD
        • コンタクト：
          • Laurence GLADIEFF, MD
      • Tours、フランス、37044
        • 募集
        • CHU Bretonneau
        • 主任研究者：
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
        • コンタクト：
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
      • Troyes、フランス、10003
        • 募集
        • CH Simone VEIL
        • コンタクト：
          • Charlotte CAILLE-BENIGNI, MD
        • 主任研究者：
          • Charlotte CAILLE-BENIGNI, MD
      • Valence、フランス、26953
        • 募集
        • Centre Hospitalier de Valence
        • コンタクト：
          • Marie-Noëlle BONNET-DUPEYRON, MD
        • 主任研究者：
          • Marie-Noëlle BONNET-DUPEYRON, MD
      • Vandoeuvre les Nancy、フランス、54511
        • 募集
        • CHU Nancy - Hôpital Brabois
        • コンタクト：
          • Jean-Marie RAVEL, MD
        • 主任研究者：
          • Jean-Marie RAVEL, MD
      • Vandoeuvre les Nancy、フランス、54511
        • 引きこもった
        • Centre Alexis Vautrin
      • Villejuif、フランス、94805
        • 募集
        • Gustave Roussy
        • コンタクト：
          • Olivier CARON, MD
        • 主任研究者：
          • Olivier CARON, MD
    • Haut De Seine
      • Saint-Cloud、Haut De Seine、フランス、92210
        • 募集
        • Institut Curie - Hôpital René Huguenin
        • コンタクト：
        • 主任研究者：
          • Emmanuelle FOURME, MD
    • Ile De France
      • Paris、Ile De France、フランス、75005
        • 募集
        • Institut Curie
        • コンタクト：
        • 主任研究者：
          • Dominique STOPPA-LYONNET, PU-PH
  • マルティニーク
      • Fort de France、マルティニーク、97261
        • 募集
        • CHU de Fort de France
        • コンタクト：
          • Odile BERA, MD
        • 主任研究者：
          • Odile BERA, MD
  • 再会
      • Saint-Pierre、再会、97410
        • 募集
        • CHU Sud Réunion Saint-Pierre
        • コンタクト：
          • Hanitra RANJATOELINA, MD
        • 主任研究者：
          • Hanitra RANJATOELINA, MD

参加基準

研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。

適格基準

就学可能な年齢

18年歳以上 (大人、高齢者)

健康ボランティアの受け入れ

いいえ

説明

包含基準:

索引ケース:

  • フランスのすべての研究所の遺伝子パネルからすべての遺伝子のバリエーションを特定する遺伝子グループおよびがんの全国データベース（GGC Unicancer）の家族に存在し、選択された遺伝子バリアントクラス3または4を保有する人。
  • 年齢は18歳以上。
  • 署名済みの通知同意書「インデックス ケース」

関連当事者:

  • がんの発端者の血縁者
  • 家族構成および発端者と比較した関連度に基づいて、調査員が保持する、発端者に関連するがんのない親族
  • 18歳以上
  • インフォームドコンセント「選択された親族」の情報と署名

除外基準:

  • 未成年者
  • 自由を剥奪された者または保護下にある者（学芸員を含む）。
  • 署名済みの書面によるインフォームド コンセントの不在

研究計画

このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。

研究はどのように設計されていますか？

デザインの詳細

  • 主な目的：診断
  • 割り当て：なし
  • 介入モデル：単一グループの割り当て
  • マスキング：なし（オープンラベル）

武器と介入

参加者グループ / アーム
介入・治療
他の：コバール
遺伝的：唾液キット
唾液サンプルは、選択された関連 (DNA) で作成されます。

この研究は何を測定していますか？

主要な結果の測定

結果測定
時間枠
病原性である確率の観点からバリアントの最大を分類するために、家族で選択された VUS の共分離分析を実行します。
時間枠：最長15年
最長15年

二次結果の測定

結果測定
時間枠
• UMD-BRCA1/2 データベースで確立された既存の分類に統合できる VUS を分類するための標準化された方法を提案し、主にクラス 4 (おそらく原因) とクラス 3 (重要性が不明) のバリアントに焦点を当てます。
時間枠：最長15年
最長15年
• 遺伝カウンセリングの指針として使用できる、リスクのある近親者の臨床管理に関する推奨事項が関連付けられている VUS (病原性および中立性の両方) の数を最大化します。
時間枠：最長15年
最長15年
拡張された家系に関する収集された表現型/遺伝子型データを使用して、おそらく中等度の癌リスクに関連するいくつかのクラス 3 および 4 VUS の浸透度を評価します。
時間枠：最長15年
最長15年

協力者と研究者

ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。

スポンサー

Institut Curie

捜査官

  • スタディチェア：Dominique STOPPA-LYONNET, PU-PH、Institut Curie
  • スタディディレクター：Sandrine CAPUTO, PhD、Institut Curie

出版物と役立つリンク

研究に関する情報を入力する責任者は、自発的にこれらの出版物を提供します。これらは、研究に関連するあらゆるものに関するものである可能性があります。

便利なリンク

研究記録日

これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。

主要日程の研究

研究開始 (実際)

2012年7月2日

一次修了 (推定)

2033年1月2日

研究の完了 (推定)

2034年1月2日

試験登録日

最初に提出

2012年5月14日

QC基準を満たした最初の提出物

2012年9月20日

最初の投稿 (推定)

2012年9月21日

学習記録の更新

投稿された最後の更新 (実際)

2024年1月17日

QC基準を満たした最後の更新が送信されました

2024年1月16日

最終確認日

2024年1月1日

詳しくは

本研究に関する用語

キーワード

追加の関連 MeSH 用語

その他の研究ID番号

  • IC 2011-11

この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。

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場所

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