Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

COsegregation av VARianter i panel av gener (COVAR)

16 januari 2024 uppdaterad av: Institut Curie

Studie av familjens CO-segregering av nukleotidvarianter i panelen av gener för att validera deras användning i genetisk rådgivning

Målet med COVAR-projektet är att på ett tillförlitligt sätt klassificera maximalt VUS i den franska databasen för att kunna använda dem för genetisk rådgivning. Resultaten som erhålls genom denna studie kommer att ha stor inverkan på den kliniska behandlingen av patienter och deras familjer som i vissa fall föreslår en profylaktisk operation.

Studieöversikt

Status

Rekrytering

Intervention / Behandling

Detaljerad beskrivning

Ursprungligen var COVAR-studien utformad för att utforska varianter av okänd biologisk betydelse (VUS) i generna BRCA1 (BReast Cancer 1) och BRCA2 (BReast Cancer 2), som är de två huvudgener som identifieras i ärftlig bröst- och/eller äggstockscancer. Sedan dess har studien utvecklats, parallellt med utvecklingen av diagnos, först introducerade PALB2-genen (Partner and localizer of BRCA2) som utforskats i diagnos sedan 2015 och nu öppnar studien för alla gener från panelerna som utförs vid diagnos i familjer med ett genetiskt predispositionssyndrom för cancer.

Den franska UMD (Universal Mutation Database)-BRCA1/2, ackrediterad av det franska National Cancer Institute, samlar in anonyma resultat av genetiska tester utförda av auktoriserade franska laboratorier sedan 1995, vilket ger en realtidsvision av familjer som bär samma VUS. I september 2011 omfattade den franska UMD-BRCA1/2-databasen 706 olika varianter i 1 300 BRCA1-familjer och 1 089 olika varianter i 2 101 BRCA2-familjer. I april 2021 innehöll denna databas 1 651 olika VSU för BRCA1, 3 015 olika VUS för BRCA2, 471 olika VUS för PALB2, 68 för RAD51C och 66 för RAD51D.

Sedan 2017 har nya gener utforskats i den diagnostiska miljön eftersom de har rapporterats som predisponerande faktorer för cancer. Denna lista utvecklas ständigt (Moretta et al., 2018; Dhooge et al., 2020). Datainsamling för dessa gener pågår och en ny databas (FrOG) som samlar alla VUS och mutationer som identifierats i det franska onkogenetiska nätverket har upprättats. Vi har upprättat ett konsortialavtal i slutet av 2020. Denna databas samlar hittills 12 gener och 11 912 olika varianter i mer än 40 000 franska familjer.

En av de viktigaste mätbara parametrarna för klassificering av VUS som kausala mutationer är deras samsegregering med sjukdomen. Den genomsnittliga storleken på franska familjer är relativt liten, informationen om variant samsegregation begränsad till en familj skulle inte vara signifikant. Sammanställningen av samsegregeringsresultat som erhållits från flera familjer kommer dock att göra det möjligt att erhålla mer exakta och fullständiga uppskattningar av sannolikheten för kausalitet för en given variant.

Målet med COVAR-studien (COsegregation VARiants) är att organisera samsegregationsstudier av VUS i databasen UMD-BRCA1/2, för att fastställa orsaks- eller icke-kausal karaktär av dessa varianter. För att organisera varianterna efter deras kliniska relevans har ett rutnät med 5 klasser använts: 1=neutral, 2=sannolikt neutral, 3=VUS, 4=sannolik orsak, 5=kausal. VUS för klass 3 och 4 kommer att vara kandidater till samsegregationsstudier eftersom de inte kan användas för genetisk rådgivning.

I de utvalda familjerna kommer indexfallet att inbjuda familjemedlemmarna (påverkade och opåverkade) att ge ett prov av salivvätska för att testa närvaron av VUS. Sannolikheten att en VUS är kausal kommer att beräknas från cosegregationsdata med hjälp av en Bayesiansk modell. Resultaten kommer att integreras i den multifaktoriella modellen som beskrivs av D. Goldgar, modell som integrerar olika parametrar som aminosyrakonservering, strukturell påverkan av varianten, samtidig förekomst med en patogen mutation, familjehistoria och tumöregenskaper.

Studietyp

Interventionell

Inskrivning (Beräknad)

3500

Fas

  • Inte tillämpbar

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studiekontakt

Studera Kontakt Backup

Studieorter

      • Amiens, Frankrike, 80054
        • Rekrytering
        • CHU Amiens - Hopital Nord
        • Kontakt:
          • Gilles MORIN, MD
        • Huvudutredare:
          • Gilles MORIN, MD
      • Angers, Frankrike, 49933
        • Rekrytering
        • ICO - Centre Paul Papin
        • Kontakt:
          • Marie COUDERT, MD
        • Huvudutredare:
          • Marie COUDERT, MD
      • Angoulême, Frankrike, 16959
        • Rekrytering
        • Centre Hospitalier d'Angoulème
        • Kontakt:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • Huvudutredare:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Avignon, Frankrike, 84918
        • Rekrytering
        • Institut Sainte-Catherine
        • Kontakt:
          • Hélène DREYFUS, MD
        • Huvudutredare:
          • Hélène DREYFUS, MD
      • Besancon, Frankrike, 25030
        • Rekrytering
        • CHU Besançon
        • Kontakt:
          • Marie-Agnès COLLONGE-RAME, MD
        • Huvudutredare:
          • Marie-Agnès COLLONGE-RAME, MD
      • Bordeaux, Frankrike, 33076
        • Rekrytering
        • Institut Bergonie
        • Kontakt:
          • Virginie BUBIEN, MD
        • Huvudutredare:
          • Virginie BUBIEN, MD
      • Bordeaux, Frankrike, 33076
        • Rekrytering
        • Groupe Hospitalier Pellegrin
        • Kontakt:
          • Julie TINAT, MD
        • Huvudutredare:
          • Julie TINAT, MD
      • Bourges, Frankrike, 18020
        • Rekrytering
        • Centre Hospitalier Jacques Coeur
        • Huvudutredare:
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
        • Kontakt:
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
      • Brest, Frankrike, 29200
        • Rekrytering
        • CHU Morvan de Brest
        • Kontakt:
          • Marc PLANES, MD
        • Huvudutredare:
          • Marc PLANES, MD
      • Caen, Frankrike, 14076
        • Rekrytering
        • Centre Francois Baclesse
        • Kontakt:
          • Pascaline BERTHET, MD
        • Huvudutredare:
          • Pascaline BERTHET, MD
      • Chambery, Frankrike, 73011
        • Rekrytering
        • Centre Hospitalier Hôtel Dieu
        • Kontakt:
          • Sandra FERRER, MD
        • Huvudutredare:
          • Sandra FERRER, MD
      • Clermont-Ferrand, Frankrike, 63011
        • Rekrytering
        • Centre Jean Perrin
        • Kontakt:
          • Mathilde GAY-BELLILE, MD
        • Huvudutredare:
          • Mathilde GAY-BELLILE, MD
      • Colmar, Frankrike, 68024
        • Har inte rekryterat ännu
        • Hôpital Civil de Colmar
        • Kontakt:
          • Jean-Marc LIMACHER
        • Huvudutredare:
          • Jean-Marc LIMACHER, MD
      • Dijon, Frankrike, 21079
        • Rekrytering
        • CHU de Dijon
        • Kontakt:
          • Laurence FAIVRE-OLIVIER, MD
        • Huvudutredare:
          • Laurence FAIVRE-OLIVIER, MD
      • Grenoble, Frankrike, 38043
        • Rekrytering
        • CHU de Grenoble
        • Kontakt:
          • Clémentine LEGRAND, MD
        • Huvudutredare:
          • Clémentine LEGRAND, MD
      • La Rochelle, Frankrike, 17019
        • Rekrytering
        • Groupe Hospitalier La Rochelle-Ré-Aunis
        • Kontakt:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • Huvudutredare:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Le Havre, Frankrike, 76083
        • Rekrytering
        • Hôpital Flaubert
        • Kontakt:
          • Elodie LACAZE, MD
        • Huvudutredare:
          • Elodie LACAZE, MD
      • Lille, Frankrike, 59000
        • Rekrytering
        • Centre OSCAR LAMBRET
        • Kontakt:
          • Audrey MAILLIEZ, MD
        • Huvudutredare:
          • Audrey MAILLIEZ, MD
      • Lille, Frankrike, 59037
        • Rekrytering
        • CHRU Lille
        • Kontakt:
          • Sophie LEJEUNE, MD
        • Huvudutredare:
          • Sophie LEJEUNE, MD
      • Limoges, Frankrike, 87042
        • Rekrytering
        • Chu Dupuytren
        • Kontakt:
          • Laurence Venat-Bouvet, MD
        • Huvudutredare:
          • Laurence VENAT-BOUVET, MD
      • Lyon, Frankrike, 69373
        • Rekrytering
        • Centre LEON BERARD
        • Kontakt:
          • Christine LASSET, MD
        • Huvudutredare:
          • Christine LASSET, MD
      • Lyon, Frankrike, 69229
        • Rekrytering
        • Hospices Civils de Lyon
        • Kontakt:
          • Sophie GIRAUD, MD
        • Huvudutredare:
          • Sophie GIRAUD, MD
      • Marseille, Frankrike, 13009
        • Rekrytering
        • Institut Paoli Calmettes
        • Kontakt:
          • Hagay SOBOL, PhD
        • Huvudutredare:
          • Hagay SOBOL, PhD
      • Marseille, Frankrike, 13385
        • Rekrytering
        • CHU La Timone
        • Kontakt:
          • Hélène ZATTARA, MD
        • Huvudutredare:
          • Hélène ZATTARA, MD
      • Montpellier, Frankrike, 34295
        • Rekrytering
        • CHU Arnaud de Villeneuve
        • Kontakt:
          • Isabelle COUPIER, MD
        • Huvudutredare:
          • Isabelle COUPIER, MD
      • Nantes, Frankrike, 44202
        • Rekrytering
        • Centre Catherine de Sienne
        • Huvudutredare:
          • Alain Lortholary, MD
        • Kontakt:
          • Alain LORTHOLARY, MD
      • Nice, Frankrike, 06189
        • Rekrytering
        • Centre Antoine Lacassagne
        • Kontakt:
          • Véronique MARI, MD
        • Huvudutredare:
          • Véronique MARI, MD
      • Niort, Frankrike, 79021
        • Rekrytering
        • Centre Hospitalier Georges Renon
        • Kontakt:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • Huvudutredare:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Nîmes, Frankrike, 30029
        • Rekrytering
        • CHRU Caremeau
        • Kontakt:
          • Jean CHIESA, MD
        • Huvudutredare:
          • Jean CHIESA, MD
      • Orléans, Frankrike, 45067
        • Rekrytering
        • Hôpital de la Source
        • Kontakt:
          • E COTTEREAU, MD
        • Huvudutredare:
          • E COTTEREAU, MD
      • Paris, Frankrike, 75012
        • Rekrytering
        • Hopital Saint-Antoine
        • Kontakt:
          • Antoine DARDENNE, MD
        • Huvudutredare:
          • Antoine DARDENNE, MD
      • Paris, Frankrike, 75475
        • Rekrytering
        • Hôpital Saint-Louis
        • Kontakt:
          • Odile COHEN-HAGUENAUER, MD
        • Huvudutredare:
          • Odile COHEN-HAGUENAUER, MD
      • Paris, Frankrike, 75013
        • Rekrytering
        • Groupe Hospitalier Pitie-Salpetriere
        • Kontakt:
          • Véronica CUSIN, MD
        • Huvudutredare:
          • Véronica CUSIN, MD
      • Paris, Frankrike, 75020
        • Rekrytering
        • Hopital Tenon
        • Kontakt:
          • Clémence EVREVIN, MD
        • Huvudutredare:
          • Clémence EVREVIN, MD
      • Paris, Frankrike, 75908
        • Rekrytering
        • HEGP
        • Kontakt:
          • Pierre-Laurent PUIG, Phd
        • Huvudutredare:
          • Pierre-Laurent PUIG, Phd
      • Poitiers, Frankrike, 86021
        • Rekrytering
        • CHU La Milétrie
        • Kontakt:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
        • Huvudutredare:
          • Stéphanie CHIEZE-VALERO, MD
      • Reims, Frankrike, 51092
        • Rekrytering
        • CHU de Reims
        • Kontakt:
          • Anne DURLACH, MD
        • Huvudutredare:
          • Anne DURLACH, MD
      • Reims, Frankrike, 51100
        • Rekrytering
        • Institut Jean Godinot
        • Kontakt:
          • Tan Dat NGUYEN, PHD
        • Huvudutredare:
          • Tan Dat NGUYEN, PHD
      • Reims, Frankrike, 51100
        • Rekrytering
        • ICC Courlancy
        • Kontakt:
          • Fanny BRAYOTEL, MD
        • Huvudutredare:
          • Fanny BRAYOTEL, MD
      • Rennes, Frankrike, 35042
        • Rekrytering
        • Centre Eugene Marquis
        • Kontakt:
          • Louise CRIVELLI, MD
        • Huvudutredare:
          • Louise CRIVELLI, MD
      • Rouen, Frankrike, 76031
        • Rekrytering
        • CHU de Rouen
        • Kontakt:
          • Isabelle TENNEVET, MD
        • Huvudutredare:
          • Isabelle TENNEVET, MD
      • Saint-Herblain, Frankrike, 44804
        • Rekrytering
        • ICO - Centre René Gauducheau
        • Kontakt:
          • Capucine DELNATTE, MD
        • Huvudutredare:
          • Capucine DELNATTE, MD
      • Saint-Étienne, Frankrike, 42055
        • Rekrytering
        • CHU Saint Etienne
        • Kontakt:
          • Fabienne PRIEUR, MD
        • Huvudutredare:
          • Fabienne PRIEUR, MD
      • Strasbourg, Frankrike, 67033
        • Rekrytering
        • Institut de Cancerologie Strasbourg Europe ICANS
        • Kontakt:
          • Philippe BOUDIER, MD
        • Huvudutredare:
          • Philippe BOUDIER, MD
      • Strasbourg, Frankrike, 67200
        • Rekrytering
        • Hopital de Hautepierre - Hôpital Universitaire
        • Kontakt:
          • Christine MAUGARD, MD
        • Huvudutredare:
          • Christine MAUGARD, MD
      • Toulouse, Frankrike, 31059
        • Rekrytering
        • Institut Claudius Regaud - IUCT - Oncopole
        • Huvudutredare:
          • Laurence GLADIEFF, MD
        • Kontakt:
          • Laurence GLADIEFF, MD
      • Tours, Frankrike, 37044
        • Rekrytering
        • CHU Bretonneau
        • Huvudutredare:
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
        • Kontakt:
          • Isabelle MORTEMOUSQUE, MD
      • Troyes, Frankrike, 10003
        • Rekrytering
        • CH Simone VEIL
        • Kontakt:
          • Charlotte CAILLE-BENIGNI, MD
        • Huvudutredare:
          • Charlotte CAILLE-BENIGNI, MD
      • Valence, Frankrike, 26953
        • Rekrytering
        • Centre Hospitalier de Valence
        • Kontakt:
          • Marie-Noëlle BONNET-DUPEYRON, MD
        • Huvudutredare:
          • Marie-Noëlle BONNET-DUPEYRON, MD
      • Vandoeuvre les Nancy, Frankrike, 54511
        • Rekrytering
        • CHU Nancy - Hôpital Brabois
        • Kontakt:
          • Jean-Marie RAVEL, MD
        • Huvudutredare:
          • Jean-Marie RAVEL, MD
      • Vandoeuvre les Nancy, Frankrike, 54511
        • Indragen
        • Centre Alexis Vautrin
      • Villejuif, Frankrike, 94805
        • Rekrytering
        • Gustave Roussy
        • Kontakt:
          • Olivier CARON, MD
        • Huvudutredare:
          • Olivier CARON, MD
    • Haut De Seine
      • Saint-Cloud, Haut De Seine, Frankrike, 92210
        • Rekrytering
        • Institut Curie - Hôpital René Huguenin
        • Kontakt:
        • Huvudutredare:
          • Emmanuelle FOURME, MD
    • Ile De France
      • Paris, Ile De France, Frankrike, 75005
        • Rekrytering
        • Institut Curie
        • Kontakt:
        • Huvudutredare:
          • Dominique STOPPA-LYONNET, PU-PH
      • Pointe à Pitre, Guadeloupe, 97110
        • Rekrytering
        • CHU de Pointe à Pitre
        • Kontakt:
          • Marilyn LACKMY-PORT-LIS, MD
        • Huvudutredare:
          • Marilyn LACKMY-PORT-LIS, MD
      • Fort de France, Martinique, 97261
        • Rekrytering
        • CHU de Fort de France
        • Kontakt:
          • Odile BERA, MD
        • Huvudutredare:
          • Odile BERA, MD
      • Saint-Pierre, Återförening, 97410
        • Rekrytering
        • CHU Sud Réunion Saint-Pierre
        • Kontakt:
          • Hanitra RANJATOELINA, MD
        • Huvudutredare:
          • Hanitra RANJATOELINA, MD

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

18 år och äldre (Vuxen, Äldre vuxen)

Tar emot friska volontärer

Nej

Beskrivning

Inklusionskriterier:

Indexfall:

  • En person som bär en genvariant klass 3 eller 4, närvarande och utvald i familjerna i den nationella databasen för genetisk grupp och cancer (GGC Unicancer) som identifierar variationerna av alla gener från panelen av gener i alla franska laboratorier.
  • Ålder ≥ 18 år.
  • Undertecknat skriftligt informerasamtycke "indexfall"

Närstående parter:

  • Alla släktingar till ett indexfall med cancer
  • Alla släktingar utan cancer relaterad till ett indexfall, behålls av utredare, baserat på familjestruktur och grad av släkt jämfört med indexfallet
  • Ålder ≥ 18 år
  • Information och underskrift av det informerade samtycket "utvalda anhöriga"

Exklusions kriterier:

  • Minderåriga
  • Personer som är frihetsberövade eller under förmynderskap (inklusive kuratorer).
  • Frånvaro av undertecknat skriftligt samtycke

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

  • Primärt syfte: Diagnostisk
  • Tilldelning: N/A
  • Interventionsmodell: Enskild gruppuppgift
  • Maskning: Ingen (Open Label)

Vapen och interventioner

Deltagargrupp / Arm
Intervention / Behandling
Övrig: Covar
Salivproverna kommer att göras av utvalt relaterat (DNA).

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Tidsram
Utför samsegregeringsanalysen av den valda VUS i familjerna för att klassificera det maximala antalet varianter i termer av deras sannolikhet att vara patogena
Tidsram: upp till 15 år
upp till 15 år

Sekundära resultatmått

Resultatmått
Tidsram
• Föreslå en standardiserad metod för att klassificera VUS som kan integreras i den redan befintliga klassificeringen som fastställts i UMD-BRCA1/2-databasen, med huvudfokus på varianter av klass 4 (troligen kausalt) och klass 3 (okänd betydelse).
Tidsram: upp till 15 år
upp till 15 år
• Maximera antalet VUS (både patogena och neutrala) med tillhörande rekommendationer för klinisk hantering av släktingar i riskzonen som kan användas för att vägleda genetisk rådgivning.
Tidsram: upp till 15 år
upp till 15 år
Bedöm penetreringen av flera klass 3 och 4 VUS troligen associerade med måttlig cancerrisk, med hjälp av insamlade fenotyp/genotypdata på utökade stamtavlor.
Tidsram: upp till 15 år
upp till 15 år

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Sponsor

Utredare

  • Studiestol: Dominique STOPPA-LYONNET, PU-PH, Institut Curie
  • Studierektor: Sandrine CAPUTO, PhD, Institut Curie

Publikationer och användbara länkar

Den som ansvarar för att lägga in information om studien tillhandahåller frivilligt dessa publikationer. Dessa kan handla om allt som har med studien att göra.

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

2 juli 2012

Primärt slutförande (Beräknad)

2 januari 2033

Avslutad studie (Beräknad)

2 januari 2034

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

14 maj 2012

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

20 september 2012

Första postat (Beräknad)

21 september 2012

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

17 januari 2024

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

16 januari 2024

Senast verifierad

1 januari 2024

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Kliniska prövningar på Genetisk predisposition

Kliniska prövningar på saliv kit

3
Prenumerera